● Әртүрлі зерттеу мақсаттары үшін қол жетімді бірнеше реттілік стратегиялары
● 10 000-нан астам пене-толық геномы жинақталған саңырауқұлақтар геномын құрастыруда жоғары тәжірибелі.
● Нақтырақ зерттеу қажеттіліктерін қанағаттандыратын сатудан кейінгі кәсіби техникалық қолдау тобы.
Қызмет | Тізбектеу стратегиясы | Сапасына кепілдік берілген | Болжалды айналым уақыты |
Саңырауқұлақтардың жұқа картасы | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Мб | 35 жұмыс күні |
PacBio HiFi 30X | |||
Саңырауқұлақ пененің толық картасы | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Хромосомаларды бекіту коэффициенті >90% | 45 жұмыс күні |
● Шикі деректер сапасын бақылау
● Геном жинағы
● Геномдық құрамдас талдау
● Ген функциясының аннотациясы
● Салыстырмалы геномдық талдау
ҮшінДНҚ сығындылары:
Үлгі түрі | Сома | Шоғырлану | Тазалық |
ДНҚ сығындылары | > 1,2 мкг | > 20 нг/мкл | OD260/280= 1,6-2,5 |
Тін үлгілері үшін:
Үлгі түрі | Ұсынылған өңдеу үлгісі | Үлгіні сақтау және жөнелту |
Бір жасушалы саңырауқұлақ | Ашытқыны микроскоппен бақылаңыз және оларды экспоненциалды фазасында жинаңыз Мәдениетті (шамамен 3-4,5e9 жасушалары бар) 1,5 немесе 2 мл эпендорфқа ауыстырыңыз.(Мұзда ұстаңыз) Бактерияларды жинау және үстіңгі затты абайлап алу үшін түтікшені 1 мин 14000 г центрифугалаңыз Түтікшені жабыңыз және бактерияларды сұйық азотта кем дегенде 1-3 сағатқа мұздатыңыз.Түтікшені -80 ℃ тоңазытқышта сақтаңыз. | Үлгілерді сұйық азотта 3-4 сағат мұздатып, сұйық азотта немесе -80 градусқа дейін ұзақ мерзімді резервте сақтаңыз.Құрғақ мұзбен үлгіні тасымалдау қажет. |
Макро саңырауқұлақ | Белсенді өсу кезеңінде тін ұсынылады. Тіндерді эндотоксинсіз сумен, содан кейін 70% этоналмен шайыңыз. Үлгіні крио-түтіктерде сақтаңыз. |
1. Саңырауқұлақтардың геномдық компоненттері бойынша циркос диаграммасы
2. Салыстырмалы геномикалық талдау: Филогенетикалық ағаш