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製品

ゲノム全体の関連性分析

ゲノムワイド関連研究 (GWAS) は、特定の形質 (表現型) に関連する遺伝的変異 (遺伝子型) を特定することを目的としています。GWAS 研究では、多数の個人の全ゲノムにわたる遺伝マーカーを調査し、集団レベルでの統計分析によって遺伝子型と表現型の関連を予測します。これは、人間の病気の研究や、動物や植物の複雑な特性に関する機能的遺伝子マイニングに広く応用されています。


サービス内容

デモ結果

注目の出版物

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1.サービスのメリット

● 豊富なプロジェクト事例:2009 年の設立以来、BMKGENE は集団 GWAS 研究において数百種のプロジェクトを完了し、研究者を支援して 100 以上の論文を発表し、累積インパクトファクターは 500 に達しました。
● プロのアナリスト。
● 短い分析サイクル。
● 正確なデータマイニング。

2. サービス仕様

タイプ

人口規模

シーケンス戦略と深さ

SLAF-GWAS サンプル数 ≥200 ゲノム サイズ < 400M、ref-genome あり、WGS を推奨

ゲノムサイズ ≤ 1G、100K タグ、10X

1G ≤ ゲノムサイズ ≤ 2G、200K タグおよび 10X

ゲノム サイズ > 2G、300K タグ、10X

WGS-GWAS

サンプル数 ≥200

各サンプルにつき 10 倍

3. 材料の選択

アニメーション1
アニメーション2
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さまざまな品種、亜種、在来種/ジーンバンク/混合科/野生資源

さまざまな品種、亜種、在来種

半兄弟家族/完全兄弟家族/野生資源

4. 生体情報解析

● ゲノムワイド関連解析
● 重要な SNP の分析とスクリーニング
● 候補遺伝子の機能アノテーション

5. サービスのワークフロー

サンプルQC

実験計画

サンプル納品

サンプル納品

パイロット実験

RNA抽出

ライブラリの準備

図書館の建設

シーケンス

シーケンス

データ分析

データ分析

アフターサービス

アフターサービス


  • 前の:
  • 次:

  • a.表現型 QC

    度数分布ヒストグラム

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    表現型統計

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    b.アソシエーション分析(モデル:GEMMA、FaST-LMM、EMMAX)

    QQプロット

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    マンハッタン・プロット

    アンモニア_emmax_マンハッタン_00

    ジャーナル

    IF

    タイトル

    2022年

    NC

    17.69

    牡丹Paeonia ostiiのギガ染色体とギガゲノムのゲノム基盤

    2015年

    NP

    7.43

    家畜化の足跡は大豆の農学的に重要なゲノム領域を固定する

    2018年

    MP

    9.32

    菜種系統の世界的なコレクションの全ゲノム再配列により、その生態型分岐の遺伝的基盤が明らかになった

    2022年

    HR

    7.29

    ゲノムワイド関連解析により、スイカの種子サイズの自然変動に対する分子的洞察が得られます。

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