გამორჩეული პუბლიკაცია

ჩაუღრმავდით კვლევის სახეობების ველური მრავალფეროვნების შესწავლის პოტენციალს, რაც ასახულია BMKGENE-ის კლიენტების მნიშვნელოვანი შემთხვევით.ახლახან გამოქვეყნდა მცენარეთა ბიოტექნოლოგიის ჟურნალის წლევანდელ გამოცემაში, სტატია სათაურით „ქრომოსომის დონის Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield“ არის ღირებული მითითება.

ბრაზილიური რეზინის ხე (Hevea brasiliensis) მაღლა დგას, როგორც ძირითადი ბუნებრივი რეზინის წყარო.გასული საუკუნის განმავლობაში, ტრადიციული მეცხოველეობის მეთოდოლოგიებმა გამოიწვია რეზინის წარმოების შესანიშნავი ექვსჯერადი ზრდა.მიუხედავად ამისა, გენეტიკური ფსკერი, რომელიც პასუხისმგებელია რეზინის მოსავლიანობის პოტენციურ გაზრდაზე, იდუმალი რჩება.

ამ კვლევამ დაიწყო ველური რეზინის ხისთვის ქრომოსომის დონის გენომის შექმნა, Nanopore-ის ხანგრძლივი წაკითხული თანმიმდევრობის, Illumina NGS თანმიმდევრობის და Hi-C ტექნოლოგიის სინერგიის გამოყენებით.

პარალელურად, 147 გერპლაზმის რესურსი, რომელიც მოიცავს მაღალი მოსავლიანობის ვარიაციებს, ველურ შტამებს და მათთან დაკავშირებულ სახეობებს, შეიკრიბა მთელი გენომის ყოვლისმომცველი რეთანმიმდევრობისთვის (WGS) Illumina პლატფორმის გამოყენებით.შემდგომი თანმიმდევრობის მონაცემებმა გაიარა მკაცრი პოპულაციის გენეტიკური ანალიზი, რამაც შესაძლებელი გახადა პოპულაციის სტრუქტურის, მრავალფეროვნებისა და კავშირის დისბალანსის დისექცია.ამ ანალიზმა ნათელი მოჰფინა მოშინაურების ვარიაციებს პოპულაციებში.

შემდგომი გამოკვლევები მოიცავდა ანალიზს, რომელიც მოიცავს Fst, π, Tajima's D და LD, მიზნად ისახავს გამოავლინოს შერჩევის სიგნალები, რომლებიც წარმოიქმნება გაუმჯობესებული ლატექსის მოსავლიანობით, განსაკუთრებით ფოკუსირებულია Wickham-ის კლონებზე.

გენომის მასშტაბით ასოციაციის ანალიზში (GWAS) კულმინაციას მიაღწია, დაფიქსირდა მარკერები, რომლებიც დაკავშირებულია მოსავლიანობის მახასიათებლებთან და შემდგომში მოსავლიანობასთან დაკავშირებულ გენებთან.თავდაპირველმა ვალიდაციამ გამოავლინა გამორჩეული ტრანსკრიპციული აქტივობები სხვადასხვა მუტანტებში ორი ERF გენისთვის, რაც წინასწარ ხედავს მათ ფუნქციურ მნიშვნელობას.შემდგომი დადასტურება იგეგმება მომავალი კვლევის ფარგლებში.

BMKGENE ამაყობს იმით, რომ წვლილი შეაქვს ამ დიდი პოპულაციის გენომის ვრცელ გადანაწილებაში, ბიოინფორმატიკის ანალიზში მნიშვნელოვან როლთან ერთად.ჩვენი დიდი გამოცდილება მოიცავს NGS/TGS თანმიმდევრობას და მულტიომიკური ბიოინფორმატიკის ანალიზს 1000+ სახეობაზე.ჩვენ მოუთმენლად ველით თქვენთან პარტნიორობის პერსპექტივას თქვენს მომავალ პროექტებზე.

დააწკაპუნეთ აქშეიტყვეთ მეტი ამ კვლევის შესახებ