-
BSA
Жаппай бөлектелген талдау платформасы бір қадамдық стандартты талдаудан және теңшелген параметр параметрі бар кеңейтілген талдаудан тұрады.BSA - фенотиппен байланысты генетикалық маркерлерді жылдам анықтау үшін қолданылатын әдіс.BSA-ның негізгі жұмыс процесі мыналарды қамтиды: 1. фенотиптері өте қарама-қайшы жеке тұлғалардың екі тобын таңдау;2. ДНҚ-ның екі негізгі бөлігін қалыптастыру үшін барлық даралардың ДНҚ, РНҚ немесе SLAF-секвін (биомаркер әзірлеген) біріктіру;3. анықтамалық геномға қарсы немесе олардың арасындағы дифференциалдық тізбектерді анықтау, 4. ED және SNP-индекс алгоритмі бойынша үміткер байланысты аймақтарды болжау;5. Үміткер аймақтардағы гендер бойынша функционалды талдау және байыту және т.б. Генетикалық маркерлік скринингті және праймер дизайнын қоса алғанда, деректерде анағұрлым жетілдірілген өндіру мүмкіндігі бар.
-
Ампликон (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) платформасы стандартталған негізгі талдау мен жекелендірілген талдауды қамтитын микробтардың әртүрлілігін жобалық талдаудағы көп жылдық тәжірибесімен әзірленген: негізгі талдау ағымдағы микробтық зерттеулердің негізгі талдау мазмұнын қамтиды, талдау мазмұны бай және жан-жақты, және талдау нәтижелері жобалық есептер түрінде ұсынылады;Жекелендірілген талдаудың мазмұны әртүрлі.Жеке талаптарды жүзеге асыру үшін негізгі талдау есебіне және зерттеу мақсатына сәйкес үлгілерді таңдауға және параметрлерді икемді түрде орнатуға болады.Windows операциялық жүйесі, қарапайым және жылдам.
-
Эволюциялық генетика
Эволюциялық генетика – SNPs, InDels, SVs және CNVs қоса алғанда, генетикалық вариацияларға негізделген берілген материалдардың эволюциялық ақпаратына жан-жақты интерпретация беруге арналған жинақталған секвенирлеу қызметі.Ол эволюциялық өзгерістерді және популяциялардың генетикалық ерекшеліктерін сипаттау үшін қажетті барлық іргелі талдауды қамтамасыз етеді, мысалы, популяция құрылымы, генетикалық әртүрлілік, филогениялық қатынастар және т.б. Ол сонымен қатар популяцияның тиімді мөлшерін, дивергенция уақытын бағалауға мүмкіндік беретін гендер ағыны бойынша зерттеулерді қамтиды.
-
Салыстырмалы геномика
Салыстырмалы геномика тура мағынасында әртүрлі түрлердің толық геномдық тізбектері мен құрылымдарын салыстыруды білдіреді.Бұл пән әртүрлі түрлер бойынша сақталған немесе сараланған тізбек құрылымдары мен элементтерін анықтау арқылы геномдық деңгейде түр эволюциясын, ген функциясын, гендік реттеу механизмін ашуға бағытталған.Типтік салыстырмалы геномиканы зерттеуге гендік отбасындағы талдаулар, эволюциялық даму, геномның толық қайталануы, селективті қысым және т.б.
-
Эволюциялық генетика
Популяциялық және эволюциялық генетикалық талдау платформасы BMK R&D тобында жылдар бойы жинақталған ауқымды тәжірибе негізінде құрылған.Бұл әсіресе биоинформатикада оқымайтын зерттеушілер үшін ыңғайлы құрал.Бұл платформа эволюциялық генетикаға қатысты негізгі талдауды, соның ішінде филогенетикалық ағаш құрылысын, байланыс тепе-теңдігін талдауды, генетикалық әртүрлілікті бағалауды, таңдамалы талдауды, туыстық талдауды, PCA, популяция құрылымын талдауды және т.б. мүмкіндік береді.
-
Hi-C негізіндегі геномдық ассамблея
Hi-C — жақындыққа негізделген өзара әрекеттесулерді және жоғары өткізу қабілеттілігін секвенирлеуді біріктіру арқылы хромосома конфигурациясын түсіруге арналған әдіс.Бұл өзара әрекеттесулердің қарқындылығы хромосомалардағы физикалық қашықтыққа теріс байланысты деп саналады.Сондықтан, Hi-C деректері геном жобасында жинақталған тізбектерді кластерлеуге, ретке келтіруге және бағдарлауға және оларды хромосомалардың белгілі бір санына бекітуге бағыт бере алады.Бұл технология популяцияға негізделген генетикалық карта болмаған кезде хромосома деңгейіндегі геномды жинақтау мүмкіндігін береді.Әрбір геномға Hi-C қажет.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы / DNBSEQ
-
Өсімдік/жануар De Novo геномының реттілігі
Де Новосеквенирлеу референттік геном болмаған кезде секвенирлеу технологияларын, мысалы, PacBio, Nanopore, NGS және т.б. пайдалана отырып, түрдің тұтас геномын құруды білдіреді.Үшінші буынды секвенирлеу технологияларының оқу ұзақтығын керемет жақсарту күрделі геномдарды құрастыруда жаңа мүмкіндіктер әкелді, мысалы, жоғары гетерозиготалы, қайталанатын аймақтардың жоғары қатынасы, полиплоидтар және т.б. Оқу ұзақтығы ондаған килобазалар деңгейінде, бұл реттілік оқулары мүмкіндік береді қайталанатын элементтерді, қалыптан тыс GC мазмұны бар аймақтарды және басқа да күрделі аймақтарды шешу.
Платформа: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq платформасы
-
Адамның толық экзома реттілігі
Толық экзомалық реттілік (WES) ауру тудыратын мутацияларды анықтау үшін үнемді секвенирлеу стратегиясы ретінде қарастырылады.Экзондар бүкіл геномның шамамен 1,7% ғана алатынына қарамастан, ол жалпы ақуыз функцияларының профилін тікелей көрсетеді.Адам геномында ауруға байланысты мутациялардың 85%-дан астамы белокты кодтау аймағында орын алатыны хабарланды.
BMKGENE әртүрлі зерттеу мақсаттарына жету үшін қол жетімді әртүрлі экзонды түсіру стратегиялары бар адамның толық және икемді экзомасын секвенирлеу қызметтерін ұсынады.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Ерекше локусты күшейтілген фрагмент тізбегі (SLAF-кезегі)
Жоғары өнімді генотиптеу, әсіресе кең ауқымды популяцияда, генетикалық ассоциацияны зерттеудегі іргелі қадам болып табылады, ол гендердің функционалды ашылуына, эволюциялық талдауға және т.б. үшін генетикалық негізді қамтамасыз етеді. Терең тұтас геномды қайта секвенирлеудің орнына, геномды секвенирлеуді азайту (RRGS) ) генетикалық маркерді ашудың ақылға қонымды тиімділігін сақтай отырып, бір үлгідегі реттілік құнын азайту үшін енгізілген.Бұған әдетте қысқартылған өкілдік кітапханасы (RRL) деп аталатын берілген өлшем ауқымында шектеу фрагментін шығару арқылы қол жеткізіледі.Спецификалық локусты күшейтілген фрагменттерді секвенирлеу (SLAF-Seq) – анықтамалық геномы бар немесе онсыз SNP генотипіне арналған өздігінен әзірленген стратегия.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы -
Illumina және BGI
Синтез бойынша реттілікке (SBS) негізделген Illumina секвенирлеу технологиясы - дүние жүзіндегі реттілік деректерінің 90%-дан астамын жасауға жауап беретін жаһандық қабылданған NGS инновациясы.SBS принципі флуоресцентті таңбаланған қайтымды терминаторларды бейнелеуді қамтиды, өйткені әрбір dNTP қосылады, содан кейін келесі негізді қосуға мүмкіндік беру үшін кесіледі.Әрбір реттілік циклінде барлық төрт қайтымды терминаторға байланысты dNTP бар болғандықтан, табиғи бәсекелестік біріктіру ауытқуын азайтады.Бұл әмбебап технология геномдық қосымшалардың ауқымын қамтамасыз ететін бір рет оқылатын және жұптастырылған кітапханаларды қолдайды.Illumina секвенирлеуінің жоғары өнімділік мүмкіндіктері мен дәлдігі оны геномика зерттеулеріндегі ірге тасы ретінде орналастырады, ғалымдарға геномдардың күрделілігін теңдесі жоқ егжей-тегжейлі және тиімділікпен ашуға мүмкіндік береді.
BGI әзірлеген DNBSEQ - кезектілік шығындарын одан әрі төмендетуге және өткізу қабілеттілігін арттыруға қол жеткізген тағы бір инновациялық NGS технологиясы.DNBSEQ кітапханаларын дайындау ДНҚ фрагментациясын, ssDNA дайындауды және ДНҚ наношарларын (DNB) алу үшін айналмалы шеңберді күшейтуді қамтиды.Содан кейін олар қатты бетке жүктеледі және кейіннен комбинаторлық зонд-зәкір синтезі (cPAS) арқылы тізбектеледі.
Біздің алдын ала жасалған кітапханалық секвенирлеу қызметіміз тұтынушыларға әртүрлі көздерден (мРНҚ, тұтас геном, ампликон және т.б.) секвенирлеу кітапханаларын дайындауға көмектеседі.Кейіннен бұл кітапханаларды Illumina немесе BGI платформаларында сапаны бақылау және реттілік үшін біздің реттілік орталықтарымызға жіберуге болады.
