-
Tanduran/Kewan De novo Genome Sequencing
Saikisequencing nuduhake konstruksi saka kabèh genome spesies nggunakake teknologi urutan, contone, PacBio, Nanopore, NGS, etc., tanpa genom referensi.Peningkatan sing luar biasa ing dawa maca teknologi urutan generasi katelu wis nggawa kesempatan anyar kanggo ngrakit genom kompleks, kayata sing heterozigositas dhuwur, rasio wilayah sing bola-bali dhuwur, poliploid, lan liya-liyane. ngrampungake unsur sing bola-bali, wilayah kanthi isi GC sing ora normal lan wilayah kompleks liyane.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Majelis Genome adhedhasar Hi-C
Hi-C minangka cara sing dirancang kanggo njupuk konfigurasi kromosom kanthi nggabungake interaksi basis proximity probing lan urutan throughput dhuwur.Intensitas interaksi kasebut dipercaya ana hubungane negatif karo jarak fisik ing kromosom.Mula, data Hi-C bisa nuntun pengelompokan, urutan lan orientasi urutan sing dirakit ing draf génom lan nyepetake kasebut ing jumlah kromosom tartamtu.Teknologi iki nguatake perakitan genom tingkat kromosom tanpa ana peta genetik adhedhasar populasi.Saben genom mbutuhake Hi-C.
Platform: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Genetika Evolusi
Genetika evolusioner minangka layanan urutan sing dikempalken sing dirancang kanggo menehi interpretasi lengkap babagan informasi evolusi materi sing diwenehake adhedhasar variasi genetik, kalebu SNP, InDels, SV lan CNV.Iki nyedhiyakake kabeh analisis dhasar sing dibutuhake kanggo njlentrehake owah-owahan evolusi lan fitur genetis populasi, kayata struktur populasi, keragaman genetik, hubungan filogeni, lan sapiturute.
-
Genomik Komparatif
Genomik komparatif secara harfiah tegese mbandhingake urutan genom lengkap lan struktur spesies sing beda.Disiplin iki nduweni tujuan kanggo mbukak evolusi spesies, fungsi gen, mekanisme pangaturan gen ing tingkat genom kanthi ngenali struktur urutan lan unsur sing dikonservasi utawa dibedakake antarane spesies sing beda-beda.Sinau genomik komparatif khas kalebu analisis ing kulawarga gen, pangembangan evolusi, duplikasi genom kabeh, tekanan selektif, lsp.
-
Analisis Segregant Bulked
Analisis segregant massal (BSA) minangka teknik sing digunakake kanggo ngenali marker genetik fenotipe kanthi cepet.Alur kerja utama BSA ngemot milih rong klompok individu kanthi fenotipe sing nentang banget, nglumpukake DNA kabeh individu kanggo mbentuk rong akeh DNA, ngenali urutan diferensial ing antarane rong kolam.Teknik iki wis akeh digunakake kanggo ngenali tandha-tandha genetik sing digandhengake karo gen sing ditargetake ing genom tanduran/kewan.
