BMKCloud Log in
条形banner-03

Өнімдер

Эукариоттық мРНҚ секвенирлеу-Иллюмин

мРНҚ реттілігі белгілі бір жағдайларда жасушалардан транскрипцияланған барлық мРНҚ профилін жасауға мүмкіндік береді.Бұл гендердің экспрессиялық профилін, гендік құрылымдар мен кейбір биологиялық процестердің молекулалық механизмдерін ашудың қуатты технологиясы.Бүгінгі күні мРНҚ секвенциясы іргелі зерттеулерде, клиникалық диагностикада, дәрілік заттарды әзірлеуде және т.б. кеңінен қолданылды.

Платформа: Illumina NovaSeq платформасы


Қызмет мәліметтері

Биоинформатика

Демо нәтижелері

Артықшылықтары

● Жоғары тәжірибе: BMK-да жасуша мәдениетін, ұлпаны, дене сұйықтығын және т.б. қоса, әртүрлі үлгі түрлерін қамтитын 200 000-нан астам үлгі өңделді және әртүрлі зерттеу аймағын қамтитын 7 000-нан астам mRNA-Seq жобалары жабылды.

● Қатаң сапаны бақылау жүйесі: сынамаларды дайындау, кітапхананы дайындау, реттілік және биоинформатика сияқты барлық қадамдар арқылы негізгі сапаны бақылау нүктелері жоғары сапалы нәтижелерге қол жеткізу үшін мұқият бақылауда болады.

● Әртүрлі зерттеу мақсаттарын орындау үшін функция аннотациялары мен байыту зерттеулері үшін қол жетімді бірнеше дерекқор.

● Сатудан кейінгі қызметтер: Жоба аяқталғаннан кейін 3 ай бойы жарамды сатылымнан кейінгі қызметтер, соның ішінде жобаларды бақылау, ақаулықтарды жою, нәтижелерді сұрақ-жауап және т.б.

Үлгіге қойылатын талаптар және жеткізу

Кітапхана Тізбектеу стратегиясы Деректер ұсынылады Сапа бақылауы
Poly A байытылған Illumina PE150

6 Гб

Q30≥85%

Үлгіге қойылатын талаптар:

Нуклеотидтер:

Конс.(нг/мкл)

Мөлшері (мкг)

Тазалық

Тұтастық

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Гельде ақуыз немесе ДНҚ ластануы шектеулі немесе жоқ.

Өсімдіктер үшін: RIN≥6,5;

Жануарлар үшін: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

шектелген немесе жоқ бастапқы биіктік

Тін: Салмағы (құрғақ):≥1 г
*5 мг-ден аз тіндер үшін флэш мұздатылған (сұйық азотта) тін үлгісін жіберуді ұсынамыз.

Жасуша суспензиясы:Ұяшықтар саны = 3×106- 1×107
*Мұздатылған жасуша лизатын жөнелтуді ұсынамыз.Бұл ұяшық 5×105-тен аз болған жағдайда.

Қан үлгілері:Көлемі≥1 мл

Микроорганизм:Массасы ≥ 1 г

Ұсынылатын үлгіні жеткізу

Контейнер: 2 мл центрифуга түтігі (қаңылтыр фольга ұсынылмайды)

Үлгі таңбалау: Топ+қайталау, мысалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

жөнелту:

  1. Құрғақ мұз: үлгілерді қаптарға салып, құрғақ мұзға көму керек.
  2. RNAstable түтіктер: РНҚ үлгілерін РНҚ тұрақтандыру түтігінде (мысалы, RNAstable®) кептіруге және бөлме температурасында жөнелтуге болады.

Қызметтің жұмыс ағыны

QC үлгісі

Эксперимент дизайны

үлгіні жеткізу

Үлгіні жеткізу

Пилоттық эксперимент

РНҚ экстракциясы

Кітапханаға дайындық

Кітапхана құрылысы

Тізбектеу

Тізбектеу

Деректерді талдау

Деректерді талдау

Сатудан кейінгі қызметтер

Сатудан кейінгі қызметтер


  • Алдыңғы:
  • Келесі:

  • Биоинформатика

    wps_doc_10

    Эукариоттық мРНҚ секвенирлеу талдауының жұмыс процесі

    Биоинформатика

    ØШикізат деректер сапасын бақылау

    ØАнықтамалық геномды теңестіру

    ØТранскрипт құрылымын талдау

    ØӨрнекті сандық анықтау

    ØДифференциалды өрнектерді талдау

    ØФункцияға аннотация және байыту

    1.mRNA деректерінің қанықтылығы қисығы

    3(1)

    2.Дифференциалды өрнек талдауы-Вулкан сюжеті

    4(1)

    3.DEG бойынша KEGG аннотациясы

    5(1)

    4.DEG бойынша GO классификациясы

    6(1)

    дәйексөз алыңыз

    Хабарламаңызды осы жерге жазып, бізге жіберіңіз

    Хабарламаңызды бізге жіберіңіз: