Геномдық қауымдастықты зерттеу (GWAS) нақты белгілермен (фенотип) байланысты генетикалық нұсқаларды (генотип) анықтауға бағытталған.GWA зерттеулері генетикалық маркерлердің көптеген жеке тұлғалардың бүкіл геномын кесіп өтуін зерттейді және популяция деңгейінде статистикалық талдау арқылы генотип-фенотиптік бірлестіктерді болжайды.Тұтас геномды қайта секвенирлеу барлық генетикалық нұсқаларды ашуы мүмкін.Фенотиптік деректермен байланыстыра отырып, GWAS фенотипке қатысты SNPs, QTL және кандидат гендерін анықтау үшін өңделуі мүмкін, бұл қазіргі заманғы жануарлар/өсімдік шаруашылығын қолдауға мүмкіндік береді.SLAF - геномға таралған SNP маркерлерін ашатын геномды секвенирлеудің өздігінен әзірленген оңайлатылған стратегиясы.Бұл SNP молекулалық-генетикалық маркерлер ретінде мақсатты белгілермен ассоциацияны зерттеу үшін өңделуі мүмкін.Бұл генетикалық вариациялармен байланысты күрделі белгілерді анықтаудағы үнемді стратегия.
