●វេទិកា៖Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten និង BGI-DNB-T7
●របៀបតម្រៀប៖PE50, PE100, PE150, PE250
●ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពនៃបណ្ណាល័យមុននឹងដាក់តាមលំដាប់លំដោយ
●លំដាប់នៃការចែកចាយទិន្នន័យ និង QC៖ការផ្តល់របាយការណ៍ QC និងទិន្នន័យឆៅក្នុងទម្រង់ fastq បន្ទាប់ពី demultiplexing និងត្រង Q30 អាន។
●ភាពចម្រុះនៃសេវាកម្មលំដាប់លំដោយ៖អតិថិជនអាចជ្រើសរើសតាមលំដាប់លំដោយ ក្រឡាលំហូរ ឬចំនួនទិន្នន័យ។
●ភាពចម្រុះនៃវេទិកា៖បណ្ណាល័យ DNB អាចត្រូវបានផ្ទេរទៅវេទិកា Illumina
●បទពិសោធន៍យ៉ាងទូលំទូលាយនៅលើវេទិកាលំដាប់ Illumina៖ជាមួយនឹងគម្រោងបិទជិតរាប់ពាន់ជាមួយប្រភេទផ្សេងៗ។
●ការផ្តល់របាយការណ៍ QC លំដាប់លំដោយ៖ជាមួយនឹងរង្វាស់គុណភាព ភាពត្រឹមត្រូវនៃទិន្នន័យ និងការអនុវត្តរួមនៃគម្រោងលំដាប់លំដោយ។
●ដំណើរការលំដាប់លំដោយជាមួយនឹងពេលវេលាបង្វិលខ្លី។
●ការត្រួតពិនិត្យគុណភាពយ៉ាងម៉ត់ចត់៖ យើងអនុវត្តតម្រូវការ QC យ៉ាងតឹងរ៉ឹងដើម្បីធានានូវការផ្តល់លទ្ធផលដែលមានគុណភាពខ្ពស់ជាប់លាប់។
បរិមាណទិន្នន័យ (X) | ការប្រមូលផ្តុំ (qPCR/nM) | កម្រិតសំឡេង |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
វេទិកា | ការប្រមូលផ្តុំ (qPCR/nM) | កម្រិតសំឡេង |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
បន្ថែមពីលើការប្រមូលផ្តុំ និងបរិមាណសរុប គំរូកំពូលសមរម្យក៏ត្រូវបានទាមទារផងដែរ។
របាយការណ៍ស្តីពីគុណភាពនៃបណ្ណាល័យត្រូវបានផ្តល់ជូនមុនពេលដាក់តាមលំដាប់លំដោយ វាយតម្លៃបរិមាណបណ្ណាល័យ និងការបែងចែក។
តារាងទី 1. ស្ថិតិស្តីពីទិន្នន័យលំដាប់លំដោយ។
លេខសម្គាល់គំរូ | BMKID | អានឆៅ | ទិន្នន័យដើម (bp) | ការអានស្អាត (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | ២២.៨៧០.១២០ | 6,861,036,000 | ៩៦.៤៨ | 99.14 | ៩៤.៨៥ | ៣៦.៦៧ |
គ_០២ | BMK_០២ | ១៤.៧១៧.៨៦៧ | ៤.៤១៥.៣៦០.១០០ | 96.00 | ៩៨.៩៥ | ៩៣.៨៩ | ៣៧.០៨ |
រូបភាពទី 1. ការចែកចាយគុណភាពតាមអានក្នុងគំរូនីមួយៗ
រូបភាពទី 2. ការចែកចាយមាតិកាមូលដ្ឋាន
រូបភាពទី 3. ការចែកចាយមាតិកាអាននៅក្នុងទិន្នន័យលំដាប់