გენომის მასშტაბური ასოციაციის ანალიზი
1.მომსახურების უპირატესობები
● უხვი პროექტის შემთხვევები: დაარსებიდან 2009 წელს BMKGENE-მ დაასრულა ასობით სახეობის პროექტი პოპულაციის GWAS კვლევაში, დაეხმარა მკვლევარებს 100-ზე მეტი სტატიის გამოქვეყნებაში და კუმულაციური ზემოქმედების ფაქტორი 500-ს მიაღწია.
● პროფესიონალი ანალიტიკოსები.
● ანალიზის მოკლე ციკლი.
● ზუსტი მონაცემების მოპოვება.
2. სერვისის სპეციფიკაციები
| ტიპი | მოსახლეობის მასშტაბი | თანმიმდევრობის სტრატეგია და სიღრმე |
| SLAF-GWAS | ნიმუშის ნომერი ≥200 | გენომის ზომა < 400 მ, ref-გენომით, რეკომენდებულია WGS |
| გენომის ზომა ≤ 1G, 100K ტეგები და 10X | ||
| 1G ≤ გენომის ზომა ≤ 2G, 200K ტეგები და 10X | ||
| გენომის ზომა > 2G, 300K ტეგები და 10X | ||
| WGS-GWAS | ნიმუშის ნომერი ≥200 | 10X თითოეული ნიმუშისთვის |
3. მასალის შერჩევა
სხვადასხვა ჯიშები, ქვესახეობები, ლანდშაფტები/გენბანკები/შერეული ოჯახები/ველური რესურსები
სხვადასხვა ჯიშები, ქვესახეობები, ლანდშაფტები
ნახევრად-სიბი ოჯახი/სრული-სიბი ოჯახი/ველური რესურსები
4. ბიოინფორმაციული ანალიზი
● გენომის მასშტაბური ასოციაციის ანალიზი
● მნიშვნელოვანი SNP-ის ანალიზი და სკრინინგი
● კანდიდატი გენის ფუნქციური ანოტაცია
5. სერვისის სამუშაო ნაკადი
ექსპერიმენტის დიზაინი
ნიმუშის მიწოდება
რნმ-ის ექსტრაქცია
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
Მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვის შემდგომი მომსახურება
ა.ფენოტიპი QC
სიხშირის განაწილების ჰისტოგრამა
ფენოტიპის სტატისტიკა
ბ.ასოციაციის ანალიზი (მოდელი: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ ნაკვეთი
მანჰეტენის ნაკვეთი
| წელიწადი | ჟურნალი | IF | სათაური |
| 2022 წელი | NC | 17.69 | გიგა-ქრომოსომებისა და გიგა-გენომის ხის პეონი Paeonia ostii-ის გენომის საფუძველი |
| 2015 წელი | NP | 7.43 | მოშინაურების კვალი ამაგრებს აგრონომიული მნიშვნელობის გენომურ რეგიონებს სოიაში |
| 2018 წელი | MP | 9.32 | რაფსის შეერთების მსოფლიო კოლექციის მთლიანი გენომის ხელახალი თანმიმდევრობა ავლენს მათი ეკოტიპური განსხვავების გენეტიკურ საფუძველს |
| 2022 წელი | HR | 7.29 | გენომის მასშტაბური ასოციაციის ანალიზი იძლევა მოლეკულურ შეხედულებებს საზამთროს თესლის ზომის ბუნებრივ ცვალებადობაზე |
