GENOME
Perakitan skala kromosom lan analisis genom tanaman biomassa Miscanthus lutarioriparius
Urutan Nanopore |Ilumina |Hi-C |RNA-urutan |Filogeni
Ing panliten iki, Biomarker Technologies nyedhiyakake dhukungan teknis babagan urutan Nanopore, perakitan genom de novo, rakitan dibantu Hi-C, lsp.
Abstrak
Miscanthus, tanduran perennial rhizomatous, duweni potensi gedhe kanggo produksi bioenergi amarga biomas sing dhuwur lan toleransi stres.Kita laporan perakitan skala kromosom sakaMiscanthus lutarioripariusgenome kanthi nggabungake urutan Oxford Nanopore lan teknologi Hi-C.Déwan 2.07-Gb nyakup 96.64% saka génom, kanthi contig N50 saka 1.71 Mb.Urutan centromere lan telomere dirakit kanggo kabeh 19 kromosom lan kromosom 10.Asal allotetraploid saka M. lutarioriparius dikonfirmasi nggunakake satelit centromeric repeats.Struktur genom tetraploid lan sawetara rearrangements kromosom relatif kanggo sorghum cetha dituduhake.Tandem duplikat gen sakaM. lutarioripariusFungsional diperkaya ora mung babagan respon stres, nanging biosintesis tembok sel.Kulawarga gen sing ana hubungane karo resistensi penyakit, biosintesis tembok sel lan transportasi ion logam saya tambah akeh lan berkembang.Ekspansi kulawarga kasebut bisa dadi basis genomik sing penting kanggo nambah sipat sing luar biasaM. lutarioriparius.
Statistik kunci perakitan genom
Gambar.Ringkesan perakitan genom M. lutarioriparius
News lan Highlights ngarahake nuduhake kasus sukses paling anyar karo Biomarker Technologies, njupuk prestasi ilmiah novel uga teknik penting sing ditrapake sajrone sinau.
Wektu kirim: Jan-05-2022