BMKGENE биоинформатикадағы брифингтерде жарияланған «STEEL кеңістіктік-уақыттық транскриптомдық деректерді жоғары ажыратымдылықпен анықтауға мүмкіндік береді» зерттеуі үшін кеңістіктік транскриптомды реттілік қызметтерін ұсынды.
Бұл зерттеу бақыланбайтын және әртүрлі оқытуға негізделген алгоритмді, кеңістіктік транскриптомнан домендерді гендік экспрессиялық профильдерді және график түрінде жақын кеңістіктік қашықтықты көрсететін моншақтарды кластерлеу арқылы анықтайтын кеңістіктік транскриптомдық ұяшық типті кластерлеуді (STEEL) ұсынды.
10X Visium платформасының кеңістіктік транскриптомиялық деректер жинақтарында STEEL-ті жан-жақты бағалау оның тінтуір миының жұқа құрылымдарын сипаттау үшін жоғары ажыратымдылыққа қол жеткізіп қана қоймай, сонымен қатар жеке талданған бірнеше ұлпа слайдтарын үлкенірекке біріктіруге мүмкіндік беретінін көрсетеді.
Кеңістіктік транскриптомдық технологиялардың дамуымен біздің әдіс доменді сәйкестендіруде және гендік экспрессия атласын реконструкциялауда үлкен қолдануға болады.
басыңызМұндаосы зерттеу туралы көбірек білу үшін.
Хабарлама уақыты: 20 қазан-2023 ж