BMKCloud Log in
条形banner-03

Жаңалықтар

МИКРОБТЫ

Қауіпті материалдар журналы

Бактериялардың үйлесімділігі және биокөмірмен иммобилизациясы тебуконазолдың ыдырауын, топырақ микробиомасының құрамы мен жұмысын жақсартты.

Толық ұзындықтағы 16S ампликонды секвенирлеу |PacBio HiFi |Альфа әртүрлілігі |Бета әртүрлілігі

Бұл зерттеуде PacBio арқылы толық ұзындықтағы 16S ампликонды секвенирлеу және биоинформатикалық талдау Biomarker Technologies ұсынған.

Маңызды жерлер

Биокөмірмен иммобилизацияланған тебуконазолды ыдырататын бактериялар Alcaligenes faecalis WZ-2 еркін ыдырататын WZ-2 штаммымен салыстырғанда биологиялық ыдыраудың тиімділігі мен тебуконазолмен ластанған топыраққа әсері бойынша зерттелді.

1. Биокөмірмен иммобилизацияланған WZ-2 топырақтағы тебуконазолдың жартылай шығарылу кезеңін 18,7 күннен 13,3 күнге дейін қысқарту арқылы бос WZ-2-мен салыстырғанда тебуконазолдың тиімді деградациясын көрсетті.

2. Биокөмірмен иммобилизацияланған WZ-2 топырақтың жергілікті микробтық ферменттерінің белсенділігін қалпына келтіре алды, соның ішінде уреаза, дегидрогеназа және инвертаза және т.б.

3. Толық ұзындықтағы 16S реттілік арқылы анықталған биокөмірмен иммобилизацияланған WZ-2 өңделген топырақтағы микробтық профиль бұл жүйенің тебуконазолмен ластану кезіндегі бактериялар қауымдастығының құрылымын жақсарту арқылы топырақ денсаулығын қалпына келтіре алатынын қатты қуаттады.

Эксперимент (тізбегімен байланысты)

Топтастыру: КҚ: Табиғи топырақ;Т: Тебуконазол қосылған топырақ;S: Тебуконазол құрамында WZ-2 бос штаммы бар топырақ;BC: Тебуконазол құрамында биокөмір бар топырақ;BCS: Тебуконазолдың құрамында WZ-2 иммобилизацияланған биокөмір бар топырақ бар.

Сынама алу: 16S рДНҚ праймерлерімен күшейтілген жалпы топырақ ДНҚ экстракциясы
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) және 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),толық ұзындықтағы 16S рДНҚ-ны қайталайды

Тізбектеу платформасы: PacBio RS II

Тізбектеу стратегиясы: CCS HIFI оқиды

Деректерді талдау:BMKCloudБиоинформатикалық платформа алтын балықты балық физиологиясы мен эволюциясы үшін тамаша генетикалық модель жүйесіне айналдырады.

Нәтиже

Топырақтың микробтық қауымдастық құрылымы 16S рДНҚ секвенциясы арқылы анықталды.Әр жүйедегі түрлердің әртүрлілігін анықтау үшін OTU байлығы мен альфа әртүрлілік индексі, соның ішінде Чао1, Эйс, Шеннон және Симпсон индекстері бағаланды.60 күндік инкубациядан кейін барлық индекстер ұқсас тенденцияны көрсетті, яғни тебуконазол топырақтағы түрлердің байлығы мен әртүрлілігінің төмендеуіне әкелуі мүмкін.Дегенмен, WZ-2 штаммын қосу арқылы топырақ бактерияларының қауымдастығы байлық пен әртүрлілік тұрғысынан ішінара қалпына келтірілді.BC, BCS және CK арасында шектеулі айырмашылық байқалды, бұл биокөмір мен биокөмірмен иммобилизацияланған WZ-2 топырақтың биологиялық саулығын тиімді қалпына келтіре алатынын көрсетеді.

1-2-1024x218

Бұл зерттеуде топтар арасындағы бета әртүрлілігін көрсету үшін арифметикалық ортасы бар салмақталмаған жұп-топ әдісі (UPGMA) қолданылды.Келесі суретте көрсетілгендей, BC, BSC және CK T және S топтарымен салыстырғанда микроб құрамының ұқсас үлгісін бөлісті, бұл әрі қарай тебуконазолмен ластанған топырақ биоремедиациясына биокөмірді енгізу топырақтағы микробтық қауымдастықты қалпына келтіруді айтарлықтай жеңілдететінін көрсетті.

2-1-1024x472

Сурет.Түрлі емдеу кезінде филум деңгейінде бактериялық қауымдастықтың UPGMA кластері

Анықтама

Sun, Tong және т.б.«Бактериялардың үйлесімділігі және биокөмірмен иммобилизациясы тебуконазолдың ыдырауын, топырақ микробиомасының құрамы мен жұмысын жақсартты».Қауіпті материалдар журналы398 (2020 ж.): 122941.

Толық мәтінді оқыңыз

Жаңалықтар мен маңызды оқиғалар соңғы сәтті жағдайларды Biomarker Technologies-пен бөлісуге, жаңа ғылыми жетістіктерді, сондай-ақ зерттеу барысында қолданылған көрнекті әдістерді түсіруге бағытталған.


Жіберу уақыты: 08 қаңтар 2022 ж

Хабарламаңызды бізге жіберіңіз: