Нанопора негізіндегі толық ұзындықтағы транскриптомды реттілік
Нанопора секвенциясы басқа секвенирлеу платформаларынан ерекшеленеді, өйткені нуклеотидтер ДНҚ синтезінсіз тікелей оқылады және ондаған килобазаларда ұзақ оқулар жасайды.Бұл толық метражды транскрипттерді тікелей оқуға және транскриптомиялық зерттеулердегі қиындықтарды шешуге мүмкіндік береді.
√ Төмен реттілікке тән ауытқу
√ Ген құрылымын зерттеу үшін cDNA толық ұзындықтағы оқу
√ Транскрипттердің бірдей санын қамту үшін аз деректер қажет
√ Бір генге бірнеше изоформаларды анықтау
√ Изоформа деңгейіндегі өрнектерді сандық анықтау
Типтік биоинформатика құбыры
Биомаркер технологиялары бар соңғы сәтті жағдайлар
1. Толық ұзындықтағы транскриптомдардың салыстырмалы талдауы Gnetum luofuense діңінің даму динамикасын анықтайды.
Журнал: Генетикадағы шекаралар
Жарияланды: 2021 жылдың наурызы
Түйін сөздер: MinION |Альтернативті сплайсинг |APA |lncRNA |Дифференциалды түрде берілген транскрипттер
Толық мәтінді оқу
2. Түр аралық гетерогранспланттарда өркеннен тамырға дейін ұсақ РНҚ-ның бір бағытты қозғалысы
Журнал: Табиғат өсімдіктері
Жарияланды: 2021 жылдың қаңтары
Түйін сөздер: Нанопора |Illumina |толық ұзындықтағы жылжымалы мРНҚ анықтау
3. Спаржа тамырларының толық ұзындықтағы транскриптомдық талдауы арбускулярлы микориза саңырауқұлақтарымен индукцияланған тұзға төзімділіктің молекулалық механизмін ашады.
Журнал: Environmental and Experimental Botany
Жарияланды: 2021 жылдың қаңтары
Түйін сөздер: MinION |Дифференциалды транскрипттер |Транскрипция факторлары |Альтернативті қосу
4. Қуаңшылық күйзелісіне жауап ретінде раушан (Rosa chinensis) тамырлары мен жапырақтарының физиологиялық сипаттамалық өзгерістері және толық ұзындықтағы транскриптомы
Журнал: Өсімдіктер және жасуша физиологиясы
Жарияланды: 2020 жылдың қазаны
Түйін сөздер: PromethION |Дифференциалды транскрипттер |Функционалды болжау |Біріктірілген изоформалар |TF және lncRNA
5. PacBio және Arabidopsis транскриптомының нанопора негізіндегі РНҚ секвенциясын талдау және жан-жақты салыстыру
Журнал: Өсімдік әдісі
Жарияланды: 2020 жылдың сәуірі
Түйін сөздер: GridION |PromethION |PacBio жалғасы |Illumina NovaSeq |Геномды туралау |Транскриптті сәйкестендіру |Альтернативті сплайсинг |SSR |LncRNA |Изоформды мөлшерлеу
Жаңалықтар мен маңызды оқиғалар соңғы сәтті жағдайларды Biomarker Technologies-пен бөлісуге, жаңа ғылыми жетістіктерді, сондай-ақ зерттеу барысында қолданылған көрнекті әдістерді түсіруге бағытталған.
Жіберу уақыты: 08 қаңтар 2022 ж