-
Urutan Imunopresipitasi Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq nyedhiyakake profiling genom saka target DNA kanggo modifikasi histon, faktor transkripsi, lan protein sing ana gandhengane karo DNA liyane.Iki nggabungake selektivitas chromatin immuno-precipitation (ChIP) kanggo mbalekake kompleks protein-DNA spesifik, kanthi kekuwatan urutan generasi sabanjure (NGS) kanggo urutan throughput dhuwur saka DNA sing wis pulih.Kajaba iku, amarga kompleks protein-DNA ditemokake saka sel urip, situs pengikat bisa dibandhingake ing macem-macem jinis sel lan jaringan, utawa ing kahanan sing beda.Aplikasi kalebu saka regulasi transkripsi nganti jalur perkembangan nganti mekanisme penyakit lan liya-liyane.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan genom bisulfit kabèh
Metilasi DNA ing posisi kaping lima ing sitosin (5-mC) nduweni pengaruh dhasar ing ekspresi gen lan aktivitas seluler.Pola metilasi abnormal wis digandhengake karo sawetara kahanan lan penyakit, kayata kanker.WGBS wis dadi standar emas kanggo nyinaoni metilasi genom kanthi resolusi basa tunggal.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Pengujian kanggo Kromatin sing Bisa Diakses Transposase kanthi Sekuensing Throughput Tinggi (ATAC-seq)
ATAC-seq minangka cara sekuensing dhuwur kanggo analisis aksesibilitas kromatin genom, sing penting kanggo kontrol epigenetik global ekspresi gen.Adaptor urutan dilebokake menyang wilayah kromatin sing mbukak kanthi transposase Tn5 hiperaktif.Sawise amplifikasi PCR, perpustakaan urutan dibangun.Kabeh wilayah kromatin sing mbukak bisa diduweni ing kondisi spasi-wektu tartamtu, ora mung diwatesi ing situs pengikat faktor transkripsi, utawa wilayah sing diowahi histone tartamtu.
-
Ngurangi Representasi Bisulfit Sequencing (RRBS)
Riset metilasi DNA tansah dadi topik panas ing riset penyakit, lan ana hubungane karo ekspresi gen lan sifat fenotipik.RRBS minangka cara sing akurat, efisien lan ekonomi kanggo riset metilasi DNA.Pengayaan wilayah promotor lan pulau CpG kanthi pembelahan enzimatik (Msp I), digabungake karo urutan Bisulfite, nyedhiyakake deteksi metilasi DNA resolusi dhuwur.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
