● Highly Experienced: Luwih saka 200.000 conto wis diproses ing BMK kalebu macem-macem jinis sampel, kalebu kultur sel, jaringan, cairan awak, lan sapiturute lan liwat 7.000 mRNA-Seq project ditutup nutupi macem-macem wilayah riset.
● Sistem kontrol kualitas sing ketat: Titik kontrol kualitas inti liwat kabeh langkah kalebu preparation sampel, preparation perpustakaan, sequencing lan bioinformatika ana ing ngawasi rapet kanggo ngirim asil kualitas dhuwur.
● Multiple database kasedhiya kanggo anotasi fungsi lan studi pengayaan kanggo nepaki macem-macem tujuan riset.
● Layanan sawise-sale: Layanan sawise-sale valid kanggo 3 sasi sawise project completion, kalebu project tindakake-munggah, troubleshooting, asil Q&A, etc.
Pustaka | Strategi urutan | Data dianjurake | Kontrol kualitas |
Poly A enriched | Illumina PE 150 Kab | 6 Gb | Q30≥85% |
Nukleotida:
Konk.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0,5-2,5 Kontaminasi protein utawa DNA diwatesi utawa ora ditampilake ing gel. | Kanggo tetanduran: RIN≥6.5; Kanggo kewan: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; winates utawa ora elevasi baseline |
Tisu: Bobot (garing):≥1 g
*Kanggo jaringan sing luwih cilik saka 5 mg, disaranake ngirim sampel jaringan flash beku (ing nitrogen cair).
Suspensi sel:Jumlah sel = 3×106- 1×107
* Disaranake ngirim lysate sel beku.Yen jumlah sel luwih cilik tinimbang 5 × 105.
Sampel getih:Volume ≥1 ml
Mikroorganisme:Bobot ≥ 1 g
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (Timah foil ora dianjurake)
Labeling sampel: Group+replikat contone A1, A2, A3;B1, B2, B3....
Kintunan:
Bioinformatika
Eukariotik alur kerja analisis urutan mRNA
Bioinformatika
ØKontrol kualitas data mentah
Øalignment genom referensi
ØAnalisis struktur transkrip
ØEkspresi kuantifikasi
ØAnalisis ekspresi diferensial
ØAnotasi fungsi lan pengayaan
1.Kurva Saturasi Data mRNA
2.Analisis ekspresi diferensial-Plot gunung berapi
3.anotasi KEGG ing DEGs
4.Klasifikasi GO ing DEGs