NGS ベースの mRNA シークエンシングは遺伝子発現定量化のための多用途ツールとして機能しますが、ショートリードへの依存により複雑なトランスクリプトーム解析における有効性が制限されます。一方、PacBio シーケンス (Iso-Seq) はロングリード技術を採用しており、全長 mRNA 転写物のシーケンスを可能にします。このアプローチは、遺伝子発現定量化の主な選択肢ではありませんが、選択的スプライシング、遺伝子融合、およびポリアデニル化の包括的な探索を容易にします。2+3 の組み合わせは、転写アイソフォームの完全なセットを識別するための PacBio HiFi リードと、同じアイソフォームの定量化のための NGS シーケンスに依存することで、イルミナと PacBio の間のギャップを埋めます。
プラットフォーム: PacBio Sequel II および Illumina NovaSeq