-
Urutan Metatranscriptome
Urutan metatranskriptom ngenali ekspresi gen mikroba (loro eukariota lan prokariota) ing lingkungan alam (yaiku lemah, banyu, segara, feces, lan usus.). spesies, analisis pengayaan fungsional saka gen sing ditulis kanthi beda, lan liya-liyane.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Genome Jamur
Biomarker Technologies nyedhiyakake survey genom, genom alus lan genom jamur lengkap pene gumantung saka tujuan riset tartamtu.Urutan genom, perakitan lan anotasi fungsional bisa digayuh kanthi nggabungake urutan generasi sabanjure + Urutan generasi katelu kanggo entuk perakitan genom tingkat dhuwur.Teknologi Hi-C uga bisa digunakake kanggo nggampangake perakitan genom ing tingkat kromosom.
Platform:PacBio Sekuel II
Nanopore PromethION P48
Platform Illumina NovaSeq
-
Toolkits
BMKCloud minangka platform bioinformatik terkemuka sing nyedhiyakake solusi siji-mandeg kanggo program genomik, sing dipercaya banget dening peneliti ing macem-macem arena kalebu medis, pertanian, lingkungan, lan liya-liyane. , sumber daya komputasi, basis data umum, kursus online bioinformtik, lsp. BMKCloud nduweni macem-macem alat bioinformatika sing kerep digunakake kalebu anotasi gen, alat genetik evolusi, ncRNA, kontrol kualitas data, perakitan, keselarasan, ekstraksi data, mutasi, statistik, generator angka, urutan analisis, lsp.
-
Bakteri Genome Lengkap
Biomarker Technologies nyedhiyakake layanan urutan kanggo mbangun génom bakteri lengkap kanthi celah nol.Alur kerja utama saka konstruksi genom lengkap bakteri kalebu urutan generasi katelu, perakitan, anotasi fungsional lan analisis bioinformatik majeng sing nggayuh tujuan riset tartamtu.Profil genom bakteri sing luwih lengkap ngidini mbukak mekanisme dhasar sing ndasari proses biologis, sing uga bisa menehi referensi penting kanggo riset genomik ing spesies eukariotik sing luwih dhuwur.
Platform:Nanopore PromethION P48 + Platform Illumina NovaSeq
PacBio Sekuel II
-
RNA cilik
RNA cilik minangka jinis RNA non-coding sing cendhak kanthi dawa rata-rata 18-30 nt, kalebu miRNA, siRNA lan piRNA.RNA cilik iki wis dilaporake sacara massal melu macem-macem proses biologis kayata degradasi mRNA, inhibisi terjemahan, pembentukan heterochromatin, lan liya-liyane. platform analisis urutan kasusun saka analisis standar lan data mining majeng.Ing basis data RNA-seq, analisis standar bisa entuk identifikasi lan prediksi miRNA, prediksi gen target miRNA, anotasi lan analisis ekspresi.Analisis lanjut mbisakake telusuran lan ekstraksi miRNA sing disesuaikan, generasi diagram Venn, miRNA lan bangunan jaringan gen target.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS minangka platform analisis urutan ulang genom kabeh, sing dikembangake kanthi basis pengalaman sing sugih ing Biomarker Technologies.Platform sing gampang digunakake iki ngidini kiriman alur kerja analisis terpadu kanthi cepet kanthi nyetel sawetara parameter dhasar, sing cocog karo data urutan DNA sing diasilake saka platform Illumina lan platform urutan BGI.Platform iki disebarake ing server komputasi kinerja dhuwur, sing menehi daya analisis data sing efisien banget sajrone wektu sing winates.Penggalian data pribadi kasedhiya ing basis analisis standar, kalebu pitakon gen mutasi, desain primer PCR, lsp.
-
mRNA (Referensi)
Transkriptom minangka hubungan antara informasi genetik genomik lan proteome fungsi biologis.Regulasi tingkat transkripsi minangka cara regulasi organisme sing paling penting lan paling akeh diteliti.Urutan transkriptom bisa ngurutake transkriptom ing sembarang titik ing wektu utawa ing kahanan apa wae, kanthi resolusi akurat kanggo nukleotida siji. Bisa kanthi dinamis nggambarake tingkat transkripsi gen, kanthi bebarengan ngenali lan ngitung transkrip langka lan normal, lan nyedhiyakake informasi struktural saka sampel transkrip tartamtu.
Saiki, teknologi urutan transkriptom wis akeh digunakake ing agronomi, obat-obatan lan lapangan riset liyane, kalebu regulasi pangembangan kewan lan tanduran, adaptasi lingkungan, interaksi kekebalan, lokalisasi gen, evolusi genetik spesies lan deteksi tumor lan penyakit genetik.
-
Metagenomik (NGS)
Platform analisis iki dirancang kanggo analisis data metagenomik shotgun adhedhasar pengalaman taun.Iki kalebu alur kerja terpadu sing ngemot macem-macem analisis metagenomik sing umum dibutuhake kalebu pangolahan data, studi tingkat spesies, studi tingkat fungsi gen, binning metagenome, lan liya-liyane. , setelan parameter, nggawe tokoh pribadi, etc.
-
LncRNA
Long non-coding RNAs (lncRNA) minangka jinis transkrip sing dawane luwih saka 200 nt, sing ora bisa ngode protein.Bukti akumulatif nuduhake manawa umume lncRNA bisa uga fungsional.Teknologi sekuensing throughput dhuwur lan alat analisa bioinformatik menehi daya kanggo mbukak urutan lncRNA lan informasi posisi kanthi luwih efisien lan nuntun kita nemokake lncRNA kanthi fungsi pangaturan sing penting.BMKCloud bangga nyedhiyakake platform analisis urutan lncRNA para pelanggan kanggo entuk analisis lncRNA sing cepet, dipercaya lan fleksibel.
-
GWAS
Studi asosiasi genom (GWAS) nduweni tujuan kanggo ngenali varian genetik (genotip) sing ana gandhengane karo sifat spesifik (fenotipe).Pasinaon GWA nyelidiki tandha-tandha genetik nyabrang kabeh genom saka jumlah gedhe individu lan prédhiksi asosiasi genotip-fenotip kanthi analisis statistik ing tingkat populasi.Resequencing genom kabeh bisa nemokake kabeh varian genetik.Gandheng karo data fenotipik, GWAS bisa diproses kanggo ngenali SNP sing gegandhengan karo fenotipe, QTL lan gen calon, sing ndhukung pembiakan kewan / tanduran modern.SLAF minangka strategi urutan genom sing disederhanakake sing dikembangake dhewe, sing nemokake marker sing disebarake genom, SNP.SNP iki, minangka marker genetik molekuler, bisa diproses kanggo studi asosiasi kanthi sipat sing ditarget.Iku strategi biaya-efektif kanggo ngenali sipat Komplek gadhah variasi genetik.
-
Nanopore Transkriptomi lengkap
Isoform alternatif sing kompleks lan variabel ing organisme minangka mekanisme genetik sing penting kanggo ngatur ekspresi gen lan keragaman protein.Identifikasi struktur transkrip sing akurat minangka basis kanggo sinau kanthi jero babagan pola regulasi ekspresi gen.Platform sekuensing nanopore wis kasil nggawa studi transkriptomik menyang tingkat isoform.Platform analisis iki dirancang kanggo nganalisa data RNA-Seq sing digawe ing platform Nanopore ing basis genom referensi, sing entuk analisis kualitatif lan kuantitatif ing tingkat gen lan tingkat transkrip.
-
circ-RNA
Circular RNA(circular RNA) yaiku jinis RNA non-coding, sing saiki ditemokake nduweni peran penting ing jaringan pangaturan sing melu ngembangake, resistensi lingkungan, lan liya-liyane. Beda karo molekul RNA linier, contone mRNA, lncRNA, 3′ lan 5′ ujung circRNA digabung dadi siji kanggo mbentuk struktur bunder, sing nylametake saka pencernaan exonuclease lan luwih stabil tinimbang RNA linier.CircRNA ditemokake duwe macem-macem fungsi kanggo ngatur ekspresi gen.CircRNA bisa nindakake minangka ceRNA, sing ngiket miRNA kanthi kompetitif, dikenal minangka spons miRNA.Platform analisis urutan CircRNA nguatake struktur circRNA lan analisis ekspresi, prediksi target lan analisis gabungan karo jinis molekul RNA liyane
