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条形バナー-03

製品

クロマチン免疫沈降シーケンス (ChIP-seq)

ChIP-Seq は、ヒストン修飾、転写因子、その他の DNA 関連タンパク質の DNA ターゲットのゲノムワイドなプロファイリングを提供します。これは、特定のタンパク質-DNA 複合体を回収するクロマチン免疫沈降 (ChIP) の選択性と、回収された DNA のハイスループットシーケンシングのための次世代シーケンシング (NGS) の能力を組み合わせています。さらに、タンパク質-DNA 複合体は生きた細胞から回収されるため、異なる種類の細胞や組織、または異なる条件下で結合部位を比較することができます。応用範囲は、転写制御から発生経路、疾患メカニズムなどに及びます。

プラットフォーム: Illumina NovaSeq プラットフォーム


サービス内容

バイオインフォマティクス

デモの結果

サービスのメリット

● プラットフォーム: Illumina NovaSeq プラットフォーム、PE150

● ライブラリの種類: 100-500 bp インサート DNA ライブラリ (ピーク分布による)

● シーケンス戦略: ペアエンド 150 bp

● 推奨データ出力: 6 Gb の生データ/サンプル。

サンプル要件

DNA量: ≥ 70 ng、メインピーク100~500 bp

サンプル量: ≥ 10 μl

OD260/280 = 1.8 ~ 2.0 (分解または RNA 汚染なし)

実験的なワークフロー

写真1

サービスのワークフロー

サンプル納品

サンプル納品

ライブラリの準備

図書館の建設

シーケンス

シーケンス

データ分析

データ分析

アフターサービス

アフターサービス


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  • 表观-01

    1. ピーク濃縮度分布

    公式サイト図1

     

    2. 微分ピークの MA プロット

    公式サイト図2

     

    3.KEGG アノテーション

    官網図3

     

    4.GOの分類

    官網図4

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