-
Urutan RNA nukleus tunggal
Maju ing teknik tangkapan sel tunggal lan teknik konstruksi perpustakaan individu sing digabungake karo urutan throughput dhuwur ngidini sinau ekspresi gen ing basis sel-sel.Iki ngidini analisis sistem sing luwih jero lan lengkap babagan populasi sel sing kompleks, sing umume nyegah masking heterogenitas kanthi njupuk rata-rata kabeh sel.
Nanging, sawetara sel ora cocog kanggo digawe dadi suspensi sel siji, mula metode persiapan sampel liyane - ekstraksi inti saka jaringan dibutuhake, yaiku, inti langsung diekstrak saka jaringan utawa sel lan disiapake dadi suspensi inti tunggal kanggo siji- urutan sel.
BMK nyedhiyakake layanan urutan RNA sel tunggal adhedhasar 10 × Genomics ChromiumTM.Layanan iki wis akeh digunakake ing studi babagan studi sing gegandhengan karo penyakit, kayata diferensiasi sel kekebalan, heterogenitas tumor, pangembangan jaringan, lsp.
Chip transkriptom spasial: 10 × Genomics
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan Genome Tanduran / Kewan Kabèh
Urutan ulang genom wutuh, uga dikenal minangka WGS, ngidini mutasi umum lan langka ing kabeh genom kalebu Polimorfisme Nukleotida Tunggal (SNP), Pambusakan Insertion (InDel), Variasi Struktur (SV), lan Variasi Nomer Salinan (CNV). ).SV nggawe bagean sing luwih gedhe saka basis variasi tinimbang SNP lan nduwe pengaruh sing luwih gedhe ing genom, sing nduwe pengaruh sing signifikan marang organisme urip.Resequencing sing dawa diwaca ngidini identifikasi pecahan gedhe lan variasi rumit sing luwih tepat amarga maca dawa nggawe luwih gampang kromosom nyebrang wilayah sing rumit kayata tandem repeats, wilayah sing sugih GC/AT, lan wilayah hiper-variabel.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Transkriptom Spasial BMKMANU S1000
Transkriptomi spasial ngadeg ing ngarep inovasi ilmiah, nguatake para peneliti kanggo nliti pola ekspresi gen sing rumit ing jaringan nalika njaga konteks spasial.Ing antarane macem-macem platform, BMKGene ngembangake Chip Transkriptom Spasial BMKManu S1000, kanthiresolusi ditingkatakesaka 5μM, tekan kisaran subselular, lan mbisakakesetelan resolusi multi-level.Chip S1000, sing nampilake udakara 2 yuta titik, nggunakake microwell sing dilapisi manik-manik sing diisi karo probe panangkepan barcode spasial.Pustaka cDNA, diperkaya karo barcode spasial, disiapake saka chip S1000 lan banjur diurutake ing platform Illumina NovaSeq.Kombinasi conto barcode spasial lan UMI njamin akurasi lan spesifik data sing digawe.Atribut unik chip BMKManu S1000 dumunung ing fleksibilitas, nawakake setelan resolusi multi-level sing bisa disetel kanthi apik kanggo jaringan lan tingkat detail sing beda.Kemampuan adaptasi iki ndadekake chip kasebut minangka pilihan sing luar biasa kanggo macem-macem studi transkriptomi spasial, njamin clustering spasial sing tepat kanthi gangguan minimal.
Nggunakake chip BMKManu S1000 lan teknologi transkriptomi spasial liyane, peneliti bisa entuk pangerten sing luwih apik babagan organisasi spasial sel lan interaksi molekuler kompleks sing kedadeyan ing jaringan, nyedhiyakake wawasan sing ora ana regane babagan mekanisme sing ndasari proses biologis ing macem-macem lapangan, kalebu. onkologi, neuroscience, biologi perkembangan, imunologi lan studi botani.
Platform: chip BMKManu S1000 lan Illumina NovaSeq
-
10x Transkriptom Spasial Visium Genomics
Transkriptomi spasial minangka teknologi canggih sing ngidini peneliti nyelidiki pola ekspresi gen ing jaringan nalika njaga konteks spasial.Salah sawijining platform sing kuat ing domain iki yaiku 10x Genomics Visium ditambah karo urutan Illumina.Prinsip 10X Visium dumunung ing chip khusus kanthi area panangkepan sing ditemtokake ing ngendi bagean jaringan diselehake.Wilayah panangkepan iki ngemot titik barcode, saben cocog karo lokasi spasial sing unik ing jaringan kasebut.Molekul RNA sing dijupuk saka jaringan banjur dilabeli karo pengenal molekul unik (UMI) sajrone proses transkripsi mbalikke.Titik barcode lan UMI iki mbisakake pemetaan spasial sing tepat lan kuantifikasi ekspresi gen ing resolusi sel siji.Kombinasi conto barcode spasial lan UMI njamin akurasi lan spesifik data sing digawe.Kanthi nggunakake teknologi Spatial Transcriptomics iki, peneliti bisa entuk pangerten sing luwih jero babagan organisasi spasial sel lan interaksi molekuler sing kompleks sing kedadeyan ing jaringan, menehi wawasan sing ora penting babagan mekanisme sing ndasari proses biologi ing pirang-pirang lapangan, kalebu onkologi, neurosains, biologi perkembangan, imunologi. , lan studi botani.
Platform: 10X Genomics Visium lan Illumina NovaSeq
-
Full-Length mRNA Sequencing-Nanopore
Nalika urutan mRNA basis NGS minangka alat serbaguna kanggo kuantifikasi ekspresi gen, katergantungan ing maca cekak mbatesi khasiat ing analisis transkriptomi sing kompleks.Urutan nanopore, ing sisih liya, nggunakake teknologi sing wis suwe diwaca, ngidini urutan transkrip mRNA lengkap.Pendekatan iki nggampangake eksplorasi komprehensif splicing alternatif, fusi gen, poli-adenilasi, lan kuantifikasi isoform mRNA.
Urutan nanopore gumantung marang sinyal listrik wektu nyata molekul nanopore.Dipandu dening protèin motor, DNA untai ganda ngiket karo protèin nanopore sing dilebokaké ing biofilm, ora bakal kenthel nalika ngliwati saluran nanopore ing prabédan voltase.Sinyal listrik khas sing diasilake dening basis beda ing untaian DNA dideteksi lan diklasifikasikake ing wektu nyata, nggampangake urutan nukleotida sing akurat lan terus-terusan.Pendekatan inovatif iki ngatasi watesan sing diwaca kanthi cendhak lan nyedhiyakake platform dinamis kanggo analisis genomik sing rumit, kalebu studi transkriptomi sing kompleks.
Platform: Nanopore Promethion P48
-
Urutan mRNA lengkap -PacBio
Nalika urutan mRNA basis NGS minangka alat serbaguna kanggo ngitung ekspresi gen, katergantungan ing maca cekak mbatesi panggunaan ing analisis transkriptomi sing kompleks.PacBio sequencing (Iso-Seq), ing sisih liya, nggunakake teknologi sing wis suwe diwaca, supaya bisa ngurutake transkrip mRNA lengkap.Pendekatan iki nggampangake eksplorasi komprehensif splicing alternatif, fusi gen lan poli-adenilasi sanajan dudu pilihan utama kanggo kuantifikasi ekspresi gen, amarga jumlah data sing dibutuhake.
Teknologi urutan PacBio gumantung marang urutan molekul siji, wektu nyata (SMRT), nyedhiyakake keuntungan sing beda kanggo njupuk transkrip mRNA kanthi lengkap.Pendekatan inovatif iki nyakup panggunaan pandu gelombang mode nol (ZMWs), sumur mikrofabrikasi sing mbisakake pengamatan wektu nyata aktivitas polimerase DNA sajrone urutan.Ing ZMW kasebut, polimerase DNA PacBio nyintesis untaian DNA pelengkap, ngasilake wacan dawa sing nyakup kabeh transkrip mRNA.Operasi PacBio ing mode Circular Consensus sequencing (CCS) nambah akurasi kanthi ngurutake molekul sing padha.Wacan HiFi sing digawe nduweni akurasi sing bisa dibandhingake karo NGS, luwih akeh nyumbang kanggo analisis lengkap lan dipercaya fitur transkriptomi kompleks.Platform: PacBio Sekuel II
-
Eukariotik mRNA Sequencing-Illumina
Urutan mRNA nguatake profil lengkap kabeh transkrip mRNA ing sel ing kahanan tartamtu.Teknologi mutakhir iki minangka alat sing kuat, mbukak profil ekspresi gen sing rumit, struktur gen, lan mekanisme molekuler sing ana gandhengane karo proses biologi sing beda-beda.Diadopsi sacara umum ing riset dhasar, diagnostik klinis, lan pangembangan obat, urutan mRNA nawakake wawasan babagan seluk-beluk dinamika seluler lan regulasi genetik.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Non-Referensi adhedhasar mRNA Sequencing-Illumina
Urutan mRNA nguatake profil lengkap kabeh transkrip mRNA ing sel ing kahanan tartamtu.Teknologi mutakhir iki minangka alat sing kuat, mbukak profil ekspresi gen sing rumit, struktur gen, lan mekanisme molekuler sing ana gandhengane karo proses biologi sing beda-beda.Diadopsi sacara umum ing riset dhasar, diagnostik klinis, lan pangembangan obat, urutan mRNA nawakake wawasan babagan seluk-beluk dinamika seluler lan regulasi genetik.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Long non-coding sequencing-Illumina
Long non-coding RNAs (lncRNAs) yaiku RNA sing luwih dawa tinimbang 200 nukleotida sing nduweni potensial pengkodean minimal lan minangka unsur penting ing RNA non-coding.Ditemokake ing nukleus lan sitoplasma, RNA iki nduweni peran penting ing regulasi epigenetik, transkripsi, lan pasca-transkripsi, sing negesake pentinge kanggo mbentuk proses seluler lan molekuler.Urutan LncRNA minangka alat sing kuat ing diferensiasi Sel, Ontogenesis, lan penyakit Manungsa.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Urutan RNA cilik-Illumina
Molekul RNA cilik (sRNA), dawane kurang saka 200 nukleotida, kalebu microRNAs (miRNAs), RNA interfering cilik (siRNAs), lan piwi-interacting RNAs (piRNAs).Antarane, miRNAs, watara 20-24 nukleotida dawane, utamané penting kanggo peran regulasi pivotal ing macem-macem proses seluler.Kanthi pola ekspresi spesifik jaringan lan spesifik panggung, miRNA nuduhake konservasi dhuwur ing macem-macem spesies.
Platform: Illumina NovaSeq
-
circRNA sequencing-Illumina
Sirkuler RNA sequencing (circRNA-seq) kanggo profil lan nganalisa sirkular RNA, kelas molekul RNA sing mbentuk puteran tertutup amarga acara splicing non-kanonik, nyediakake RNA iki karo stabilitas tambah.Nalika sawetara circRNA wis ditampilake tumindak minangka spons microRNA, sequestering microRNAs lan nyegah saka ngatur mRNA target, circRNAs liyane bisa sesambungan karo protein, modulasi ekspresi gen, utawa duwe peran ing proses seluler.Analisis ekspresi circRNA menehi wawasan babagan peran pangaturan molekul kasebut lan pentinge ing macem-macem proses seluler, tahap perkembangan, lan kahanan penyakit, nyumbang kanggo pemahaman sing luwih jero babagan kerumitan regulasi RNA ing konteks ekspresi gen.
-
Urutan transkrip kabeh - Illumina
Urutan transkriptome kabeh nawakake pendekatan lengkap kanggo nggawe profil molekul RNA sing beda-beda, nyakup loro coding (mRNA) lan RNA non-coding (lncRNA, circRNA, lan miRNA).Teknik iki njupuk transkriptom lengkap saka sel tartamtu ing wektu tartamtu, ngidini kanggo pangerten sakabehe proses seluler.Uga dikenal minangka "urutan RNA total," tujuane kanggo mbukak jaringan pangaturan sing rumit ing tingkat transkriptom, supaya analisa jero kayata RNA endogen (ceRNA) saingan lan analisis RNA gabungan.Iki nandhani langkah awal menyang karakterisasi fungsional, utamane kanggo mbukak jaringan pangaturan sing nglibatake interaksi ceRNA adhedhasar circRNA-miRNA-mRNA.
