-
BSA
Bulked Segregant Analysis პლატფორმა შედგება ერთსაფეხურიანი სტანდარტული ანალიზისა და გაფართოებული ანალიზისგან მორგებული პარამეტრების პარამეტრით.BSA არის ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ფენოტიპთან დაკავშირებული გენეტიკური მარკერების სწრაფად იდენტიფიცირებისთვის.BSA-ს ძირითადი სამუშაო პროცესი შეიცავს: 1. ინდივიდების ორი ჯგუფის შერჩევას უკიდურესად საპირისპირო ფენოტიპებით;2. ყველა ინდივიდის დნმ-ის, რნმ-ის ან SLAF-seq-ის (განვითარებული ბიომარკერის მიერ) გაერთიანება დნმ-ის ორი ნაწილის შესაქმნელად;3. დიფერენციალური მიმდევრობების იდენტიფიცირება საცნობარო გენომის მიმართ ან მათ შორის, 4. კანდიდატთან დაკავშირებული რეგიონების პროგნოზირება ED და SNP-ინდექსის ალგორითმით;5. ფუნქციური ანალიზი და გენების გამდიდრება კანდიდატ რეგიონებში და ა.შ. ასევე ხელმისაწვდომია მონაცემების უფრო მოწინავე მაინინგი, გენეტიკური მარკერების სკრინინგისა და პრაიმერის დიზაინის ჩათვლით.
-
ამპლიკონი (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) პლატფორმა შემუშავებულია მიკრობული მრავალფეროვნების პროექტის ანალიზის მრავალწლიანი გამოცდილებით, რომელიც შეიცავს სტანდარტიზებულ საბაზისო ანალიზს და პერსონალიზებულ ანალიზს: ძირითადი ანალიზი მოიცავს მიმდინარე მიკრობული კვლევის ძირითადი ანალიზის შინაარსს, ანალიზის შინაარსი მდიდარი და ყოვლისმომცველია. და ანალიზის შედეგები წარმოდგენილია პროექტის ანგარიშების სახით;პერსონალიზებული ანალიზის შინაარსი მრავალფეროვანია.შესაძლებელია ნიმუშების შერჩევა და პარამეტრების მოქნილად დაყენება ძირითადი ანალიზის მოხსენებისა და კვლევის მიზნის შესაბამისად, პერსონალიზებული მოთხოვნების რეალიზაციისთვის.Windows ოპერაციული სისტემა, მარტივი და სწრაფი.
-
ევოლუციური გენეტიკა
ევოლუციური გენეტიკა არის შეფუთული თანმიმდევრობის სერვისი, რომელიც შექმნილია მოცემული მასალების ევოლუციური ინფორმაციის ყოვლისმომცველი ინტერპრეტაციისთვის, გენეტიკური ვარიაციების საფუძველზე, მათ შორის SNP, InDels, SVs და CNV.ის უზრუნველყოფს ყველა ფუნდამენტურ ანალიზს, რომელიც საჭიროა პოპულაციების ევოლუციური ცვლილებებისა და გენეტიკური მახასიათებლების აღსაწერად, როგორიცაა პოპულაციის სტრუქტურა, გენეტიკური მრავალფეროვნება, ფილოგენური ურთიერთობები და ა.შ.
-
შედარებითი გენომიკა
შედარებითი გენომიკა სიტყვასიტყვით ნიშნავს სხვადასხვა სახეობის გენომის სრული თანმიმდევრობებისა და სტრუქტურების შედარებას.ეს დისციპლინა მიზნად ისახავს სახეობების ევოლუციის, გენის ფუნქციის, გენის მარეგულირებელი მექანიზმის გამოვლენას გენომის დონეზე, მიმდევრობის სტრუქტურებისა და ელემენტების იდენტიფიცირებით, რომლებიც შენარჩუნებულია ან დიფერენცირებულია სხვადასხვა სახეობებში.ტიპიური შედარებითი გენომიკის შესწავლა მოიცავს ანალიზებს გენის ოჯახში, ევოლუციურ განვითარებას, მთლიან გენომის დუბლირებას, სელექციურ წნევას და ა.შ.
-
ევოლუციური გენეტიკა
მოსახლეობის და ევოლუციური გენეტიკური ანალიზის პლატფორმა შექმნილია BMK R&D გუნდის ფარგლებში წლების განმავლობაში დაგროვილი მასიური გამოცდილების საფუძველზე.ეს არის მოსახერხებელი ინსტრუმენტი, განსაკუთრებით მკვლევრებისთვის, რომლებიც არ არიან ბიოინფორმატიკის სპეციალობით.ეს პლატფორმა საშუალებას აძლევს ძირითად ევოლუციური გენეტიკასთან დაკავშირებულ ძირითად ანალიზს, მათ შორის ფილოგენეტიკური ხის აგებულების, კავშირის დისბალანსის ანალიზს, გენეტიკური მრავალფეროვნების შეფასებას, შერჩევითი გაწმენდის ანალიზს, ნათესაობის ანალიზს, PCA, პოპულაციის სტრუქტურის ანალიზს და ა.შ.
-
Hi-C დაფუძნებული გენომის ასამბლეა
Hi-C არის მეთოდი, რომელიც შექმნილია ქრომოსომის კონფიგურაციის დასაფიქსირებლად სიახლოვეზე დაფუძნებული ურთიერთქმედებებისა და მაღალი გამტარუნარიანობის თანმიმდევრობის კომბინაციით.ითვლება, რომ ამ ურთიერთქმედების ინტენსივობა უარყოფითად არის დაკავშირებული ქრომოსომების ფიზიკურ მანძილთან.აქედან გამომდინარე, Hi-C მონაცემებს შეუძლია ხელმძღვანელობდეს აწყობილი თანმიმდევრობების დაჯგუფებას, მოწესრიგებასა და ორიენტირებას გენომში მონახაზში და ქრომოსომების გარკვეულ რაოდენობაზე.ეს ტექნოლოგია აძლიერებს ქრომოსომის დონის გენომის შეკრებას პოპულაციაზე დაფუძნებული გენეტიკური რუქის არარსებობის შემთხვევაში.თითოეულ გენომს სჭირდება Hi-C.
პლატფორმა: Illumina NovaSeq პლატფორმა / DNBSEQ
-
მცენარეთა/ცხოველთა დე ნოვო გენომის თანმიმდევრობა
დე ნოვოთანმიმდევრობა გულისხმობს სახეობის მთლიანი გენომის აგებას თანმიმდევრობის ტექნოლოგიების გამოყენებით, მაგ. PacBio, Nanopore, NGS და ა.შ., საცნობარო გენომის არარსებობის შემთხვევაში.მესამე თაობის თანმიმდევრობის ტექნოლოგიების წაკითხვის ხანგრძლივობის გასაოცარმა გაუმჯობესებამ შექმნა ახალი შესაძლებლობები რთული გენომების აწყობაში, როგორიცაა მაღალი ჰეტეროზიგოტურობა, განმეორებადი უბნების მაღალი თანაფარდობა, პოლიპლოიდები და ა.შ. განმეორებადი ელემენტების, არანორმალური GC შემცველობის რეგიონების და სხვა უაღრესად რთული რეგიონების გადაჭრა.
პლატფორმა: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq პლატფორმა
-
ადამიანის მთელი ეგზომის თანმიმდევრობა
მთლიანი ეგზომის თანმიმდევრობა (WES) განიხილება, როგორც ხარჯთეფექტური თანმიმდევრობის სტრატეგია დაავადების გამომწვევი მუტაციების იდენტიფიცირებისთვის.მიუხედავად იმისა, რომ ეგზონები მთლიანი გენომის დაახლოებით 1.7%-ს იკავებს, ის პირდაპირ წარმოადგენს მთლიანი ცილის ფუნქციების პროფილს.ადამიანის გენომში ცნობილია, რომ დაავადებასთან დაკავშირებული მუტაციების 85%-ზე მეტი ხდება ცილის კოდირების რეგიონში.
BMKGENE გთავაზობთ ყოვლისმომცველ და მოქნილ ადამიანთა მთლიანი ეგზომის თანმიმდევრობის სერვისებს ეგზონის აღების სხვადასხვა სტრატეგიით, რომლებიც ხელმისაწვდომია სხვადასხვა კვლევის მიზნების დასაკმაყოფილებლად.
პლატფორმა: Illumina NovaSeq პლატფორმა
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
მაღალი გამტარუნარიანობის გენოტიპირება, განსაკუთრებით ფართომასშტაბიან პოპულაციაში, არის ფუნდამენტური ნაბიჯი გენეტიკური ასოციაციის კვლევებში, რომელიც უზრუნველყოფს გენეტიკურ საფუძველს ფუნქციური გენის აღმოჩენისთვის, ევოლუციური ანალიზისთვის და ა.შ. ღრმა მთლიანი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობის ნაცვლად, შემცირებული წარმოდგენის გენომის თანმიმდევრობა (RRGS). ) დაინერგება თითო ნიმუშის თანმიმდევრობის დანახარჯების შესამცირებლად, გენეტიკური მარკერის აღმოჩენის გონივრული ეფექტურობის შესანარჩუნებლად.ეს ჩვეულებრივ მიიღწევა შეზღუდვის ფრაგმენტის მოპოვებით მოცემულ ზომის დიაპაზონში, რომელსაც ეწოდება შემცირებული წარმოდგენის ბიბლიოთეკა (RRL).სპეციფიური ლოკუსით გაძლიერებული ფრაგმენტების თანმიმდევრობა (SLAF-Seq) არის SNP გენოტიპირების თვითგანვითარებული სტრატეგია საცნობარო გენომით ან მის გარეშე.
პლატფორმა: Illumina NovaSeq პლატფორმა -
Illumina და BGI
Illumina თანმიმდევრობის ტექნოლოგია, დაფუძნებული Sequencing by Synthesis (SBS), არის გლობალურად მიღებული NGS ინოვაცია, რომელიც პასუხისმგებელია მსოფლიო თანმიმდევრობის მონაცემების 90%-ზე მეტის გენერირებაზე.SBS-ის პრინციპი გულისხმობს ფლუორესცენტურად მარკირებული შექცევადი ტერმინატორების გამოსახულებას, როდესაც ემატება თითოეული dNTP და შემდგომ იშლება, რათა მოხდეს შემდეგი ბაზის ჩართვის საშუალება.ოთხივე შექცევადი ტერმინატორზე შეკრული dNTP-ის თანმიმდევრობის თითოეულ ციკლში, ბუნებრივი კონკურენცია ამცირებს ინკორპორაციის მიკერძოებას.ეს მრავალმხრივი ტექნოლოგია მხარს უჭერს როგორც ერთ წაკითხულ, ისე დაწყვილებულ ბიბლიოთეკებს, რომლებიც ემსახურება გენომიურ აპლიკაციებს.Illumina-ს თანმიმდევრობის მაღალი გამტარუნარიანობის შესაძლებლობები და სიზუსტე აყენებს მას, როგორც ქვაკუთხედს გენომიკის კვლევაში, რაც მეცნიერებს აძლევს უფლებას, ამოიცნონ გენომების სირთულეები შეუდარებელი დეტალებითა და ეფექტურობით.
DNBSEQ, შემუშავებული BGI-ს მიერ, არის კიდევ ერთი ინოვაციური NGS ტექნოლოგია, რომელმაც მოახერხა თანმიმდევრობის ხარჯების კიდევ უფრო შემცირება და გამტარუნარიანობის გაზრდა.DNBSEQ ბიბლიოთეკების მომზადება მოიცავს დნმ-ის ფრაგმენტაციას, ssDNA-ს მომზადებას და მოძრავი წრის გაძლიერებას დნმ-ის ნანობურთების (DNB) მისაღებად.შემდეგ ისინი იტვირთება მყარ ზედაპირზე და შემდგომში თანმიმდევრული ზონდი-წამყვანის სინთეზით (cPAS).
ჩვენი წინასწარ დამზადებული ბიბლიოთეკის თანმიმდევრობის სერვისი ხელს უწყობს მომხმარებლებს მოამზადონ თავიანთი თანმიმდევრობის ბიბლიოთეკები სხვადასხვა წყაროდან (mRNA, მთელი გენომი, ამპლიკონი და სხვა).შემდგომში, ეს ბიბლიოთეკები შეიძლება გაიგზავნოს ჩვენს თანმიმდევრობის ცენტრებში ხარისხის კონტროლისა და თანმიმდევრობისთვის Illumina ან BGI პლატფორმებზე.
