-
სრული სიგრძის mRNA თანმიმდევრობა-ნანოპორი
რნმ-ის თანმიმდევრობა იყო ფასდაუდებელი ინსტრუმენტი ტრანსკრიპტომის ყოვლისმომცველი ანალიზისთვის.ეჭვგარეშეა, ტრადიციული მოკლე წაკითხვის თანმიმდევრობა მიაღწია მრავალ მნიშვნელოვან განვითარებას აქ.მიუხედავად ამისა, ის ხშირად აწყდება შეზღუდვებს სრულმეტრაჟიანი იზოფორმების იდენტიფიკაციაში, რაოდენობებში, PCR მიკერძოებულობაში.
ნანოპორების თანმიმდევრობა განასხვავებს თავს სხვა თანმიმდევრობის პლატფორმებისგან, რადგან ნუკლეოტიდები იკითხება პირდაპირ დნმ-ის სინთეზის გარეშე და წარმოქმნის ხანგრძლივ კითხვას ათობით კილობაზზე.ეს საშუალებას აძლევს პირდაპირ წასაკითხად გადაკვეთოს სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპტები და გაუმკლავდეს გამოწვევებს იზოფორმის დონის კვლევებში.
Პლატფორმა:Nanopore PromethION
ბიბლიოთეკა:cDNA-PCR
-
De novo სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა - PacBio
ახალისრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა, ასევე ცნობილი როგორცახალიIso-Seq იყენებს PacBio sequencer-ის უპირატესობებს წაკითხვის სიგრძეში, რაც საშუალებას აძლევს სრულმეტრაჟიანი cDNA მოლეკულების თანმიმდევრობას ყოველგვარი შესვენების გარეშე.ეს მთლიანად თავიდან აიცილებს ტრანსკრიპტის შეკრების საფეხურებში წარმოქმნილ შეცდომებს და აყალიბებს უნიგენურ კომპლექტს იზოფორმის დონის გარჩევადობით.ეს უნიგენური კომპლექტი იძლევა ძლიერ გენეტიკურ ინფორმაციას, როგორც „საცნობარო გენომი“ ტრანსკრიპტომის დონეზე.გარდა ამისა, შემდეგი თაობის თანმიმდევრობის მონაცემებთან შერწყმა, ეს სერვისი იძლევა იზოფორმის დონის გამოხატვის ზუსტი რაოდენობრივი განსაზღვრის უფლებას.
პლატფორმა: PacBio Sequel IIბიბლიოთეკა: SMRT ზარის ბიბლიოთეკა -
ევკარიოტული mRNA თანმიმდევრობა-Illumina
mRNA თანმიმდევრობა საშუალებას აძლევს ყველა mRNA-ის პროფილირებას, რომელიც ტრანსკრიფირებულია უჯრედებიდან სპეციფიკურ პირობებში.ეს არის ძლიერი ტექნოლოგია გენის ექსპრესიის პროფილის, გენის სტრუქტურისა და გარკვეული ბიოლოგიური პროცესების მოლეკულური მექანიზმების გამოსავლენად.დღემდე, mRNA თანმიმდევრობა ფართოდ გამოიყენება ფუნდამენტურ კვლევებში, კლინიკურ დიაგნოსტიკაში, წამლების შემუშავებაში და ა.შ.
პლატფორმა: Illumina NovaSeq 6000
-
არარეფერენციული mRNA თანმიმდევრობა-Illumina
mRNA თანმიმდევრობა იყენებს შემდეგი თაობის თანმიმდევრობის მეთოდს (NGS), რათა დაიჭიროს ევკარიოტის მაცნე რნმ (mRNA) კონკრეტული პერიოდის განმავლობაში, როდესაც აქტიურდება ზოგიერთი სპეციალური ფუნქცია.ყველაზე გრძელ ჩანაწერს ეწოდა "Unigene" და გამოიყენებოდა, როგორც საცნობარო თანმიმდევრობა შემდგომი ანალიზისთვის, რაც ეფექტური საშუალებაა სახეობების მოლეკულური მექანიზმისა და მარეგულირებელი ქსელის შესასწავლად მითითების გარეშე.
ტრანსკრიპტომის მონაცემების შეკრების და უნიგენის ფუნქციური ანოტაციის შემდეგ
(1) SNP ანალიზი, SSR ანალიზი, CDS პროგნოზირება და გენის სტრუქტურა წინასწარ იქნება ჩამოყალიბებული.
(2) განხორციელდება უნიგენის ექსპრესიის რაოდენობრივი განსაზღვრა თითოეულ ნიმუშში.
(3) დიფერენციალურად გამოხატული უნიგენები ნიმუშებს (ან ჯგუფებს) შორის აღმოჩენილი იქნება უნიგენური ექსპრესიის საფუძველზე
(4) განხორციელდება დიფერენციალურად გამოხატული უნიგენების კლასტერირება, ფუნქციური ანოტაცია და გამდიდრების ანალიზი
-
გრძელი არაკოდირების თანმიმდევრობა-Illumina
გრძელი არაკოდირების რნმ-ები (lncRNAs) არის რნმ-ის მოლეკულების ტიპი, რომლის სიგრძე აღემატება 200 ნტ-ს, რომლებიც ხასიათდება კოდირების უკიდურესად დაბალი პოტენციალით.LncRNA, როგორც ძირითადი წევრი არაკოდირებულ რნმ-ებში, ძირითადად გვხვდება ბირთვსა და პლაზმაში.თანმიმდევრობის ტექნოლოგიისა და ბიოინფორმტიკის განვითარება საშუალებას გაძლევთ ამოიცნოთ მრავალი ახალი lncRNA და დააკავშიროთ ისინი ბიოლოგიურ ფუნქციებთან.აკუმულაციური მტკიცებულებები ვარაუდობენ, რომ lncRNA ფართოდ არის ჩართული ეპიგენეტიკურ რეგულაციაში, ტრანსკრიპციის რეგულაციაში და პოსტტრანსკრიპციულ რეგულაციაში.
-
მცირე რნმ-ის თანმიმდევრობა-Illumina
მცირე რნმ ეხება რნმ-ის არაკოდირების მოლეკულების კლასს, რომლებიც, ჩვეულებრივ, 200 ნტ-ზე ნაკლებია სიგრძით, მათ შორის მიკრო რნმ (მირნმ), მცირე ინტერფერენციული რნმ (სირნმ) და პივი-ინტერაქციული რნმ (piRNA).
მიკრორნმ (მირნმ) არის ენდოგენური მცირე რნმ-ის კლასი, რომლის სიგრძეა დაახლოებით 20-24 ნტ, რომელიც ასრულებს სხვადასხვა მნიშვნელოვან მარეგულირებელ როლს უჯრედებში.miRNA ჩართულია მრავალ სასიცოცხლო პროცესებში, რომლებიც ავლენს ქსოვილს - სპეციფიკურ და სტადიას - სპეციფიკურ გამოხატულებას და ძალზედ დაცული სხვადასხვა სახეობებში.
-
circRNA თანმიმდევრობა-Illumina
მთლიანი ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა შექმნილია რნმ-ის ყველა ტიპის მოლეკულის პროფილისთვის, მათ შორის კოდირებადი (mRNA) და არაკოდიციური რნმ (მათ შორის lncRNA, circRNA და miRNA), რომლებიც ტრანსკრიბირებულია კონკრეტული უჯრედების მიერ გარკვეულ დროს.მთლიანი ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა, რომელიც ასევე ცნობილია როგორც "ტოტალური რნმ-ის თანმიმდევრობა", მიზნად ისახავს ტრანსკრიპტომის დონეზე ყოვლისმომცველი მარეგულირებელი ქსელების გამოვლენას.NGS ტექნოლოგიის გამოყენებით, მთელი ტრანსკრიპტომის პროდუქტების თანმიმდევრობები ხელმისაწვდომია ceRNA ანალიზისთვის და ერთობლივი რნმ ანალიზისთვის, რაც უზრუნველყოფს პირველ ნაბიჯს ფუნქციური დახასიათებისკენ.ცირკნმ-მირნმ-მრნმ-ზე დაფუძნებული ცერნმ-ის მარეგულირებელი ქსელის გამოვლენა.
-
მთელი ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა - Illumina
მთლიანი ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა შექმნილია რნმ-ის ყველა ტიპის მოლეკულის პროფილისთვის, მათ შორის კოდირებადი (mRNA) და არაკოდიციური რნმ (მათ შორის lncRNA, circRNA და miRNA), რომლებიც ტრანსკრიბირებულია კონკრეტული უჯრედების მიერ გარკვეულ დროს.მთლიანი ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა, რომელიც ასევე ცნობილია როგორც "ტოტალური რნმ-ის თანმიმდევრობა", მიზნად ისახავს ტრანსკრიპტომის დონეზე ყოვლისმომცველი მარეგულირებელი ქსელების გამოვლენას.NGS ტექნოლოგიის გამოყენებით, მთელი ტრანსკრიპტომის პროდუქტების თანმიმდევრობები ხელმისაწვდომია ceRNA ანალიზისთვის და ერთობლივი რნმ ანალიზისთვის, რაც უზრუნველყოფს პირველ ნაბიჯს ფუნქციური დახასიათებისკენ.ცირკნმ-მირნმ-მრნმ-ზე დაფუძნებული ცერნმ-ის მარეგულირებელი ქსელის გამოვლენა.
-
პროკარიოტული რნმ-ის თანმიმდევრობა
პროკარიოტული რნმ-ის თანმიმდევრობა იყენებს შემდეგი თაობის თანმიმდევრობას (NGS), რათა გამოავლინოს რნმ-ის არსებობა და რაოდენობა მოცემულ მომენტში, ცვალებადი უჯრედული ტრანსკრიპტომის ანალიზით.ჩვენი კომპანიის პროკარიოტული რნმ-ის თანმიმდევრობა, კონკრეტულად მიზნად ისახავს პროკარიოტებს საცნობარო გენომებით, გთავაზობთ ტრანსკრიპტომის პროფილირებას, გენის სტრუქტურის ანალიზს და ა.შ. იგი ფართოდ გამოიყენება საბაზისო მეცნიერების კვლევაში, წამლების კვლევასა და განვითარებაში და სხვა.
პლატფორმა: Illumina NovaSeq 6000
-
მეტატრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა
მეტატრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა განსაზღვრავს მიკრობების (როგორც ევკარიოტების, ასევე პროკარიოტების) გენის ექსპრესიას ბუნებრივ გარემოში (მაგ. ნიადაგი, წყალი, ზღვა, განავალი და ნაწლავები). კერძოდ, ეს სერვისი საშუალებას გაძლევთ მიიღოთ რთული მიკრობული თემების გენის ექსპრესიის პროფილი, ტაქსონომიური ანალიზი. სახეობების, განსხვავებულად გამოხატული გენების ფუნქციური გამდიდრების ანალიზი და სხვა.
პლატფორმა: Illumina NovaSeq 6000
