RNAs קטנים הם סוג של RNA קצר שאינו מקודד באורך ממוצע של 18-30 nt, כולל miRNA, siRNA ו-piRNA.RNAs קטנים אלו דווחו באופן מסיבי כמעורבים בתהליכים ביולוגיים שונים כגון פירוק mRNA, עיכוב תרגום, יצירת הטרוכרומטין וכו'. ניתוח רצף SmallRNA יושם באופן נרחב במחקרים על התפתחות בעלי חיים/צמחים, מחלות, וירוסים וכו'. RNA קטן פלטפורמת ניתוח רצף מורכבת מניתוח סטנדרטי וכריית נתונים מתקדמת.על בסיס נתוני RNA-seq, ניתוח סטנדרטי יכול להשיג זיהוי וחיזוי מירנא, חיזוי גן יעד של miRNA, ביאור וניתוח ביטוי.ניתוח מתקדם מאפשר חיפוש וחילוץ מירנא מותאמים אישית, יצירת דיאגרמות Venn, בניית רשתות מירנה וגני יעד.