BMKCloud Log in
条形banner-03

Өнімдер

DNA/RNA Sequencing – Illumina Sequencer

Illumina секвенирлеу технологиясы, синтез арқылы секвенирлеу (SBS) — дүние жүзінде секвенирлеу деректерінің 90%-дан астамын жасауға жауап беретін бүкіл әлемде кеңінен қабылданған келесі ұрпақ секвенирлеу (NGS) технологиясы.Әрбір dNTP қосылғанда флуоресцентті таңбаланған қайтымды терминатор кескінделеді, содан кейін келесі негізді қосуға мүмкіндік беру үшін кесіледі.Барлық 4 қайтымды терминатормен байланысқан dNTP әрбір реттілік циклі кезінде болғандықтан, табиғи бәсекелестік біріктіру ауытқуын азайтады.Әдіс қайталанатын нуклеотидтер (гомополимерлер) тізбегімен байланысты қателер мен қабылданбаған қоңырауларды іс жүзінде жояды.Синтез технологиясы бойынша Illumina реттілігі бір оқылатын және жұптастырылған кітапханаларды қолдайды.SBS технологиясы жоғары ажыратымдылықтағы геномды реттілік үшін қысқа кірістіру жұптастырылған мүмкіндікті, сонымен қатар тиімді реттілік құрастыру, жаңа реттілік және т.б. үшін ұзын кірістірілген жұптастырылған оқуларды ұсынады.Қысқа кірістірулер мен ұзағырақ оқулардың тіркесімі кез келген геномды толық сипаттау мүмкіндігін арттырады.


Қызмет мәліметтері

Демо нәтижесі

Қызмет мәліметтерінің мүмкіндіктері

Платформа

Тізбектеу режимі

Қолданбалар

Illumina Nova жүйесі

SE50

PE50

PE150

PE250

1. Бүкіл геномдарды жылдам тізбеу

2. Мақсатты аймақтарды терең реттілікке келтіру үшін үлкейтіңіз

3. Жаңа РНҚ нұсқаларын және сплайс сайттарын табу үшін РНҚ секвенирлеуін (RNA-Seq) пайдаланыңыз немесе ген экспрессиясын талдау үшін мРНҚ санын анықтаңыз

4. Геномдық ДНҚ метилденуі және ДНҚ-ақуыз әрекеттесуі сияқты эпигенетикалық факторларды талдаңыз.

5. Сирек соматикалық нұсқаларды, ісік субклондарын және т.б. зерттеу үшін қатерлі ісік үлгілерін реттілікпен орналастырыңыз. Адамдардағы немесе қоршаған ортадағы микробтардың әртүрлілігін зерттеу

Қызметтің артықшылықтары

● Түрлі түрлері бар мыңдаған жабық жобалары бар Illumina секвенирлеу платформасында үлкен тәжірибе.
● Қысқа айналдыру уақыты бар жетілген реттілік процесі.
● Төменгі ағындағы биоинформатика талдау қызметтерін аяқтаңыз.
● Қатаң сапаны бақылау жүйесі: реттілік деректерінің қатаң QC стандарты.

Үлгіге қойылатын талаптар*

Тізбектеу платформасы &

Тізбектеу стратегиясы

Деректер көлемі

 

Шоғырлану
(Thermo Life Qubit 3.0)

 

Көлемі

Сома

QC нәтижесі

Novaseq жүйесі,

жұптастырылған 150 бит

X≤30Гб

≥1нг/мкл

≥20 мкл

≥20 нг

Білікті

30 Гб < X≤100 Гб

≥1нг/мкл

≥25 мкл

≥30 нг

X>100 Гб

≥2нг/мкл

≥25 мкл

≥50 нг

Ескерту:
  • Концентрация мен жалпы мөлшерге қоса, қолайлы шың үлгісі де қажет.

Бір жолақты (Illumina)

Платформа

 

 

Шоғырлану
(qPCR nM)

 

Көлемі

QC нәтижесі

HiseqXten

≥2,5нМ

≥20 мкл

Білікті

NovaSeq 6000 S4

≥2нМ

≥30 мкл

NovaSeg 6000 SP

≥2нМ

≥30 мкл

 

Үлгілеріңіз бастапқы материал талаптарына сәйкес келмесе, бізге хабарласыңыз.

Қызметтің жұмыс процесі

үлгіні дайындау

Кітапхана сапасын бақылау

Тізбектеу

Тізбектеу

Деректерді талдау

Деректер сапасын бақылау

QC үлгісі

Жобаны жеткізу


  • Алдыңғы:
  • Келесі:

  • РНҚ үлгісінің деректер сапасын бағалау

    Кесте 1. Деректерді тізбектеу бойынша статистика.

    Үлгі идентификаторы

    BMKID

    Шикі оқиды

    Шикі деректер (bp)

    Таза оқулар (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22 870 120

    6 861 036 000

    96,48

    99.14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14 717 867

    4 415 360 100

    96.00

    98,95

    93,89

    37.08

    Сурет 1. Әрбір үлгідегі оқулар бойынша сапа таралуы

    A9

    Сурет 2. Негізгі мазмұнды бөлу

    A10

    Сурет 3. Деректерді реттілікте оқу мазмұнының таралуы

    A11

    дәйексөз алыңыз

    Хабарламаңызды осы жерге жазып, бізге жіберіңіз

    Хабарламаңызды бізге жіберіңіз: