● 豊富なプロジェクト事例:2009 年の設立以来、BMKGENE は集団 GWAS 研究において数百種のプロジェクトを完了し、研究者を支援して 100 以上の論文を発表し、累積インパクトファクターは 500 に達しました。
● プロのアナリスト。
● 短い分析サイクル。
● 正確なデータマイニング。
タイプ | 人口規模 | シーケンス戦略と深さ |
SLAF-GWAS | サンプル数 ≥200 | ゲノム サイズ < 400M、ref-genome あり、WGS を推奨 |
ゲノムサイズ ≤ 1G、100K タグ、10X | ||
1G ≤ ゲノムサイズ ≤ 2G、200K タグおよび 10X | ||
ゲノム サイズ > 2G、300K タグ、10X | ||
WGS-GWAS | サンプル数 ≥200 | 各サンプルにつき 10 倍 |
さまざまな品種、亜種、在来種/ジーンバンク/混合科/野生資源
さまざまな品種、亜種、在来種
半兄弟家族/完全兄弟家族/野生資源
● ゲノムワイド関連解析
● 重要な SNP の分析とスクリーニング
● 候補遺伝子の機能アノテーション
a.表現型 QC
度数分布ヒストグラム
表現型統計
b.アソシエーション分析(モデル:GEMMA、FaST-LMM、EMMAX)
QQプロット
マンハッタン・プロット
年 | ジャーナル | IF | タイトル |
2022年 | NC | 17.69 | 牡丹Paeonia ostiiのギガ染色体とギガゲノムのゲノム基盤 |
2015年 | NP | 7.43 | 家畜化の足跡は大豆の農学的に重要なゲノム領域を固定する |
2018年 | MP | 9.32 | 菜種系統の世界的なコレクションの全ゲノム再配列により、その生態型分岐の遺伝的基盤が明らかになった |
2022年 | HR | 7.29 | ゲノムワイド関連解析により、スイカの種子サイズの自然変動に対する分子的洞察が得られます。 |