ハイライト
この 2 時間のウェビナーに、作物ゲノミクス分野の 6 人の専門家をお招きしたことを大変光栄に思います。私たちの講演者は、最近発表された 2 つのライ麦ゲノム研究について詳細な解釈を行います。自然遺伝学:
1. 染色体スケールのゲノムアセンブリにより、ライ麦の生物学、進化、および農業の可能性についての洞察が得られます
2. 高品質のゲノムアセンブリにより、ライ麦のゲノム特性と農学的に重要な遺伝子が強調表示されます
また、バイオマーカーテクノロジーの上級研究開発科学者にデノボゲノムアセンブリの経験を共有してもらえることを嬉しく思います。
議題
午前9時（中央ヨーロッパ時間）
歓迎の挨拶
鄭宏君
Biomarker Technologies 創設者兼 CEO
鄧興旺
北京大学先進農業科学院学長
午前9時15分
高品質の参照ゲノム配列を使用してライ麦、ライコムギ、小麦の改良を強化
このウェビナーでは、王教授がサトウキビ科ゲノム研究の現状に関する全体的な最新情報を提供し、ライ麦ゲノム研究に関する 2 つの優れた研究の成功と進歩を実証しました。これらの研究は最近 Nature Genetics に掲載され、研究全体を紹介しています。作業を主導し貢献するグループ。
09:25am
穀物ゲノミクス @ IPK ゲータースレーベン
トウモロコシ科の穀草は温帯地域の主要な食料源であり、作物の改良と育種のホットスポットとして長い間考えられてきました。この部族は、栽培種の中でもゲノムサイズが大きく、TE の含有量が多く、倍数性など、非常に複雑なゲノム特徴を持つことで有名です。今回のセッションでは、ニルス・シュタイン教授から、IPK ゲータースレーベンと穀物の現状について全体的に紹介していただきました。ゲノム研究@IPK Gatersleben。
09:35am
染色体スケールのゲノムアセンブリにより、ライ麦の生物学、進化、農業の可能性についての洞察が得られます
M Timothy Rabanus-Wallace 博士、ライプニッツ植物遺伝学および作物計画研究所 (IPK)ライ麦 (Secale cereale L.) は、非常に気候に強い穀物であり、遺伝子移入交配によって改良された小麦品種を生産するために広く使用されており、雑種育種を可能にするために必要な遺伝子の全レパートリーを持っています。ライ麦は他生種であり、栽培化されたのは最近であるため、栽培ライ麦は多様で利用可能な野生遺伝子プールにアクセスできます。ライ麦の農業学的可能性をさらに高めるために、私たちは 7.9 Mbp のライ麦ゲノムの染色体スケールの注釈付きアセンブリを作成し、一連の分子遺伝資源を使用してその品質を広範囲に検証しました。私たちは、幅広い調査を通じてこのリソースのアプリケーションを実証します。我々は、栽培ライ麦の野生近縁種からの不完全な遺伝的単離、ゲノム構造進化のメカニズム、病原体耐性、低温耐性、雑種育種のための受精能制御システム、およびライ麦と小麦の遺伝子移入による収量上の利点に関する知見を紹介する。
午前10時5分
高品質のゲノムアセンブリにより、ライ麦のゲノム特性と農学的に重要な遺伝子が強調表示されます
ライ麦は貴重な食用および飼料作物であり、小麦やライコムギの改良のための重要な遺伝資源であり、イネ科植物の効率的な比較ゲノミクス研究に不可欠な材料です。ここでは、中国のライ麦のエリート品種であるウェイニンライ麦のゲノムを配列しました。組み立てられたコンティグ (7.74 Gb) は推定ゲノム サイズ (7.86 Gb) の 98.47% を占め、コンティグ (7.25 Gb) の 93.67% は 7 つの染色体に割り当てられました。反復エレメントは、構築されたゲノムの 90.31% を構成しました。以前に配列決定されたコムギ科ゲノムと比較して、ダニエラ、スマヤ、およびスマナのレトロトランスポゾンはライ麦で強い拡大を示しました。ウェイニングアセンブリのさらなる分析により、ゲノム全体にわたる遺伝子重複と、デンプン生合成遺伝子、複雑なプロラミン遺伝子座の物理的組織化、初期出穂形質の根底にある遺伝子発現の特徴、およびライ麦の推定栽培化関連染色体領域および遺伝子座への影響に新たな光が当てられる。このゲノム配列は、ライ麦および関連穀物のゲノミクスおよび育種研究を加速することを約束します。
午前10時35分
ゲノムデノボアセンブリの課題、解決策、および将来
高品質のゲノムはゲノム研究の基礎です。配列決定とアルゴリズムの急速な発展により、ゲノムアセンブリはよりシンプルかつ効率的になりましたが、研究目標の深化に伴い、アセンブリの精度と完全性に対する要件も高まっています。この講演では、ゲノムアセンブリにおける現在人気のある技術について、いくつかの成功例を交えて説明し、将来の開発について垣間見ていきます。
投稿時刻: 2022 年 1 月 8 日