Urutan RNA nukleus tunggal

Maju ing teknik tangkapan sel tunggal lan teknik konstruksi perpustakaan individu sing digabungake karo urutan throughput dhuwur ngidini sinau ekspresi gen ing basis sel-sel.Iki ngidini analisis sistem sing luwih jero lan lengkap babagan populasi sel sing kompleks, sing umume nyegah masking heterogenitas kanthi njupuk rata-rata kabeh sel.

Nanging, sawetara sel ora cocog kanggo digawe dadi suspensi sel siji, mula metode persiapan sampel liyane - ekstraksi inti saka jaringan dibutuhake, yaiku, inti langsung diekstrak saka jaringan utawa sel lan disiapake dadi suspensi inti tunggal kanggo siji- urutan sel.

BMK nyedhiyakake layanan urutan RNA sel tunggal adhedhasar 10 × Genomics ChromiumTM.Layanan iki wis akeh digunakake ing studi babagan studi sing gegandhengan karo penyakit, kayata diferensiasi sel kekebalan, heterogenitas tumor, pangembangan jaringan, lsp.

Chip transkriptom spasial: 10 × Genomics

Platform: Platform Illumina NovaSeq

Hubungi Kita

Rincian Layanan

Bioinformatika

Asil Demo

Prinsip teknis

Isolasi inti digayuh kanthi 10 × Genomics ChromiumTM, sing kasusun saka sistem mikrofluida wolung saluran kanthi persimpangan ganda.Ing sistem iki, manik-manik gel kanthi barcode lan primer, enzim lan inti siji dienkapsulasi ing tetes lenga ukuran nanoliter, ngasilake Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Sawise GEM dibentuk, lisis sel lan release barcode ditindakake ing saben GEM.mRNA sing mbalikke ditranskripsi menyang molekul cDNA karo 10 × barcode lan UMI, kang luwih tundhuk construction perpustakaan urutan standar.

Tisu ora cocok kanggo persiapan suspensi sel tunggal

Sel / jaringan	alesan
Tisu beku sing ora seger	Ora bisa entuk organisasi sing seger utawa disimpen suwe
Sel otot, Megakariosit, Lemak…	Dhiameter sel gedhe banget kanggo mlebu instrumen
Ati…	Banget pecah, ora bisa mbedakake sel siji
Sel neuron, Otak…	Luwih sensitif, gampang kaku, bakal ngganti asil urutan
Pankreas, Tiroid…	Sugih ing enzim endogen, mengaruhi produksi suspensi sel siji

Nukleus Tunggal vs Sel Tunggal

Nukleus tunggal	Sel tunggal
diameteripun sel Unlimited	Diameter sel: 10-40 μm
Bahan kasebut bisa dadi tisu beku	Bahan kasebut kudu dadi tissue seger
Tekanan rendah sel beku	Pangobatan enzim bisa nyebabake reaksi stres sel
Ora ana sel getih abang sing kudu dibusak	Sel getih abang kudu dibusak
Nuklir nyatakake bioinformatika	Kabèh sel mratelakake bioinformatika