-
Metagenomic Sequencing -NGS
Metagenome nuduhake koleksi materi genetik total saka komunitas campuran organisme, kayata metagenom lingkungan, metagenom manungsa, lan sapiturute. Ngandhut genom saka mikroorganisme sing bisa dibudidaya lan ora bisa diolah.Urutan metagenomik minangka alat molekuler sing digunakake kanggo nganalisis bahan genom campuran sing diekstrak saka conto lingkungan, sing nyedhiyakake informasi rinci babagan keragaman lan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen fungsional lan jaringan korelasi karo faktor lingkungan.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics minangka alat molekuler sing digunakake kanggo nganalisa bahan genom campuran sing diekstrak saka conto lingkungan, sing nyedhiyakake informasi rinci babagan keragaman lan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen fungsional lan jaringan korelasi karo faktor lingkungan, lsp. Platform urutan Nanopore bubar ngenalaken kanggo studi metagenomic.Kinerja sing luar biasa ing dawa maca umume ningkatake analisis metagenomik aliran mudhun, utamane perakitan metagenome.Njupuk kaluwihan saka maca-dawa, sinau metagenomic basis Nanopore bisa kanggo entuk perakitan luwih terus-terusan mbandingaken karo metagenomic shot-gun.Wis diterbitake yen metagenomics basis Nanopore kasil ngasilake genom bakteri lengkap lan tertutup saka microbiomes (Moss, EL, et. al,Bioteknologi Alam, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit ing rRNA 16S lan 18S sing ngemot wilayah sing paling konservasi lan hiper-variabel minangka sidik jari molekul sing sampurna kanggo identifikasi organisme prokariotik lan eukariotik.Mupangat saka urutan, amplicons iki bisa ditargetake adhedhasar bagean sing dikonservasi lan wilayah hiper-variabel bisa diciriake kanthi lengkap kanggo identifikasi mikroba sing nyumbang kanggo studi sing nyakup analisis keragaman mikroba, taksonomi, filogeni, lsp. Molekul tunggal wektu nyata (SMRT) ) urutan platform PacBio mbisakake njupuk saka Highly akurat dawa maos, kang bisa nutupi full-dawa amplicons (approx. 1,5 Kb).Pandangan babagan bidang genetika nambah resolusi ing anotasi spesies ing komunitas bakteri utawa jamur.
Platform:PacBio Sekuel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
Urutan amplikon 16S/18S/ITS nduweni tujuan kanggo mbukak filogeni, taksonomi, lan kelimpahan spesies ing komunitas mikroba kanthi nyelidiki produk PCR saka penanda genetik housekeeping sing ngemot bagean sing bisa diomongake lan hypervariable.Introduksi sidik jari molekul sing sampurna iki dening Woeses et al, (1977) nguatake profil mikrobioma tanpa isolasi.Urutan 16S (bakteri), 18S (jamur) lan spacer transkripsi internal (ITS, jamur) ngidini identifikasi spesies sing akeh banget uga spesies langka lan ora dingerteni.Teknologi iki wis dadi alat sing akeh diterapake lan utama kanggo ngenali komposisi mikroba diferensial ing macem-macem lingkungan, kayata tutuk manungsa, usus, feces, lsp.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Bakteri lan Jamur Kabèh Genome Re-Sequencing
Urutan ulang genom kabeh bakteri lan jamur minangka alat kritis kanggo ngrampungake génom bakteri lan jamur sing dikenal, uga kanggo mbandhingake pirang-pirang génom utawa peta génom organisme anyar.Penting banget kanggo ngurutake kabeh genom bakteri lan jamur supaya bisa ngasilake genom referensi sing akurat, kanggo nindakake identifikasi mikroba lan studi genom komparatif liyane.
Platform:Illumina NovaSeq Platform
-
Urutan Metatranscriptome
Urutan metatranskriptom ngenali ekspresi gen mikroba (loro eukariota lan prokariota) ing lingkungan alam (yaiku lemah, banyu, segara, feces, lan usus.). spesies, analisis pengayaan fungsional saka gen sing ditulis kanthi beda, lan liya-liyane.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Genome Jamur
Biomarker Technologies nyedhiyakake survey genom, genom alus lan genom jamur lengkap pene gumantung saka tujuan riset tartamtu.Urutan genom, perakitan lan anotasi fungsional bisa digayuh kanthi nggabungake urutan generasi sabanjure + Urutan generasi katelu kanggo entuk perakitan genom tingkat dhuwur.Teknologi Hi-C uga bisa digunakake kanggo nggampangake perakitan genom ing tingkat kromosom.
Platform:PacBio Sekuel II
Nanopore PromethION P48
Platform Illumina NovaSeq
-
Bakteri Genome Lengkap
Biomarker Technologies nyedhiyakake layanan urutan kanggo mbangun génom bakteri lengkap kanthi celah nol.Alur kerja utama saka konstruksi genom lengkap bakteri kalebu urutan generasi katelu, perakitan, anotasi fungsional lan analisis bioinformatik majeng sing nggayuh tujuan riset tartamtu.Profil genom bakteri sing luwih lengkap ngidini mbukak mekanisme dhasar sing ndasari proses biologis, sing uga bisa menehi referensi penting kanggo riset genomik ing spesies eukariotik sing luwih dhuwur.
Platform:Nanopore PromethION P48 + Platform Illumina NovaSeq
PacBio Sekuel II
