BMKCloud Log in
ბანერი-03

სიახლეები

გენომი

Nature_Communications_Logo

ბიომასის მოსავლის Miscanthus lutarioriparius გენომის ქრომოსომული მასშტაბის შეკრება და ანალიზი

ნანოფორების თანმიმდევრობა |ილუმინა |Hi-C |რნმ-სეკვევენირება |ფილოგენეზი

ამ კვლევაში, Biomarker Technologies-მა უზრუნველყო ტექნიკური მხარდაჭერა Nanopore თანმიმდევრობის, გენომის de novo ასამბლეის, Hi-C დახმარებით შეკრების შესახებ და ა.შ.

Აბსტრაქტული

მისკანთუსირიზომატურ მრავალწლოვან მცენარეს აქვს ბიოენერგიის წარმოების დიდი პოტენციალი მისი მაღალი ბიომასისა და სტრესის ტოლერანტობის გამო.ჩვენ ვახსენებთ ქრომოსომის მასშტაბის შეკრებასMiscanthus lutarioripariusგენომი Oxford Nanopore თანმიმდევრობის და Hi-C ტექნოლოგიების კომბინაციით.2.07-გბ ასამბლეა მოიცავს გენომის 96.64%-ს, კონტიგი N50 1.71 მბ.ცენტრომერული და ტელომერული თანმიმდევრობები იკრიბება 19-ვე ქრომოსომისთვის და მე-10 ქრომოსომისთვის.M. lutarioriparius-ის ალოტეტრაპლოიდური წარმოშობა დადასტურებულია ცენტრომერული თანამგზავრის გამეორებების გამოყენებით.ნათლად არის ნაჩვენები ტეტრაპლოიდური გენომის სტრუქტურა და რამდენიმე ქრომოსომული გადაწყობა სორგოსთან შედარებით.გენების ტანდემი დუბლიკატიM. lutarioripariusფუნქციურად გამდიდრებულია არა მხოლოდ სტრესის რეაქციასთან დაკავშირებული თვალსაზრისით, არამედ უჯრედის კედლის ბიოსინთეზით.გენების ოჯახები, რომლებიც დაკავშირებულია დაავადების წინააღმდეგობასთან, უჯრედის კედლის ბიოსინთეზთან და ლითონის იონების ტრანსპორტთან, მნიშვნელოვნად გაფართოვდა და განვითარდა.ამ ოჯახების გაფართოება შეიძლება იყოს მნიშვნელოვანი გენომიური საფუძველი მისი შესანიშნავი თვისებების გასაძლიერებლადM. lutarioriparius.

გენომის შეკრების ძირითადი სტატისტიკა

სიახლე-1
სიახლე-2

ფიგურა.M. lutarioriparius გენომის შეკრების მიმოხილვა

სიახლეები და მაჩვენებლები მიზნად ისახავს Biomarker Technologies-თან უახლესი წარმატებული შემთხვევების გაზიარებას, ახალი სამეცნიერო მიღწევების და ასევე კვლევის დროს გამოყენებული გამორჩეული ტექნიკის აღბეჭდვას.


გამოქვეყნების დრო: იან-05-2022

გამოგვიგზავნეთ თქვენი შეტყობინება: