გენომის მასშტაბური ასოციაციის კვლევა (GWAS) მიზნად ისახავს გენეტიკური ვარიანტების (გენოტიპის) იდენტიფიცირებას, რომლებიც დაკავშირებულია სპეციფიკურ მახასიათებლებთან (ფენოტიპთან).GWA კვლევები იკვლევს გენეტიკურ მარკერებს დიდი რაოდენობის ინდივიდების მთლიან გენომზე და პროგნოზირებს გენოტიპ-ფენოტიპის ასოციაციებს სტატისტიკური ანალიზით პოპულაციის დონეზე.მთლიანი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობა პოტენციურად შეუძლია აღმოაჩინოს ყველა გენეტიკური ვარიანტი.ფენოტიპურ მონაცემებთან ერთად, GWAS შეიძლება დამუშავდეს ფენოტიპთან დაკავშირებული SNP-ების, QTL-ების და კანდიდატი გენების იდენტიფიცირებისთვის, რაც ძლიერ მხარს უჭერს თანამედროვე ცხოველების/მცენარეების მოშენებას.SLAF არის საკუთარი ხელით შემუშავებული გენომის თანმიმდევრობის გამარტივებული სტრატეგია, რომელიც აღმოაჩენს გენომის მასშტაბით განაწილებულ მარკერებს, SNP.ეს SNPs, როგორც მოლეკულური გენეტიკური მარკერები, შეიძლება დამუშავდეს მიზნობრივი მახასიათებლების ასოციაციის კვლევებისთვის.ეს არის ხარჯთეფექტური სტრატეგია გენეტიკური ვარიაციების კომპლექსური მახასიათებლების იდენტიფიცირებისთვის.
