-
Urutan Imunopresipitasi Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq nyedhiyakake profiling genom saka target DNA kanggo modifikasi histon, faktor transkripsi, lan protein sing ana gandhengane karo DNA liyane.Iki nggabungake selektivitas chromatin immuno-precipitation (ChIP) kanggo mbalekake kompleks protein-DNA spesifik, kanthi kekuwatan urutan generasi sabanjure (NGS) kanggo urutan throughput dhuwur saka DNA sing wis pulih.Kajaba iku, amarga kompleks protein-DNA ditemokake saka sel urip, situs pengikat bisa dibandhingake ing macem-macem jinis sel lan jaringan, utawa ing kahanan sing beda.Aplikasi kalebu saka regulasi transkripsi nganti jalur perkembangan nganti mekanisme penyakit lan liya-liyane.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Metagenomic Sequencing -NGS
Metagenome nuduhake koleksi materi genetik total saka komunitas campuran organisme, kayata metagenom lingkungan, metagenom manungsa, lan sapiturute. Ngandhut genom saka mikroorganisme sing bisa dibudidaya lan ora bisa diolah.Urutan metagenomik minangka alat molekuler sing digunakake kanggo nganalisis bahan genom campuran sing diekstrak saka conto lingkungan, sing nyedhiyakake informasi rinci babagan keragaman lan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen fungsional lan jaringan korelasi karo faktor lingkungan.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics minangka alat molekuler sing digunakake kanggo nganalisa bahan genom campuran sing diekstrak saka conto lingkungan, sing nyedhiyakake informasi rinci babagan keragaman lan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen fungsional lan jaringan korelasi karo faktor lingkungan, lsp. Platform urutan Nanopore bubar ngenalaken kanggo studi metagenomic.Kinerja sing luar biasa ing dawa maca umume ningkatake analisis metagenomik aliran mudhun, utamane perakitan metagenome.Njupuk kaluwihan saka maca-dawa, sinau metagenomic basis Nanopore bisa kanggo entuk perakitan luwih terus-terusan mbandingaken karo metagenomic shot-gun.Wis diterbitake yen metagenomics basis Nanopore kasil ngasilake genom bakteri lengkap lan tertutup saka microbiomes (Moss, EL, et. al,Bioteknologi Alam, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
Urutan genom bisulfit kabèh
Metilasi DNA ing posisi kaping lima ing sitosin (5-mC) nduweni pengaruh dhasar ing ekspresi gen lan aktivitas seluler.Pola metilasi abnormal wis digandhengake karo sawetara kahanan lan penyakit, kayata kanker.WGBS wis dadi standar emas kanggo nyinaoni metilasi genom kanthi resolusi basa tunggal.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Pengujian kanggo Kromatin sing Bisa Diakses Transposase kanthi Sekuensing Throughput Tinggi (ATAC-seq)
ATAC-seq minangka cara sekuensing dhuwur kanggo analisis aksesibilitas kromatin genom, sing penting kanggo kontrol epigenetik global ekspresi gen.Adaptor urutan dilebokake menyang wilayah kromatin sing mbukak kanthi transposase Tn5 hiperaktif.Sawise amplifikasi PCR, perpustakaan urutan dibangun.Kabeh wilayah kromatin sing mbukak bisa diduweni ing kondisi spasi-wektu tartamtu, ora mung diwatesi ing situs pengikat faktor transkripsi, utawa wilayah sing diowahi histone tartamtu.
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit ing rRNA 16S lan 18S sing ngemot wilayah sing paling konservasi lan hiper-variabel minangka sidik jari molekul sing sampurna kanggo identifikasi organisme prokariotik lan eukariotik.Mupangat saka urutan, amplicons iki bisa ditargetake adhedhasar bagean sing dikonservasi lan wilayah hiper-variabel bisa diciriake kanthi lengkap kanggo identifikasi mikroba sing nyumbang kanggo studi sing nyakup analisis keragaman mikroba, taksonomi, filogeni, lsp. Molekul tunggal wektu nyata (SMRT) ) urutan platform PacBio mbisakake njupuk saka Highly akurat dawa maos, kang bisa nutupi full-dawa amplicons (approx. 1,5 Kb).Pandangan babagan bidang genetika nambah resolusi ing anotasi spesies ing komunitas bakteri utawa jamur.
Platform:PacBio Sekuel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
Urutan amplikon 16S/18S/ITS nduweni tujuan kanggo mbukak filogeni, taksonomi, lan kelimpahan spesies ing komunitas mikroba kanthi nyelidiki produk PCR saka penanda genetik housekeeping sing ngemot bagean sing bisa diomongake lan hypervariable.Introduksi sidik jari molekul sing sampurna iki dening Woeses et al, (1977) nguatake profil mikrobioma tanpa isolasi.Urutan 16S (bakteri), 18S (jamur) lan spacer transkripsi internal (ITS, jamur) ngidini identifikasi spesies sing akeh banget uga spesies langka lan ora dingerteni.Teknologi iki wis dadi alat sing akeh diterapake lan utama kanggo ngenali komposisi mikroba diferensial ing macem-macem lingkungan, kayata tutuk manungsa, usus, feces, lsp.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Bakteri lan Jamur Kabèh Genome Re-Sequencing
Urutan ulang genom kabeh bakteri lan jamur minangka alat kritis kanggo ngrampungake génom bakteri lan jamur sing dikenal, uga kanggo mbandhingake pirang-pirang génom utawa peta génom organisme anyar.Penting banget kanggo ngurutake kabeh genom bakteri lan jamur supaya bisa ngasilake genom referensi sing akurat, kanggo nindakake identifikasi mikroba lan studi genom komparatif liyane.
Platform:Illumina NovaSeq Platform
-
PacBio-Full-length 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Platform Amplicon (16S / 18S / ITS) dikembangake kanthi pengalaman pirang-pirang taun ing analisis proyek keragaman mikroba, sing ngemot analisis dhasar standar lan analisis pribadi: analisis dhasar nyakup isi analisis utama riset mikroba saiki, isi analisis sugih lan komprehensif, lan asil analisis ditampilake ing wangun laporan proyek;Isi analisis pribadi iku macem-macem.Sampel bisa dipilih lan paramèter bisa disetel kanthi fleksibel miturut laporan analisis dhasar lan tujuan riset, kanggo mujudake syarat pribadi.Sistem operasi Windows, prasaja lan cepet.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (Non-Referensi)
Njupuk data urutan Isoform Pacific Biosciences (PacBio) minangka input, App iki bisa ngenali urutan transkrip lengkap (tanpa perakitan).Kanthi pemetaan urutan full-length marang génom referensi, transkrip bisa dioptimalake dening gen dikenal, transkrip, wilayah coding, etc. Ing kasus iki, identifikasi luwih akurat saka struktur mRNA, kayata splicing alternatif, etc, bisa digayuh.Analisis gabungan karo data urutan transkriptom NGS mbisakake anotasi sing luwih lengkap lan kuantifikasi sing luwih akurat ing ekspresi ing tingkat transkrip, sing umume entuk manfaat saka ekspresi diferensial hilir lan analisis fungsional.
-
Ngurangi Representasi Bisulfit Sequencing (RRBS)
Riset metilasi DNA tansah dadi topik panas ing riset penyakit, lan ana hubungane karo ekspresi gen lan sifat fenotipik.RRBS minangka cara sing akurat, efisien lan ekonomi kanggo riset metilasi DNA.Pengayaan wilayah promotor lan pulau CpG kanthi pembelahan enzimatik (Msp I), digabungake karo urutan Bisulfite, nyedhiyakake deteksi metilasi DNA resolusi dhuwur.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan mRNA prokariotik
Urutan mRNA nguatake profil lengkap kabeh transkrip mRNA ing sel ing kahanan tartamtu.Teknologi mutakhir iki minangka alat sing kuat, mbukak profil ekspresi gen sing rumit, struktur gen, lan mekanisme molekuler sing ana gandhengane karo proses biologi sing beda-beda.Diadopsi sacara umum ing riset dhasar, diagnostik klinis, lan pangembangan obat, urutan mRNA nawakake wawasan babagan seluk-beluk dinamika seluler lan regulasi genetik.Pangolahan sampel mRNA prokariotik kita dicocogake kanggo transkriptom prokariotik, sing nglibatake penipisan rRNA lan persiapan perpustakaan arah.
Platform: Illumina NovaSeq X
