-
მეტატრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა
მეტატრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა განსაზღვრავს მიკრობების (როგორც ევკარიოტების, ასევე პროკარიოტების) გენის ექსპრესიას ბუნებრივ გარემოში (მაგ. ნიადაგი, წყალი, ზღვა, განავალი და ნაწლავები). კერძოდ, ეს სერვისი საშუალებას გაძლევთ მიიღოთ რთული მიკრობული თემების გენის ექსპრესიის პროფილი, ტაქსონომიური ანალიზი. სახეობების, განსხვავებულად გამოხატული გენების ფუნქციური გამდიდრების ანალიზი და სხვა.
პლატფორმა: Illumina NovaSeq პლატფორმა
-
სოკოს გენომი
Biomarker Technologies უზრუნველყოფს გენომის კვლევას, წვრილ გენომს და სოკოს სრულ გენომს, რაც დამოკიდებულია კვლევის კონკრეტულ მიზანზე.გენომის თანმიმდევრობა, აწყობა და ფუნქციური ანოტაცია შეიძლება მიღწეული იყოს შემდეგი თაობის თანმიმდევრობის + მესამე თაობის თანმიმდევრობის კომბინაციით მაღალი დონის გენომის შეკრების მისაღწევად.Hi-C ტექნოლოგია ასევე შეიძლება გამოყენებულ იქნას გენომის შეკრების გასაადვილებლად ქრომოსომის დონეზე.
Პლატფორმა:PacBio გაგრძელება II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq პლატფორმა
-
ინსტრუმენტების ნაკრები
BMKCloud არის წამყვანი ბიოინფორმატიული პლატფორმა, რომელიც უზრუნველყოფს ერთჯერადი გადაწყვეტილებების მიღებას გენომიური პროგრამებისთვის, რომელსაც ფართოდ ენდობა მკვლევარები სხვადასხვა სფეროში, მათ შორის სამედიცინო, სოფლის მეურნეობის, გარემოსდაცვითი და ა.შ. , გამოთვლითი რესურსები, საჯარო მონაცემთა ბაზა, ბიოინფორმაციული ონლაინ კურსები და ა.შ. BMKCloud-ს აქვს სხვადასხვა ხშირად გამოყენებული ბიოინფორმაციული ხელსაწყოები, მათ შორის გენის ანოტაცია, ევოლუციური გენეტიკური ხელსაწყოები, ncRNA, მონაცემთა ხარისხის კონტროლი, შეკრება, გასწორება, მონაცემთა ამოღება, მუტაციები, სტატისტიკა, ფიგურების გენერატორი, თანმიმდევრობა. ანალიზი და ა.შ.
-
ბაქტერიების სრული გენომი
Biomarker Technologies გთავაზობთ თანმიმდევრობის სერვისს ბაქტერიების სრული გენომის კონსტრუქციაზე ნულოვანი უფსკრულით.ბაქტერიების სრული გენომის კონსტრუქციის ძირითადი სამუშაო ნაკადი მოიცავს მესამე თაობის თანმიმდევრობას, აწყობას, ფუნქციურ ანოტაციას და მოწინავე ბიოინფორმატიულ ანალიზს, რომელიც ასრულებს კონკრეტულ კვლევის მიზნებს.ბაქტერიების გენომის უფრო ყოვლისმომცველი პროფილირება საშუალებას აძლევს გამოავლინოს ფუნდამენტური მექანიზმები, რომლებიც საფუძვლად უდევს მათ ბიოლოგიურ პროცესებს, რაც ასევე შეიძლება იყოს ღირებული მითითება გენომიური კვლევებისთვის უფრო მაღალ ევკარიოტულ სახეობებში.
Პლატფორმა:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq პლატფორმა
PacBio გაგრძელება II
-
მცირე რნმ
მცირე რნმ არის მოკლე არაკოდიციური რნმ-ის ტიპი, საშუალო სიგრძით 18-30 ნტ, მათ შორის miRNA, siRNA და piRNA.ეს მცირე რნმ-ები მასიურად მონაწილეობენ სხვადასხვა ბიოლოგიურ პროცესებში, როგორიცაა mRNA დეგრადაცია, ტრანსლაციის ინჰიბიცია, ჰეტეროქრომატინის წარმოქმნა და ა.შ. თანმიმდევრობის ანალიზის პლატფორმა შედგება სტანდარტული ანალიზისა და მონაცემთა მოწინავე მოპოვებისგან.RNA-seq მონაცემების საფუძველზე, სტანდარტულ ანალიზს შეუძლია მიაღწიოს miRNA იდენტიფიკაციას და პროგნოზირებას, miRNA სამიზნე გენის პროგნოზირებას, ანოტაციას და გამოხატვის ანალიზს.გაფართოებული ანალიზი საშუალებას იძლევა მორგებული miRNA ძიება და მოპოვება, ვენის დიაგრამის გენერირება, miRNA და სამიზნე გენის ქსელის შექმნა.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS არის მთელი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობის ანალიზის პლატფორმა, რომელიც შემუშავებულია ბიომარკერის ტექნოლოგიებში მდიდარი გამოცდილების საფუძველზე.ეს მარტივი გამოსაყენებელი პლატფორმა საშუალებას გაძლევთ სწრაფად წარადგინოთ ინტეგრირებული ანალიზის სამუშაო ნაკადი რამდენიმე ძირითადი პარამეტრის დაყენებით, რომელიც ერგება დნმ-ის თანმიმდევრობის მონაცემებს, რომლებიც გენერირებულია როგორც Illumina პლატფორმიდან, ასევე BGI თანმიმდევრობის პლატფორმიდან.ეს პლატფორმა განლაგებულია მაღალი წარმადობის გამოთვლით სერვერზე, რომელიც უზრუნველყოფს მონაცემთა მაღალეფექტურ ანალიზს ძალიან შეზღუდულ დროში.პერსონალიზებული მონაცემების მოპოვება ხელმისაწვდომია სტანდარტული ანალიზის საფუძველზე, მათ შორის მუტაციური გენის მოთხოვნა, PCR პრაიმერის დიზაინი და ა.შ.
-
mRNA (მინიშნება)
ტრანსკრიპტომი არის კავშირი გენომიურ გენეტიკურ ინფორმაციასა და ბიოლოგიური ფუნქციის პროტეომს შორის.ტრანსკრიპციული დონის რეგულირება არის ორგანიზმების ყველაზე მნიშვნელოვანი და ყველაზე ფართოდ შესწავლილი რეგულირების რეჟიმი.ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობას შეუძლია ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობა დროის ნებისმიერ მომენტში ან ნებისმიერ პირობებში, რეზოლუციით ზუსტი ერთი ნუკლეოტიდის მიმართ. მას შეუძლია დინამიურად ასახოს გენის ტრანსკრიპციის დონე, ერთდროულად გამოავლინოს და რაოდენობრივად განსაზღვროს იშვიათი და ნორმალური ტრანსკრიპტები და მიაწოდოს სტრუქტურული ინფორმაცია. კონკრეტული ტრანსკრიპტების ნიმუში.
ამჟამად, ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობის ტექნოლოგია ფართოდ გამოიყენება აგრონომიაში, მედიცინაში და სხვა კვლევით სფეროებში, მათ შორის ცხოველებისა და მცენარეების განვითარების რეგულირებაში, გარემოსდაცვითი ადაპტაციის, იმუნური ურთიერთქმედების, გენების ლოკალიზაციის, სახეობების გენეტიკური ევოლუციისა და სიმსივნისა და გენეტიკური დაავადებების გამოვლენაში.
-
მეტაგენომიკა (NGS)
ეს ანალიზის პლატფორმა შექმნილია თოფის მეტაგენომიური მონაცემების ანალიზისთვის მრავალწლიანი გამოცდილების საფუძველზე.იგი მოიცავს ინტეგრირებულ სამუშაო პროცესს, რომელიც შეიცავს სხვადასხვა საყოველთაოდ საჭირო მეტაგენომიკურ ანალიზს, მათ შორის მონაცემთა დამუშავებას, სახეობების დონის კვლევებს, გენის ფუნქციის დონის კვლევებს, მეტაგენომის ბინირებას და ა.შ. , პარამეტრის დაყენება, პერსონალიზებული ფიგურების გენერირება და ა.შ.
-
LncRNA
გრძელი არაკოდიციური რნმ (lncRNA) არის 200 ნტ-ზე მეტი სიგრძის ტრანსკრიპტების ტიპი, რომლებსაც არ შეუძლიათ ცილების კოდირება.აკუმულაციური მტკიცებულებები ვარაუდობენ, რომ lncRNA-ების უმეტესობა ფუნქციონალურია.მაღალი გამტარუნარიანობის თანმიმდევრობის ტექნოლოგიები და ბიოინფორმატიული ანალიზის ხელსაწყოები გვაძლევს ძალას, გამოვავლინოთ lncRNA თანმიმდევრობები და პოზიციონირების ინფორმაცია უფრო ეფექტურად და მიგვიყვანს აღმოვაჩინოთ lncRNAs გადამწყვეტი მარეგულირებელი ფუნქციებით.BMKCloud ამაყობს, რომ ჩვენს მომხმარებლებს სთავაზობს lncRNA თანმიმდევრობის ანალიზის პლატფორმას სწრაფი, საიმედო და მოქნილი lncRNA ანალიზის მისაღწევად.
-
GWAS
გენომის მასშტაბური ასოციაციის კვლევა (GWAS) მიზნად ისახავს გენეტიკური ვარიანტების (გენოტიპის) იდენტიფიცირებას, რომლებიც დაკავშირებულია სპეციფიკურ მახასიათებლებთან (ფენოტიპთან).GWA კვლევები იკვლევს გენეტიკურ მარკერებს დიდი რაოდენობის ინდივიდების მთლიან გენომზე და პროგნოზირებს გენოტიპ-ფენოტიპის ასოციაციებს სტატისტიკური ანალიზით პოპულაციის დონეზე.მთლიანი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობა პოტენციურად შეუძლია აღმოაჩინოს ყველა გენეტიკური ვარიანტი.ფენოტიპურ მონაცემებთან ერთად, GWAS შეიძლება დამუშავდეს ფენოტიპთან დაკავშირებული SNP-ების, QTL-ების და კანდიდატი გენების იდენტიფიცირებისთვის, რაც მტკიცედ უჭერს მხარს თანამედროვე ცხოველების/მცენარეების მოშენებას.SLAF არის საკუთარი ხელით შემუშავებული გენომის თანმიმდევრობის გამარტივებული სტრატეგია, რომელიც აღმოაჩენს გენომის მასშტაბით განაწილებულ მარკერებს, SNP.ეს SNPs, როგორც მოლეკულური გენეტიკური მარკერები, შეიძლება დამუშავდეს მიზნობრივი მახასიათებლების ასოციაციის კვლევებისთვის.ეს არის ხარჯთეფექტური სტრატეგია გენეტიკური ვარიაციების კომპლექსური მახასიათებლების იდენტიფიცირებისთვის.
-
Nanopore სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპტომიკა
ორგანიზმებში რთული და ცვლადი ალტერნატიული იზოფორმები მნიშვნელოვანი გენეტიკური მექანიზმია გენის ექსპრესიისა და ცილების მრავალფეროვნების რეგულირებისთვის.ტრანსკრიპტის სტრუქტურების ზუსტი იდენტიფიკაცია არის გენის ექსპრესიის რეგულირების შაბლონების სიღრმისეული შესწავლის საფუძველი.Nanopore sequencing პლატფორმამ წარმატებით მიიყვანა ტრანსკრიპტომიური კვლევა იზოფორმის დონეზე.ეს საანალიზო პლატფორმა შექმნილია Nanopore პლატფორმაზე გენერირებული RNA-Seq მონაცემების გასაანალიზებლად საცნობარო გენომის საფუძველზე, რომელიც აღწევს ხარისხობრივ და რაოდენობრივ ანალიზებს როგორც გენის დონეზე, ასევე ტრანსკრიპტების დონეზე.
-
ცირკ-რნმ
წრიული რნმ (circRNA) არის არაკოდიციური რნმ-ის ტიპი, რომელიც ახლახან აღმოჩნდა, რომ თამაშობს სასიცოცხლო როლს მარეგულირებელ ქსელებში, რომლებიც მონაწილეობენ განვითარებაში, გარემოს წინააღმდეგობას და ა.შ. განსხვავდება ხაზოვანი რნმ-ის მოლეკულებისგან, მაგ. mRNA, lncRNA, 3' და 5'. ცირკნმ-ის ბოლოები გაერთიანებულია, რათა შექმნან წრიული სტრუქტურა, რომელიც იცავს მათ ეგზონუკლეაზას მონელებისგან და უფრო სტაბილურია, ვიდრე ხაზოვანი რნმ-ის უმეტესობა.CircRNA-ს აქვს სხვადასხვა ფუნქციები გენის ექსპრესიის რეგულირებაში.CircRNA-ს შეუძლია შეასრულოს როგორც ceRNA, რომელიც აკავშირებს miRNA-ს კონკურენტულად, რომელიც ცნობილია როგორც miRNA ღრუბელი.CircRNA თანმიმდევრობის ანალიზის პლატფორმა აძლიერებს circRNA სტრუქტურისა და გამოხატვის ანალიზს, სამიზნე პროგნოზს და ერთობლივ ანალიზს რნმ-ის სხვა ტიპის მოლეკულებთან
