Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
サービス仕様
プラットフォーム: NovaSeq プラットフォーム、PE150
ライブラリータイプ: 200-400bp インサート重亜硫酸塩処理 DNA ライブラリー
シーケンス戦略: ペアエンド 150 bp
推奨データ出力: 10 Gb 生データ/サンプル
サンプル要件
DNA量: ≥ 2ug
DNA濃度：≧20ng/μl。
純度: OD260/280 = 1.8 ～ 2.0、分解や RNA 汚染なし
バイオインフォマティクス解析
サービスのワークフロー
サンプル納品
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターサービス
a。参照ゲノムアライメント統計
マッピング読み取りの統計
S配列決定の深さと C サイトの範囲の統計
A累積適用範囲
D各サンプルの消化効率
b。メチル化部位の検出
C部位のメチル化レベル一覧
BS変換
Mエチル化シトシン
メチル化レベルの分布
c。メチル化マップ
Gエノメ全体
Gエノム要素
d。サンプル間のメチル化レベルの比較
P空路 CGメチル化の相関
PCA-CGメチル化
CCGメチル化の艶出し
d。示差的メチル化分析
SDMRの統計
DMRの長さの分布
H食べる地図
D対象地域のMR分布
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