მიკრობული
ბაქტერიების თავსებადობა და ბიოქართან იმობილიზაცია აუმჯობესებს ტებუკონაზოლის დეგრადაციას, ნიადაგის მიკრობიომის შემადგენლობას და ფუნქციონირებას
სრულმეტრაჟიანი 16S ამპლიკონის თანმიმდევრობა |PacBio HiFi |ალფა მრავალფეროვნება |ბეტა მრავალფეროვნება
ამ კვლევაში, სრულმეტრაჟიანი 16S ამპლიკონის თანმიმდევრობა PacBio-ს მიერ და ბიოინფორმატიული ანალიზი მოწოდებული იქნა Biomarker Technologies-ის მიერ.
მაჩვენებლები
ბიოკარით იმობილიზებული ტებუკონაზოლის დეგრადირებადი ბაქტერია Alcaligenes faecalis WZ-2 შესწავლილი იყო ბიოდეგრადაციის ეფექტურობაზე და ზემოქმედებაზე ტებუკონაზოლით დაბინძურებულ ნიადაგზე თავისუფალ დეგრადირებად შტამთან WZ-2-თან შედარებით.
1. ბიოქარ-იმობილიზებული WZ-2 აჩვენა ტებუკონაზოლის უფრო ეფექტური დეგრადაცია თავისუფალ WZ-2-თან შედარებით ტებუკონაზოლის ნახევარგამოყოფის პერიოდის შემცირებით ნიადაგში 18,7 დღიდან 13,3 დღემდე.
2. ბიოქარ-იმობილიზებულმა WZ-2-მა შეძლო აღედგინა ნიადაგის მიკრობული ფერმენტის აქტივობა, მათ შორის ურეაზა, დეჰიდროგენაზა და ინვერტაზა და ა.შ.
3. მიკრობული პროფილი ბიოკარდიუმით იმობილიზებულ WZ-2 დამუშავებულ ნიადაგში, რომელიც განისაზღვრება სრულმეტრაჟიანი 16S თანმიმდევრობით, მტკიცედ ამტკიცებს, რომ ამ სისტემას შეუძლია აღადგინოს ნიადაგის ჯანმრთელობა ტებუკონაზოლით დაბინძურების პირობებში ბაქტერიული საზოგადოების სტრუქტურის გაუმჯობესებით.
ექსპერიმენტი (თანმიმდევრობა დაკავშირებულია)
დაჯგუფება: CK: ბუნებრივი ნიადაგი;T: ტებუკონაზოლით გაჟღენთილი ნიადაგი;S: ტებუკონაზოლი შეიცავდა ნიადაგს თავისუფალი შტამით WZ-2;ძვ.წ.: ტებუკონაზოლი შეიცავდა ნიადაგს ბიოქართან;BCS: ტებუკონაზოლი შეიცავდა ნიადაგს ბიოკარით იმობილიზებული WZ-2-ით.
სინჯის აღება: ნიადაგის მთლიანი დნმ-ის ექსტრაქცია გაძლიერებულია 16S rDNA პრაიმერებით
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) და 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),სრულმეტრაჟიანი 16S rDNA-ს მოხსენიება
თანმიმდევრობის პლატფორმა: PacBio RS II
თანმიმდევრობის სტრატეგია: კითხულობს CCS HIFI
Მონაცემთა ანალიზი:BMKCloudბიოინფორმატიული პლატფორმა ოქროს თევზს აქცევს თევზის ფიზიოლოგიისა და ევოლუციის შესანიშნავ გენეტიკური მოდელის სისტემას.
შედეგი
ნიადაგის მიკრობული საზოგადოების სტრუქტურა განისაზღვრა 16S rDNA თანმიმდევრობით.OTU სიმდიდრისა და ალფა მრავალფეროვნების ინდექსი, Chao1, Ace, Shannon და Simpson ინდექსების ჩათვლით შეფასდა თითოეულ სისტემაში სახეობრივი მრავალფეროვნების გამოსავლენად.60 დღის ინკუბაციის შემდეგ ყველა ინდექსმა აჩვენა მსგავსი ტენდენცია, ანუ ტებუკონაზოლმა შეიძლება გამოიწვიოს ნიადაგის სახეობების სიმდიდრისა და მრავალფეროვნების შემცირება.თუმცა, WZ-2 შტამის დამატებით, ნიადაგის ბაქტერიების საზოგადოება ნაწილობრივ იქნა აღდგენილი როგორც სიმდიდრის, ისე მრავალფეროვნების თვალსაზრისით.შეზღუდული განსხვავება დაფიქსირდა BC-ს, BCS-სა და CK-ს შორის, რაც მიუთითებს იმაზე, რომ ბიოქარი და ბიოკარდიით იმობილიზებული WZ-2-ს შეუძლია ეფექტურად აღადგინოს ნიადაგის ბიოლოგიური ჯანმრთელობა.
ამ კვლევაში გამოყენებული იყო არაწონილი წყვილი ჯგუფის მეთოდი არითმეტიკული საშუალებებით (UPGMA) ჯგუფებს შორის ბეტა მრავალფეროვნების საჩვენებლად.როგორც ნაჩვენებია შემდეგ სურათზე, BC, BSC და CK იზიარებდნენ მიკრობული შემადგენლობის უფრო მსგავს ნიმუშს T და S ჯგუფთან შედარებით, რაც შემდგომში მიუთითებს, რომ ბიოქარის დანერგვა ტებუკონაზოლით დაბინძურებულ ნიადაგის ბიორემედიაციაში შეიძლება დიდწილად გააადვილოს მიკრობული საზოგადოების აღდგენა ნიადაგში.
ფიგურა.ბაქტერიული საზოგადოების UPGMA კლასტერირება ფენის დონეზე სხვადასხვა მკურნალობის ქვეშ
მითითება
Sun, Tong და სხვ.„ბაქტერიების თავსებადობამ და ბიოჩართან იმობილიზაციამ გააუმჯობესა ტებუკონაზოლის დეგრადაცია, ნიადაგის მიკრობიომის შემადგენლობა და ფუნქციონირება“.ჟურნალი საშიში მასალები398 (2020): 122941.
სიახლეები და მაჩვენებლები მიზნად ისახავს Biomarker Technologies-თან უახლესი წარმატებული შემთხვევების გაზიარებას, ახალი სამეცნიერო მიღწევების და ასევე კვლევის დროს გამოყენებული გამორჩეული ტექნიკის აღბეჭდვას.
გამოქვეყნების დრო: იან-08-2022