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BSA
Bulked Segregant 分析プラットフォームは、ワンステップの標準分析とカスタマイズされたパラメーター設定による高度な分析で構成されます。BSA は、表現型に関連する遺伝マーカーを迅速に特定するために使用される技術です。BSA の主なワークフローには次のものが含まれます。 1. 極端に反対の表現型を持つ個人の 2 つのグループを選択します。2. すべての個人の DNA、RNA、または SLAF-seq (Biomark によって開発) をプールして 2 つの DNA バルクを形成します。3. 参照ゲノムに対する、またはその間の差分配列を同定する。 4. ED および SNP インデックスアルゴリズムにより候補連結領域を予測する。5. 候補領域等の遺伝子の機能解析・濃縮 遺伝子マーカーのスクリーニングやプライマー設計など、より高度なデータマイニングも可能です。
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アンプリコン (16S/18S/ITS)
アンプリコン（16S/18S/ITS）プラットフォームは、微生物多様性プロジェクト分析における長年の経験をもとに開発されており、標準化された基本分析と個別分析が含まれています。基本分析は現在の微生物研究の主流の分析内容をカバーしており、分析内容は豊富で包括的です。分析結果はプロジェクトレポートの形で提示されます。パーソナライズ分析の内容は多岐にわたります。基本的な分析レポートや研究目的に応じて、サンプルの選択やパラメータの設定を柔軟に行うことができ、お客様のニーズに合わせたカスタマイズを実現します。Windows オペレーティング システム、シンプルかつ高速。
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進化遺伝学
進化遺伝学は、SNP、InDel、SV、CNV などの遺伝的変異に基づいて、特定の材料の進化情報の包括的な解釈を提供するために設計されたパックされたシーケンス サービスです。集団の構造、遺伝的多様性、系統関係など、集団の進化的変化と遺伝的特徴を記述するために必要なすべての基本的な分析を提供します。また、有効な集団サイズや分岐時間の推定を可能にする遺伝子流動に関する研究も含まれています。
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比較ゲノミクス
比較ゲノミクスとは文字通り、異なる種の完全なゲノム配列と構造を比較することを意味します。この分野は、異なる種間で保存または分化した配列構造と要素を特定することにより、種の進化、遺伝子機能、遺伝子制御機構をゲノムレベルで明らかにすることを目的としています。典型的な比較ゲノミクス研究には、遺伝子ファミリー、進化的発達、全ゲノム重複、選択圧などの分析が含まれます。
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進化遺伝学
集団および進化遺伝解析プラットフォームは、BMK 研究開発チーム内で長年にわたって蓄積された膨大な経験に基づいて確立されています。これは、特にバイオインフォマティクスを専攻していない研究者にとって使いやすいツールです。このプラットフォームにより、系統樹構築、連鎖不平衡解析、遺伝的多様性評価、選択スイープ解析、親族解析、PCA、集団構造解析などを含む進化遺伝学関連の基礎解析が可能になります。
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Hi-Cベースのゲノムアセンブリ
Hi-C は、プロービング近接ベースの相互作用とハイスループット シーケンスを組み合わせて染色体構成を捕捉するように設計された方法です。これらの相互作用の強さは、染色体上の物理的距離と負の相関があると考えられています。したがって、Hi-C データは、ドラフトゲノム内の組み立てられた配列のクラスタリング、順序付け、配向をガイドし、それらを特定の数の染色体に固定することができます。この技術により、集団ベースの遺伝地図が存在しない場合でも、染色体レベルのゲノムアセンブリが可能になります。すべてのゲノムには Hi-C が必要です。
プラットフォーム：Illumina NovaSeqプラットフォーム / DNBSEQ
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植物/動物のデノボゲノム配列決定
デノボ配列決定とは、参照ゲノムが存在しない場合に、配列決定技術（例えば、PacBio、Nanopore、NGS など）を使用して種の全ゲノムを構築することを指します。第 3 世代シーケンシング技術のリード長の顕著な改善により、高いヘテロ接合性、高い反復領域比率、倍数体などの複雑なゲノムを組み立てる新たな機会がもたらされました。数十キロベースレベルのリード長により、これらのシーケンシングリードにより、反復要素、異常な GC 内容を持つ領域、その他の非常に複雑な領域の解決。
プラットフォーム： PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq プラットフォーム
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ヒト全エクソームシーケンス
全エクソームシークエンシング（WES）は、病気の原因となる変異を特定するための費用対効果の高いシーケンシング戦略とみなされています。エクソンは全ゲノムの約 1.7% しか占めていませんが、これは総タンパク質機能のプロファイルを直接表します。ヒトゲノムでは、疾患に関連する突然変異の 85% 以上がタンパク質コード領域で発生していることが報告されています。
BMKGENE は、さまざまな研究目標を達成するために利用できるさまざまなエクソン捕捉戦略を備えた、包括的で柔軟なヒト全エクソーム配列決定サービスを提供します。
プラットフォーム: Illumina NovaSeq プラットフォーム
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特定遺伝子座増幅断片シーケンス (SLAF-Seq)
特に大規模集団におけるハイスループットのジェノタイピングは、遺伝関連研究の基本的なステップであり、機能遺伝子の発見や進化解析などのための遺伝的基礎を提供します。ディープ全ゲノム再配列決定の代わりに、縮小表現ゲノム配列決定 (RRGS) が使用されます。 ) は、遺伝子マーカー発見の合理的な効率を維持しながら、サンプルあたりの配列決定コストを最小限に抑えるために導入されています。これは通常、指定されたサイズ範囲内の制限フラグメントを抽出することによって実現され、これは縮小表現ライブラリー (RRL) と呼ばれます。特定遺伝子座増幅断片シークエンシング (SLAF-Seq) は、参照ゲノムの有無にかかわらず、SNP ジェノタイピング用に独自に開発された戦略です。
プラットフォーム: Illumina NovaSeq プラットフォーム -
イルミナとBGI
イルミナのシーケンス技術は、合成によるシーケンス (SBS) に基づいており、世界的に受け入れられている NGS イノベーションであり、世界のシーケンス データの 90% 以上の生成を担っています。SBS の原理には、各 dNTP が追加され、続いて切断されて次の塩基の組み込みが可能になるときに、蛍光標識された可逆的ターミネーターをイメージングすることが含まれます。4 つの可逆的ターミネーター結合 dNTP がすべて各シーケンシング サイクルに存在するため、自然な競合により取り込みバイアスが最小限に抑えられます。この多用途テクノロジーは、シングルリード ライブラリとペアエンド ライブラリの両方をサポートし、さまざまなゲノム アプリケーションに対応します。イルミナシークエンシングのハイスループット機能と精度は、ゲノミクス研究の基礎として位置付けられ、科学者が比類のない詳細さと効率でゲノムの複雑さを解明できるようにします。
BGI が開発した DNBSEQ も革新的な NGS テクノロジーであり、シーケンス コストをさらに削減し、スループットを向上させることに成功しました。DNBSEQ ライブラリーの調製には、DNA 断片化、ssDNA の調製、および DNA ナノボール (DNB) を取得するためのローリングサークル増幅が含まれます。これらは固体表面にロードされ、その後コンビナトリアル プローブ アンカー合成 (cPAS) によって配列決定されます。
当社の既製ライブラリー シーケンス サービスを利用すると、お客様はさまざまなソース (mRNA、全ゲノム、アンプリコンなど) からシーケンス ライブラリーを容易に準備できます。その後、これらのライブラリを当社のシーケンス センターに発送して、Illumina または BGI プラットフォームでの品質管理とシーケンスを行うことができます。
