სოკოს გენომი
სერვისის უპირატესობები
● მრავალი თანმიმდევრობის სტრატეგია ხელმისაწვდომია სხვადასხვა კვლევის მიზნებისთვის
● დიდი გამოცდილება სოკოების გენომის აწყობაში 10000-ზე მეტი პენის სრული გენომით აწყობილი.
● გაყიდვის შემდგომი ტექნიკური მხარდაჭერის პროფესიონალი გუნდი, რომელიც ასრულებს უფრო კონკრეტულ კვლევას.
სერვისის სპეციფიკაციები
| სერვისი | თანმიმდევრობის სტრატეგია | ხარისხი გარანტირებულია | შემობრუნების სავარაუდო დრო |
| სოკოს ჯარიმა რუკა | Illumina 50X + Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 სამუშაო დღე |
| PacBio HiFi 30X | |||
| სოკოს პენე-სრული რუკა | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | ქრომოსომის დამაგრების კოეფიციენტი >90% | 45 სამუშაო დღე |
ბიოინფორმატიკის ანალიზები
● ნედლი მონაცემთა ხარისხის კონტროლი
● გენომის აწყობა
● გენომის კომპონენტის ანალიზი
● გენის ფუნქციის ანოტაცია
● შედარებითი გენომიური ანალიზი
ნიმუშის მოთხოვნები და მიწოდება
ნიმუშის მოთხოვნები:
ამისთვისდნმ-ის ექსტრაქტები:
| ნიმუშის ტიპი | თანხა | კონცენტრაცია | სიწმინდე |
| დნმ-ის ექსტრაქტები | ＞ 1.2 მკგ | ＞ 20 ნგ/მკლ | OD260/280= 1.6-2.5 |
ქსოვილის ნიმუშებისთვის:
| ნიმუშის ტიპი | რეკომენდებული ნიმუშის მკურნალობა | ნიმუშის შენახვა და გადაზიდვა |
| უჯრედული სოკო | დააკვირდით საფუარს მიკროსკოპის ქვეშ და შეაგროვეთ ისინი ექსპონენციურ ფაზაში გადაიტანეთ კულტურა (შეიცავს დაახლოებით 3-4,5e9 უჯრედს) 1,5 ან 2 მლ ეპენდორფში.(გააჩერეთ ყინულზე) მილის ცენტრიფუგა 1 წუთის განმავლობაში 14000 გ-ზე, რათა შეგროვდეს ბაქტერიები და ფრთხილად ამოიღოთ სუპერნატანტი. დახურეთ მილი და გაყინეთ ბაქტერიები თხევად აზოტში მინიმუმ 1-3 საათის განმავლობაში.შეინახეთ ტუბი -80℃ მაცივარში. | ნიმუშები გაყინეთ თხევად აზოტში 3-4 საათის განმავლობაში და შეინახეთ თხევად აზოტში ან -80 გრადუსამდე ხანგრძლივ რეზერვაციამდე.საჭიროა ნიმუშის მიწოდება მშრალი ყინულით. |
| მაკრო სოკო | რეკომენდებულია ქსოვილის აქტიური ზრდის ფაზაში. ჩამოიბანეთ ქსოვილი ენდოტოქსინისგან თავისუფალი წყლით, შემდეგ 70% ეთონალით. შეინახეთ ნიმუში კრიო-ტუბებში. |
სერვისის სამუშაო ნაკადი
ნიმუშის მიწოდება
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
Მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვის შემდგომი მომსახურება
1.ცირკის დიაგრამა სოკოს გენომიურ კომპონენტებზე
2. შედარებითი გენომიკური ანალიზი: ფილოგენეტიკური ხე
