5月20日は世界ミツバチの日です!ミツバチは、生態系の多様性と生産性に貢献する重要な花粉媒介者であり、人間と動物の両方に食料となる食用作物の生産にも貢献します。
アジアミツバチは、農業と生態系サービスにおいて重要な役割を果たす重要な花粉媒介種です。A. セラーナのドラフトゲノムは 2015 年に NGS テクノロジーを使用して公開されましたが、これは高度に断片化されており、染色体レベルの足場が欠けていたため、より完全で正確なゲノム配列を取得する必要がありました。
BMKGENEの成功例の1つとして、中国とオーストラリアの研究者チームが「アジアミツバチApis ceranaゲノムの染色体スケールアセンブリ」と題された新しい研究を発表した。この研究では、PacBio ロングリード シーケンスと Hi-C データの組み合わせを使用して、A. cerana ゲノムの非常に連続した染色体スケールのアセンブリを提示します。更新されたアセンブリのサイズは 215.67 Mb で、コンティグ N50 は 4.49 Mb で、以前の Illumina ベースのバージョンと比較して 212 倍の改善を示しています。新しい議会の完成度も高く、BUSCO の出席率は 97.6% でしたが、以前の議会では 86.9% に過ぎませんでした。研究者らは、新しい遺伝子の予測や構造変異の検出など、より正確で包括的なゲノム解析を実施しました。これは、この種の生物学と進化を理解する上で重要な意味を持つ可能性があります。
BMKEGENE は高品質のゲノムアセンブリに関する豊富な経験を有しており、お客様にサービスを提供することを楽しみにしています。
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投稿日時: 2023 年 5 月 22 日