Pacific Biosciences (PacBio) изоформды реттілік деректерін кіріс ретінде ала отырып, бұл қолданба толық ұзындықтағы транскрипт тізбегін (құрастырусыз) анықтай алады.Анықтамалық геномға қарсы толық ұзындықтағы тізбектерді салыстыру арқылы транскрипттерді белгілі гендер, транскрипттер, кодтау аймақтары және т.б. арқылы оңтайландыруға болады. Бұл жағдайда баламалы сплайсинг және т.б. сияқты мРНҚ құрылымдарын дәлірек анықтауға қол жеткізуге болады.NGS транскриптомды секвенирлеу деректерімен бірлескен талдау транскрипт деңгейінде өрнекте неғұрлым толық аннотацияға және дәлірек сандық анықтауға мүмкіндік береді, бұл негізінен төменгі ағындық дифференциалды өрнек пен функционалды талдауға пайда әкеледі.