●პლატფორმები:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten და BGI-DNB-T7
●თანმიმდევრობის რეჟიმები:PE50, PE100, PE150, PE250
●ბიბლიოთეკების ხარისხის კონტროლი თანმიმდევრობამდე
●მონაცემთა მიწოდების თანმიმდევრობა და QC:QC ანგარიშის და ნედლი მონაცემების მიწოდება fastq ფორმატში დემულტიპლექსირებისა და Q30 წაკითხვის გაფილტვრის შემდეგ.
●თანმიმდევრობის სერვისების მრავალფეროვნება:მომხმარებელს შეუძლია აირჩიოს თანმიმდევრობა ზოლის, ნაკადის უჯრედის ან მონაცემთა რაოდენობის მიხედვით.
●პლატფორმების მრავალფეროვნება:DNB ბიბლიოთეკების გადატანა შესაძლებელია Illumina პლატფორმებზე
●დიდი გამოცდილება Illumina-ს თანმიმდევრობის პლატფორმაზე:ათასობით დახურული პროექტით სხვადასხვა სახეობებით.
●თანმიმდევრობის QC ანგარიშის მიწოდება:ხარისხის მეტრიკებით, მონაცემთა სიზუსტით და თანმიმდევრობის პროექტის საერთო შესრულებით.
●სექსუალური თანმიმდევრობის პროცესი:შემობრუნების მოკლე დროით.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლი: ჩვენ ვახორციელებთ მკაცრ QC მოთხოვნებს, რათა გარანტირებული იყოს მუდმივი მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდება.
მონაცემთა რაოდენობა (X) | კონცენტრაცია (qPCR/nM) | მოცულობა |
X ≤ 50 გბ | ≥ 2 ნმ | ≥ 20 მლ |
50 გბ ≤ X < 100 გბ | ≥ 3 ნმ | ≥ 20 მლ |
X ≥ 100 გბ | ≥ 4 ნმ | ≥ 20 მლ |
Პლატფორმა | კონცენტრაცია (qPCR/nM) | მოცულობა |
HiSeq X ათი | ≥ 2 ნმ | ≥ 20 მლ |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 ნმ | ≥ 25 მლ |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 ნმ | ≥ 25 მლ |
NovaSeq X | ≥ 1,5 ნმ | ≥ 25 მლ |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 ნმ | ≥ 25 მლ |
გარდა კონცენტრაციისა და მთლიანი ოდენობისა, საჭიროა შესაბამისი პიკის ნიმუშიც.
ბიბლიოთეკის ხარისხის ანგარიში მოწოდებულია თანმიმდევრობით, ბიბლიოთეკის რაოდენობისა და ფრაგმენტაციის შეფასებამდე.
ცხრილი 1. მონაცემების თანმიმდევრობის სტატისტიკა.
ნიმუში ID | BMKID | ნედლი კითხულობს | ნედლეული მონაცემები (bp) | სუფთა წაკითხვები (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
სურათი 1. ხარისხის განაწილება წაკითხვის გასწვრივ თითოეულ ნიმუშში
სურათი 2. საბაზისო შინაარსის განაწილება
სურათი 3. წაკითხული შიგთავსის განაწილება თანმიმდევრულ მონაცემებში