●Platform:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten lan BGI-DNB-T7
●Mode urutan:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kontrol kualitas perpustakaan sadurunge urutan
●Urutan pangiriman data lan QC:pangiriman laporan QC lan data mentah ing format fastq sawise demultiplexing lan nyaring maca Q30.
●Versatility saka layanan Sequencing:customer bisa milih kanggo urutan dening lane, sel aliran utawa jumlah data.
●Versatility saka platform:Pustaka DNB bisa ditransfer menyang platform Illumina
●Pengalaman ekstensif ing platform urutan Illumina:karo ewu proyek ditutup karo macem-macem spesies.
●Pangiriman laporan urutan QC:kanthi metrik kualitas, akurasi data lan kinerja sakabèhé saka project urutan.
●Proses urutan diwasa:karo wektu turn-around singkat.
●Kontrol Kualitas sing ketat: kita ngleksanakake syarat QC ketat kanggo njamin pangiriman asil kualitas dhuwur terus-terusan.
Jumlah Data (X) | Konsentrasi (qPCR/nM) | Volume |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Platform | Konsentrasi (qPCR/nM) | Volume |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Saliyane konsentrasi lan jumlah total, pola puncak sing cocog uga dibutuhake.
Laporan babagan kualitas perpustakaan diwenehake sadurunge urutan, netepake jumlah perpustakaan, lan fragmentasi.
Tabel 1. Statistik babagan urutan data.
ID sampel | BMKID | Wacan mentah | Data mentah (bp) | Wacan sing resik (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Gambar 1. Distribusi kualitas bebarengan diwaca ing saben sampel
Gambar 2. Distribusi isi dhasar
Gambar 3. Distribusi isi wacan ing data urut-urutan