ანალიზი ტრანსპოაზაზე ხელმისაწვდომ ქრომატინზე მაღალი გამტარუნარიანობის თანმიმდევრობით (ATAC-seq)
სერვისის უპირატესობები
● ყოვლისმომცველი ანალიზი: პროფესიონალური ანალიზის მილსადენი სხვადასხვა მორგებული ანალიზის საჭიროებების დასაკმაყოფილებლად;
● ვრცელი გამოცდილება: ასობით პროექტი წარმატებით დასრულდა ჯერჯერობით, ცხოველთა და მცენარეთა ნიმუშების ჩათვლით.
სერვისის სპეციფიკაციები
პლატფორმა: Illumina NovaSeq პლატფორმა
ბიბლიოთეკის ტიპი: ATAC-seq
რეკომენდებული მონაცემების გამომავალი: ≥20M წაკითხვა
ნიმუშის მოთხოვნები
ნიმუშის ტიპი: ქსოვილები, ცოცხალი უჯრედები ან გაყინული უჯრედები და ა.შ
უჯრედის ნომერი: ≥ 5×105უჯრედები, უჯრედების ზუსტი რიცხვი ექსპერიმენტის წარმატების გასაღებია;
ქსოვილის წონა: ≥ 200 მგ ახალი ქსოვილი;
სისხლი: ≥ 2 მლ
სერვისის სამუშაო ნაკადი
ექსპერიმენტის დიზაინი
ნიმუშის მიწოდება
დნმ-ის ექსტრაქცია
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
Მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვის შემდგომი მომსახურება
1. Heatmap ATAC-ზე კითხულობს განაწილებას TSS-ზე და მიმდებარე რეგიონებში (±3 kb)
2. ღია ქრომატინის რეგიონის განაწილება გენომის სხვადასხვა კომპონენტში
3. დიფერენციალური პიკის გამოძახება ჯგუფებს შორის
