מוצרים

רצף RNA חד גרעיני

ההתקדמות בלכידת תא בודד וטכניקת בניית ספרייה בודדת בשילוב עם רצף תפוקה גבוהה מאפשרת מחקרי ביטוי גנים על בסיס תא לתא.הוא מאפשר ניתוח מערכת מעמיק ומלא יותר על אוכלוסיות תאים מורכבות, שבהן הוא נמנע במידה רבה ממיסוך של ההטרוגניות שלהם על ידי לקיחת ממוצע של כל התאים.

עם זאת, תאים מסוימים אינם מתאימים להפוך להשעיה חד-תאית, ולכן יש צורך בשיטות הכנת דגימות אחרות - יש צורך במיצוי גרעין מרקמות, כלומר, גרעין מופק ישירות מרקמות או מתא ומוכן לתרחיף חד-גרעיני עבור יחיד- רצף תאים.

BMK מספקת שירות רצף RNA חד-תא מבוסס 10× Genomics ChromiumTM.שירות זה נמצא בשימוש נרחב במחקרים על מחקרים הקשורים למחלות, כגון התמיינות תאי חיסון, הטרוגניות גידול, התפתחות רקמות וכו'.

שבב תעתיק מרחבי: 10× Genomics

פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq

צור קשר

פרטי שירות

ביואינפורמטיקה

תוצאות הדגמה

עקרון טכני

בידוד הגרעינים מושג על ידי 10× Genomics ChromiumTM, המורכבת ממערכת מיקרופלואידיקה בעלת שמונה ערוצים עם מעברים כפולים.במערכת זו, חרוזי ג'ל עם ברקודים ופריימר, אנזימים וגרעין בודד מכוסים בטיפות שמן בגודל ננוליטר, מה שיוצר חרוז ג'ל בתחליב (GEM).לאחר היווצרות GEM, תמוגה תאים ושחרור ברקודים מבוצעים בכל GEM.mRNA משועתקים לאחור למולקולות cDNA עם ברקודים 10× ו-UMI, אשר כפופות עוד יותר לבניית ספריית רצף סטנדרטית.

רקמה לא מתאימה להכנת תרחיף תא בודד

תא / רקמה	סיבה
רקמה קפואה לא טרייה	לא ניתן להשיג ארגונים טריים או שנשמרו זמן רב
תא שריר, מגהקריוציט, שומן...	קוטר התא גדול מכדי להיכנס למכשיר
כָּבֵד…	שביר מכדי לשבור, לא מסוגל להבחין בין תאים בודדים
תא נוירונים, מוח...	רגיש יותר, קל ללחץ, ישנה את תוצאות הרצף
לבלב, בלוטת התריס…	עשיר באנזימים אנדוגניים, המשפיעים על ייצור תרחיף תא בודד

גרעין בודד לעומת תא יחיד

גרעין יחיד	תא בודד
קוטר תא בלתי מוגבל	קוטר התא: 10-40 מיקרומטר
החומר יכול להיות רקמה קפואה	החומר חייב להיות רקמה טרייה
מתח נמוך של תאים קפואים	טיפול באנזימים עלול לגרום לתגובת מתח בתאים
אין צורך להסיר תאי דם אדומים	יש להסיר תאי דם אדומים
גרעיני מבטא מידע ביולוגי	התא כולו מבטא מידע ביולוגי