● Жоғары тәжірибе: BMK-да жасуша мәдениетін, ұлпаны, дене сұйықтығын және т.б. қоса, әртүрлі үлгі түрлерін қамтитын 200 000-нан астам үлгі өңделді және әртүрлі зерттеу аймағын қамтитын 7 000-нан астам mRNA-Seq жобалары жабылды.
● Қатаң сапаны бақылау жүйесі: сынамаларды дайындау, кітапхананы дайындау, реттілік және биоинформатика сияқты барлық қадамдар арқылы негізгі сапаны бақылау нүктелері жоғары сапалы нәтижелерге қол жеткізу үшін мұқият бақылауда болады.
● Әртүрлі зерттеу мақсаттарын орындау үшін функция аннотациялары мен байыту зерттеулері үшін қол жетімді бірнеше дерекқор.
● Сатудан кейінгі қызметтер: Жоба аяқталғаннан кейін 3 ай бойы жарамды сатылымнан кейінгі қызметтер, соның ішінде жобаларды бақылау, ақаулықтарды жою, нәтижелерді сұрақ-жауап және т.б.
Кітапхана | Тізбектеу стратегиясы | Деректер ұсынылады | Сапа бақылауы |
Poly A байытылған | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
Нуклеотидтер:
Конс.(нг/мкл) | Мөлшері (мкг) | Тазалық | Тұтастық |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Гельде ақуыз немесе ДНҚ ластануы шектеулі немесе жоқ. | Өсімдіктер үшін: RIN≥6,5; Жануарлар үшін: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; шектелген немесе жоқ бастапқы биіктік |
Тін: Салмағы (құрғақ):≥1 г
*5 мг-ден аз тіндер үшін флэш мұздатылған (сұйық азотта) тін үлгісін жіберуді ұсынамыз.
Жасуша суспензиясы:Ұяшықтар саны = 3×106- 1×107
*Мұздатылған жасуша лизатын жөнелтуді ұсынамыз.Бұл ұяшық 5×105-тен аз болған жағдайда.
Қан үлгілері:Көлемі≥1 мл
Микроорганизм:Массасы ≥ 1 г
Контейнер: 2 мл центрифуга түтігі (қаңылтыр фольга ұсынылмайды)
Үлгі таңбалау: Топ+қайталау, мысалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
жөнелту:
Биоинформатика
Эукариоттық мРНҚ секвенирлеу талдауының жұмыс процесі
Биоинформатика
ØШикізат деректер сапасын бақылау
ØАнықтамалық геномды теңестіру
ØТранскрипт құрылымын талдау
ØӨрнекті сандық анықтау
ØДифференциалды өрнектерді талдау
ØФункцияға аннотация және байыту
1.mRNA деректерінің қанықтылығы қисығы
2.Дифференциалды өрнек талдауы-Вулкан сюжеті
3.DEG бойынша KEGG аннотациясы
4.DEG бойынша GO классификациясы