Кіші РНҚ секвенциясы - Иллюмин
Ерекше өзгешеліктері
● Кітапхананы дайындау алдында РНҚ өлшемін таңдау
● миРНҚ болжамына және олардың мақсаттарына негізделген биоинформатикалық талдау
Қызметтің артықшылықтары
●Толық биоинформатикалық талдау:Белгілі және жаңа miRNA-ларды сәйкестендіруге, miRNAs мақсаттарын сәйкестендіруге және сәйкес функционалдық аннотацияға және бірнеше дерекқорлармен (KEGG, GO) байытуға мүмкіндік береді.
●Қатаң сапаны бақылау: біз үлгіні және кітапхананы дайындаудан бастап реттілік пен биоинформатикаға дейінгі барлық кезеңдерде негізгі бақылау нүктелерін енгіземіз.Бұл мұқият бақылау тұрақты жоғары сапалы нәтижелерді жеткізуді қамтамасыз етеді.
●Сатудан кейінгі қолдау: Біздің міндеттеме жобаны аяқтағаннан кейін 3 айлық сатылымнан кейінгі қызмет көрсету мерзімін қамтиды.Осы уақыт ішінде біз нәтижелерге қатысты кез келген сұрауларды шешу үшін жобаны бақылауды, ақаулықтарды жою бойынша көмекті және сұрақ-жауап сессияларын ұсынамыз.
●Кең тәжірибе: әртүрлі зерттеу салаларындағы 100-ден астам түрді қамтитын бірнеше sRNA жобаларын сәтті аяқтау тәжірибесі бар біздің команда әр жобаға бай тәжірибе әкеледі.
Үлгіге қойылатын талаптар және жеткізу
| Кітапхана | Платформа | Ұсынылған деректер | Деректер QC |
| Өлшем таңдалды | Illumina SE50 | 10М-20М оқылады | Q30≥85% |
Үлгіге қойылатын талаптар:
Нуклеотидтер:
| Конс.(нг/мкл) | Мөлшері (мкг) | Тазалық | Тұтастық |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Гельде ақуыз немесе ДНҚ ластануы шектеулі немесе жоқ. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; шектелген немесе жоқ бастапқы биіктік |
● Өсімдіктер:
Тамыр, сабақ немесе жапырақша: 450 мг
Жапырақ немесе тұқым: 300 мг
Жемістер: 1,2 г
● Жануарлар:
Жүрек немесе ішек: 450 мг
Ішкі ағзалар немесе ми: 240 мг
Бұлшық ет: 600 мг
Сүйектер, шаш немесе тері: 1,5 г
● Буынаяқтылар:
Жәндіктер: 9 г
Шаян тәрізділер: 450 мг
● Тұтас қан: 2 түтік
● Ұяшықтар: 106 жасушалар
● Сарысу және плазма:6 мл
Ұсынылатын үлгіні жеткізу
Контейнер:
2 мл центрифуга түтігі (қаңылтыр фольга ұсынылмайды)
Үлгі таңбалау: Топ+қайталау, мысалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
жөнелту:
1. Құрғақ мұз: Үлгілерді қаптарға салып, құрғақ мұзға көму керек.
2.RNAstable түтіктер: РНҚ үлгілерін РНҚ тұрақтандыру түтігінде (мысалы, RNAstable®) кептіруге және бөлме температурасында жөнелтуге болады.
Қызметтің жұмыс ағыны
Эксперимент дизайны
Үлгіні жеткізу
РНҚ экстракциясы
Кітапхана құрылысы
Тізбектеу
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
Биоинформатика
миРНҚ идентификациясы: құрылымы мен тереңдігі
miRNA дифференциалды экспрессиясы – иерхиялық кластерлеу
Дифференциалды экспрессиялық миРНҚ нысанасының функционалды аннотациясы
BMKGene'sRNA секвенирлеу қызметтері арқылы жүргізілген зерттеу жетістіктерін таңдалған басылымдар жинағы арқылы зерттеңіз.
Чен, H. және т.б.(2023) 'Вирустық инфекциялар Panax notoginseng-те сапонин биосинтезі мен фотосинтезін тежейді', Өсімдіктердің физиологиясы және биохимиясы, 203, б.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Ли, H. және т.б.(2023) «FYVE домені бар FREE1 ақуызы бар өсімдік миРНҚ биогенезін басуға арналған микропроцессорлық компоненттермен байланысады», EMBO есептері, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Ю, Дж. және т.б.(2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p бірнеше эпидермальды өсу факторы тәрізді домендер 8 генін (megf8) бал арасындағы, Apis mellifera-ға бағыттау арқылы личинка қуыршақтарының дамуын бақылайды', Молекулалық ғылымдардың халықаралық журналы, 24(6), б. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Чжан, М. және т.б.(2018) 'МиРНҚ және ет сапасымен байланысты гендердің кешенді талдауы Gga-MiR-140-5p тауықтардағы бұлшықет ішіне майдың тұндырылуына әсер ететінін көрсетеді', жасушалық физиология және биохимия, 46(6), 2421–2433 бет.doi: 10.1159/000489649.
