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ネーブルオレンジを他の一般的なスイートオレンジ品種と区別する重要な園芸的特徴の 1 つは、果実にネーブルが存在することです。この特徴は、スイートオレンジの園芸品種を分類するための重要な基準でもあります。

BMKGENE のクライアントは、BMKGENE が自社開発した SLAF シーケンス技術を利用して、「」というタイトルの研究を実施しました。特定の遺伝子座の増幅断片シーケンスに基づいて、スイート オレンジの果実の品質に関連する遺伝子をマイニングします。「

この研究では、幅広い遺伝的多様性と異なる地理的起源を持つ 240 個のスイート オレンジの生殖質リソースの配列決定が行われ、497.82 Mb のショートリード データが得られました。データの分析により、ゲノム全体にわたって 1,467,968 個の SNP 遺伝子型が得られました。この研究では、Fst 分析を採用することにより、へその存在、果実の重さ、滴定可能な酸度に関連する 6 つの候補遺伝子を特定し、スイート オレンジ品種の目標を絞った改良の基礎を提供しました。

大規模集団シークエンシングの場合、特定遺伝子座増幅フラグメントシークエンシング (SLAF) は、全ゲノムシークエンシング (WGS) と比較してコスト効率が高く、効果が高くなります。

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