BMKGENE-მ უზრუნველჰყო სივრცითი ტრანსკრიპტომის თანმიმდევრობის სერვისები კვლევისთვის „STEEL საშუალებას იძლევა მაღალი გარჩევადობით განვსაზღვროთ სივრცითი-დროითი ტრანსკრიპტომიური მონაცემები“, რომელიც გამოქვეყნდა Briefings in Bioinformatics-ში.
ამ კვლევამ შემოგვთავაზა უკონტროლო და მრავალჯერადი სწავლაზე დაფუძნებული ალგორითმი, Spatial Transcriptome Cell typE კლასტერირება (STEEL), რომელიც განსაზღვრავს დომენებს სივრცული ტრანსკრიპტომიდან მარცვლების დაჯგუფებით, რომლებიც აჩვენებენ როგორც ძალიან მსგავს გენის ექსპრესიის პროფილებს, ასევე მჭიდრო სივრცით მანძილს გრაფიკების სახით.
STEEL-ის ყოვლისმომცველი შეფასება 10X Visium პლატფორმის სივრცითი ტრანსკრიპტომიური მონაცემთა ნაკრებებზე ცხადყოფს, რომ ის არა მხოლოდ აღწევს მაღალ გარჩევადობას თაგვის ტვინის მშვენიერი სტრუქტურების დასახასიათებლად, არამედ საშუალებას აძლევს ქსოვილის მრავალი სლაიდის ინტეგრირებას ინდივიდუალურად უფრო დიდში.
სივრცითი ტრანსკრიპტომის ტექნოლოგიების წინსვლასთან ერთად, ჩვენს მეთოდს ექნება დიდი გამოყენებადი დომენის იდენტიფიკაციისა და გენის გამოხატვის ატლასის რეკონსტრუქციაში.
დააწკაპუნეთაქრომ გაიგოთ მეტი ამ კვლევის შესახებ.
გამოქვეყნების დრო: ოქტ-20-2023