●プラットフォーム:Illumina NovaSeq 6000、NovaSeq、HiSeq X Ten、および BGI-DNB-T7
●シーケンスモード:PE50、PE100、PE150、PE250
●シーケンス前のライブラリの品質管理
●データ配信と QC のシーケンス:Q30 読み取りを逆多重化およびフィルタリングした後、QC レポートと生データを fastq 形式で配信します。
●シーケンス サービスの多様性:お客様は、レーン、フローセル、またはデータ量ごとにシーケンスを選択できます。
●プラットフォームの多様性:DNB ライブラリは Illumina プラットフォームに転送可能
●Illumina シーケンス プラットフォームに関する豊富な経験:さまざまな種類のクローズドプロジェクトが数千件あります。
●シーケンス QC レポートの提供:高品質のメトリクス、データの精度、シーケンスプロジェクトの全体的なパフォーマンスを実現します。
●成熟したシーケンスプロセス:短い所要時間で。
●厳格な品質管理: 一貫して高品質な結果の提供を保証するために、厳格な QC 要件を実装しています。
データ量(X) | 濃度 (qPCR/nM) | 音量 |
X ≤ 50GB | ≧ 2nM | 20μl以上 |
50GB ≤ X < 100GB | ≧ 3nM | 20μl以上 |
X ≥ 100 GB | ≧ 4 nM | 20μl以上 |
プラットホーム | 濃度 (qPCR/nM) | 音量 |
ハイシーク エックス テン | ≧ 2nM | 20μl以上 |
ノバシーク 6000 SP | ≧ 1nM | 25μl以上 |
ノバシーク 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | 25μl以上 |
ノバシーク X | ≥ 1.5 nM | 25μl以上 |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | 25μl以上 |
濃度と総量に加えて、適切なピークパターンも必要です。
ライブラリーの品質に関するレポートは、シーケンス、ライブラリー量の評価、および断片化の前に提供されます。
表 1. シーケンス データの統計。
サンプルID | BMKID | 生の読み取り | 生データ (bp) | クリーンリード (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
図 1. 各サンプルのリードに沿った品質分布
図 2. 基本コンテンツの配布
図 3. シーケンスデータ内の読み取り内容の分布