Heatmap უჯრა გამოიყენება თერმული რუქის შედგენისთვის, რომელსაც შეუძლია ფილტრაცია, ნორმალიზება და კასეტური მატრიცის მონაცემები. იგი ძირითადად გამოიყენება სხვადასხვა ნიმუშებს შორის გენის გამოხატვის დონის კასეტური ანალიზისთვის.
ბიოლოგიური ფუნქციების მიმაგრება თანმიმდევრობებზე FASTA ფაილში თანმიმდევრობების მონაცემთა ბაზაში გასწორებით, მათ შორის NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) არის ალგორითმი და პროგრამა მსგავსი ბიოლოგიური თანმიმდევრობის მქონე რეგიონების მოსაძებნად.ის ადარებს ამ თანმიმდევრობებს თანმიმდევრობის მონაცემთა ბაზებს და ითვლის სტატისტიკურ მნიშვნელობას.BLAST შედგება ოთხი ტიპის ხელსაწყოებისგან, რომლებიც დაფუძნებულია თანმიმდევრობის ტიპზე: blastn, lastp, blastx და tblastn.