-
Метатранскриптомды реттілік
Метатранскриптомды секвенирлеу микробтардың (эукариоттардың да, прокариоттардың да) табиғи ортадағы (яғни, топырақ, су, теңіз, нәжіс және ішек.) ген экспрессиясын анықтайды. Атап айтқанда, бұл қызметтер күрделі микробтық қауымдастықтың гендік экспрессия профилін алуға, таксономиялық талдауға мүмкіндік береді. түрлердің, әр түрлі экспрессияланған гендердің функционалдық байыту талдауы және т.б.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Саңырауқұлақ геномы
Biomarker Technologies нақты зерттеу мақсатына байланысты геномды зерттеуді, жұқа геномды және саңырауқұлақтардың толық геномын қамтамасыз етеді.Геномды секвенирлеуге, құрастыруға және функционалдық аннотацияға геномдардың жоғары деңгейіне қол жеткізу үшін Келесі ұрпақ секвенциясы + Үшінші ұрпақ секвенциясын біріктіру арқылы қол жеткізуге болады.Hi-C технологиясын хромосома деңгейінде геномды жинақтауды жеңілдету үшін де қолдануға болады.
Платформа:PacBio жалғасы II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq платформасы
-
Құралдар жинағы
BMKCloud – геномдық бағдарламаларға арналған бір терезе шешімін ұсынатын жетекші биоақпараттық платформа, оған медициналық, ауылшаруашылық, экологиялық және т.б. сияқты әртүрлі саладағы зерттеушілер үлкен сенім артады. BMKCloud интеграцияланған, сенімді және тиімді қызметтерді, соның ішінде биоинформатикалық талдау платформалары мен құралдарын ұсынуға ұмтылады. , есептеу ресурстары, қоғамдық дерекқор, биоинформатикалық онлайн курстар және т.б. BMKCloud-та гендік аннотация, эволюциялық генетикалық құралдар, ncRNA, деректер сапасын бақылау, құрастыру, теңестіру, деректерді алу, мутациялар, статистика, фигура генераторы, реттілік сияқты жиі қолданылатын әртүрлі биоинформатикалық құралдар бар. талдау және т.б.
-
Бактериялардың толық геномы
Biomarker Technologies нөлдік аралығы бар бактериялардың толық геномын құру бойынша секвенирлеу қызметін ұсынады.Бактериялардың негізгі жұмыс ағымы толық геном құрылысына үшінші ұрпақ секвенциясы, құрастыру, функционалдық аннотация және нақты зерттеу мақсаттарына жауап беретін кеңейтілген биоинформатикалық талдау кіреді.Бактериялардың геномының жан-жақты профилі олардың биологиялық процестерінің негізінде жатқан іргелі механизмдерді ашуға мүмкіндік береді, бұл сонымен қатар жоғары эукариоттық түрлердегі геномдық зерттеулер үшін құнды анықтама бола алады.
Платформа:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq платформасы
PacBio жалғасы II
-
шағын РНҚ
Кішкентай РНҚ - миРНҚ, сиРНҚ және пиРНҚ қоса алғанда, орташа ұзындығы 18-30 нт болатын қысқа кодталмаған РНҚ түрі.Бұл шағын РНҚ-лар мРНҚ ыдырауы, трансляцияның тежелуі, гетерохроматиннің түзілуі және т.б. сияқты әртүрлі биологиялық процестерге қатысатыны туралы хабарланған. SmallRNA секвенирлеу талдауы жануарлар/өсімдіктердің дамуы, ауру, вирус және т.б. зерттеулерде кеңінен қолданылды. Шағын РНҚ секвенирлеуді талдау платформасы стандартты талдаудан және кеңейтілген деректерді өңдеуден тұрады.RNA-seq деректері негізінде стандартты талдау миРНҚ сәйкестендіру және болжау, miRNA мақсатты генін болжау, аннотация және экспрессиялық талдауға қол жеткізе алады.Жетілдірілген талдау теңшелген miRNA іздеу және алу, Венн диаграммасын құру, miRNA және мақсатты ген желісін құруға мүмкіндік береді.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS – биомаркер технологияларындағы бай тәжірибе негізінде жасалған геномды қайта секвенирлеуді талдаудың тұтас платформасы.Бұл пайдалану оңай платформа Illumina платформасынан және BGI секвенирлеу платформасынан жасалған ДНҚ секвенирлеу деректеріне сәйкес келетін бірнеше негізгі параметрді орнату арқылы біріктірілген талдау жұмыс процесін жылдам жіберуге мүмкіндік береді.Бұл платформа өте шектеулі уақыт ішінде жоғары тиімді деректерді талдау мүмкіндігін беретін жоғары өнімді есептеу серверінде орналастырылған.Дербес деректерді өңдеу стандартты талдау негізінде қол жетімді, соның ішінде мутацияланған ген сұрауы, ПТР праймер дизайны және т.б.
-
мРНҚ(анықтама)
Транскриптом – геномдық генетикалық ақпарат пен биологиялық функцияның протеомы арасындағы байланыс.Транскрипциялық деңгейдің реттелуі – организмдердің ең маңызды және ең көп зерттелген реттеу режимі.Транскриптомды секвенирлеу транскриптомды уақыттың кез келген нүктесінде немесе кез келген жағдайда, бір нуклеотидке дәл келетін ажыратымдылықпен тізбектей алады. Ол геннің транскрипциясының деңгейін динамикалық түрде көрсете алады, сирек және қалыпты транскрипттерді бір уақытта анықтап, сандық түрде анықтай алады және құрылымдық ақпаратты бере алады. арнайы транскрипттердің үлгісі.
Қазіргі уақытта транскриптомды секвенирлеу технологиясы агрономияда, медицинада және басқа зерттеу салаларында, соның ішінде жануарлар мен өсімдіктердің дамуын реттеу, қоршаған ортаға бейімделу, иммундық өзара әрекеттесу, гендердің локализациясы, түрлердің генетикалық эволюциясы және ісік пен генетикалық ауруларды анықтауда кеңінен қолданылады.
-
Метагеномика (NGS)
Бұл талдау платформасы көп жылдық тәжірибе негізінде шолақ мылтық метагеномдық деректерді талдауға арналған.Ол деректерді өңдеу, түр деңгейіндегі зерттеулер, гендік функция деңгейін зерттеу, метагеномды байланыстыру және т.б. қоса алғанда, әр түрлі қажетті метагеномикалық талдауларды қамтитын біріктірілген жұмыс процесінен тұрады. Бұған қоса, ген мен түр сұрауын қоса, стандартты талдау жұмыс процесінде теңшелген деректерді өңдеу құралдары қол жетімді. , параметрді орнату, жекелендірілген фигураны құру және т.б.
-
LncRNA
Ұзын кодталмаған РНҚ (lncRNA) – белоктарды кодтай алмайтын ұзындығы 200 нт-тен асатын транскрипттердің бір түрі.Жинақталған дәлелдер lncRNA-лардың көпшілігінің функционалды болуы мүмкін екенін көрсетеді.Жоғары өнімді секвенирлеу технологиялары мен биоинформатикалық талдау құралдары бізге lncRNA тізбегін және ақпаратты орналастыруды тиімдірек ашуға мүмкіндік береді және маңызды реттеуші функциялары бар lncRNA-ларды табуға жетелейді.BMKCloud жылдам, сенімді және икемді lncRNA талдауына қол жеткізу үшін тұтынушыларымызға lncRNA реттілігін талдау платформасын ұсынуды мақтан тұтады.
-
GWAS
Геномдық қауымдастықты зерттеу (GWAS) нақты белгілермен (фенотип) байланысты генетикалық нұсқаларды (генотип) анықтауға бағытталған.GWA зерттеулері генетикалық маркерлердің көптеген жеке тұлғалардың бүкіл геномын кесіп өтуін зерттейді және популяция деңгейінде статистикалық талдау арқылы генотип-фенотиптік бірлестіктерді болжайды.Тұтас геномды қайта секвенирлеу барлық генетикалық нұсқаларды ашуы мүмкін.Фенотиптік деректермен байланыстыра отырып, GWAS фенотипке қатысты SNPs, QTL және кандидат гендерін анықтау үшін өңделуі мүмкін, бұл қазіргі заманғы жануарлар/өсімдіктердің асыл тұқымдылығын қуаттайды.SLAF - геномға таралған SNP маркерлерін ашатын геномды секвенирлеудің өздігінен әзірленген оңайлатылған стратегиясы.Бұл SNP молекулалық-генетикалық маркерлер ретінде мақсатты белгілермен ассоциацияны зерттеу үшін өңделуі мүмкін.Бұл генетикалық вариациялармен байланысты күрделі белгілерді анықтаудағы үнемді стратегия.
-
Нанопора Толық ұзындықтағы транскриптомия
Организмдердегі күрделі және ауыспалы альтернативті изоформалар гендердің экспрессиясын және ақуыздың әртүрлілігін реттеудің маңызды генетикалық механизмдері болып табылады.Транскрипт құрылымдарын дәл анықтау ген экспрессиясының реттелу заңдылықтарын терең зерттеудің негізі болып табылады.Nanopore секвенирлеу платформасы транскриптомиялық зерттеуді изоформа деңгейіне сәтті жеткізді.Бұл талдау платформасы ген деңгейінде де, транскрипттер деңгейінде де сапалы және сандық талдауларға қол жеткізетін анықтамалық геном негізінде Nanopore платформасында жасалған RNA-Seq деректерін талдауға арналған.
-
цирк-РНҚ
Циркулярлы РНҚ (циркРНҚ) – кодталмаған РНҚ түрі, олар жақында дамуға, қоршаған ортаға төзімділікке және т.б. қатысатын реттеуші желілерде маңызды рөл атқаратыны анықталды. Сызықтық РНҚ молекулаларынан, мысалы, mRNA, lncRNA, 3′ және 5′ циркРНҚ-ның ұштары бір-бірімен қосылып, дөңгелек құрылымды құрайды, бұл оларды экзонуклеазаның қорытылуынан сақтайды және сызықтық РНҚ-ның көпшілігіне қарағанда тұрақты.ЦиркРНҚ-ның ген экспрессиясын реттеуде әртүрлі қызметтері бар екені анықталды.CircRNA миРНҚ жөке деп аталатын миРНҚ-ны бәсекеге қабілетті байланыстыратын ceRNA қызметін атқара алады.CircRNA секвенирленген талдау платформасы circRNA құрылымы мен экспрессиясын талдауға, мақсатты болжауға және РНҚ молекулаларының басқа түрлерімен бірлескен талдауға мүмкіндік береді.
