● Мақсатты протеинді кодтау аймағы: ақуызды кодтау аймағын алу және секвенирлеу арқылы hWES ақуыз құрылымына қатысты нұсқаларды ашу үшін пайдаланылады;
● Жоғары дәлдік: жоғары реттілік тереңдігімен hWES жалпы нұсқаларды және жиілігі 1%-дан төмен сирек нұсқаларды анықтауды жеңілдетеді;
● үнемді: hWES адам геномының 1% адам ауруының шамамен 85% мутациясын береді;
● Q30>85% кепілдік берілген бүкіл процесті қамтитын бес қатаң QC процедурасы.
Платформа
| Кітапхана
| Экзонды түсіру стратегиясы
| Тізбектеу стратегиясын ұсыныңыз
|
Illumina NovaSeq платформасы
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Гб 10 Гб |
Үлгі түрі
| Сома(Qubit®)
| Көлемі
| Шоғырлану
| Тазалық(NanoDrop™) |
Геномдық ДНҚ
| ≥ 300 нг | ≥ 15 мкл | ≥ 20 нг/мкл | OD260/280=1,8-2,0 деградация, ластану жоқ
|
Мендельдік бұзылулар/сирек кездесетін аурулар үшін: 50 × жоғары секвенирлеудің тиімді тереңдігі
Ісік үлгілері үшін: тиімді реттілік тереңдігі 100× жоғары
1.Тегістеу статистикасы
1-кесте Карта нәтижесінің статистикасы
2-кесте Экзомды түсіру статистикасы
2. Вариацияны анықтау
1-сурет SNV және InDel статистикасы
3. Жетілдірілген талдау
2-сурет Геном бойынша зиянды SNV және InDel бойынша Circos сызбасы
Кесте 3 Ауру тудыратын гендердің скринингі