-
Analisis Asosiasi Genome-wide
Studi asosiasi genom (GWAS) nduweni tujuan kanggo ngenali varian genetik (genotip) sing ana gandhengane karo sifat spesifik (fenotipe).Panaliten GWAS nyelidiki tandha-tandha genetik nyabrang kabeh genom saka akeh individu lan prédhiksi asosiasi genotipe-fenotip kanthi analisis statistik ing tingkat populasi.Wis akeh diterapake ing riset babagan penyakit manungsa lan pertambangan gen fungsional babagan sifat kompleks kewan utawa tanduran.
-
Urutan Genome Tanduran / Kewan Kabèh
Urutan ulang genom wutuh, uga dikenal minangka WGS, ngidini mutasi umum lan langka ing kabeh genom kalebu Polimorfisme Nukleotida Tunggal (SNP), Pambusakan Insertion (InDel), Variasi Struktur (SV), lan Variasi Nomer Salinan (CNV). ).SV nggawe bagean sing luwih gedhe saka basis variasi tinimbang SNP lan nduwe pengaruh sing luwih gedhe ing genom, sing nduwe pengaruh sing signifikan marang organisme urip.Resequencing sing dawa diwaca ngidini identifikasi pecahan gedhe lan variasi rumit sing luwih tepat amarga maca dawa nggawe luwih gampang kromosom nyebrang wilayah sing rumit kayata tandem repeats, wilayah sing sugih GC/AT, lan wilayah hiper-variabel.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Genetika Evolusi
Genetika evolusioner minangka layanan urutan sing dikempalken sing dirancang kanggo menehi interpretasi lengkap babagan informasi evolusi materi sing diwenehake adhedhasar variasi genetik, kalebu SNP, InDels, SV lan CNV.Iki nyedhiyakake kabeh analisis dhasar sing dibutuhake kanggo njlentrehake owah-owahan evolusi lan fitur genetis saka populasi, kayata struktur populasi, keragaman genetik, hubungan filogeni, lan sapiturute.
-
Genomik Komparatif
Genomik komparatif secara harfiah tegese mbandhingake urutan genom lengkap lan struktur spesies sing beda-beda.Disiplin iki nduweni tujuan kanggo mbukak evolusi spesies, fungsi gen, mekanisme pangaturan gen ing tingkat genom kanthi ngenali struktur urutan lan unsur sing dikonservasi utawa dibedakake antarane spesies sing beda-beda.Pasinaon genomik komparatif sing khas kalebu analisis ing kulawarga gen, pangembangan evolusi, duplikasi genom kabeh, tekanan selektif, lsp.
-
Majelis Genome adhedhasar Hi-C
Hi-C minangka cara sing dirancang kanggo njupuk konfigurasi kromosom kanthi nggabungake interaksi basis proximity probing lan urutan throughput dhuwur.Intensitas interaksi kasebut dipercaya ana hubungane negatif karo jarak fisik ing kromosom.Mula, data Hi-C bisa nuntun pengelompokan, urutan lan orientasi urutan sing dirakit ing draf génom lan nancepake ing sawetara kromosom tartamtu.Teknologi iki nguatake perakitan genom tingkat kromosom tanpa ana peta genetik adhedhasar populasi.Saben genom mbutuhake Hi-C.
Platform: Platform Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Tanduran / Kewan De Novo Genome Sequencing
De Novosequencing nuduhake konstruksi saka kabèh genome spesies nggunakake teknologi urutan, contone, PacBio, Nanopore, NGS, etc., tanpa genom referensi.Peningkatan sing luar biasa ing dawa maca teknologi urutan generasi katelu wis nggawa kesempatan anyar kanggo ngumpulake genom kompleks, kayata sing heterozigositas dhuwur, rasio wilayah sing bola-bali dhuwur, poliploid, lan liya-liyane. ngrampungake unsur sing bola-bali, wilayah kanthi isi GC sing ora normal lan wilayah kompleks liyane.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Platform Illumina NovaSeq
-
Manungsa Whole Exome Sequencing
Whole exome sequencing (WES) dianggep minangka strategi urutan biaya-efektif kanggo ngenali mutasi sing nyebabake penyakit.Sanajan ekson mung njupuk kira-kira 1,7% saka kabeh génom, iki nggambarake profil fungsi protein total kanthi langsung.Ing génom manungsa, wis dilapurake manawa luwih saka 85% mutasi sing gegandhengan karo penyakit dumadi ing wilayah pengkodean protein.
BMKGENE nawakake layanan urutan exome manungsa sing komprehensif lan fleksibel kanthi strategi njupuk exon sing beda-beda sing kasedhiya kanggo nggayuh macem-macem tujuan riset.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan Fragmen Diperkuat Lokus Khusus (SLAF-Seq)
Genotyping high-throughput, utamane ing populasi skala gedhe, minangka langkah dhasar ing studi asosiasi genetik, sing nyedhiyakake basis genetik kanggo panemuan gen fungsional, analisis evolusi, lan liya-liyane. ) dikenalaké kanggo nyilikake biaya urutan saben sampel, nalika njaga efisiensi sing cukup kanggo panemuan panandha genetik.Iki umume digayuh kanthi ngekstrak fragmen watesan ing sawetara ukuran tartamtu, sing dijenengi perpustakaan perwakilan sing dikurangi (RRL).Urutan fragmen amplified-locus spesifik (SLAF-Seq) minangka strategi sing dikembangake dhewe kanggo genotipe SNP kanthi utawa tanpa genom referensi.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
