BMKCloud Log in
条形באנר-03

מוצרים

רצף RNA פרוקריוטי

רצף RNA פרוקריוטי משתמש ברצף הדור הבא (NGS) כדי לחשוף את הנוכחות והכמות של RNA ברגע נתון, על ידי ניתוח התעתיק הסלולרי המשתנה.רצף ה-RNA הפרוקריוטי של החברה שלנו, מכוון במיוחד לפרוקריוטים עם גנום התייחסות, מספק לך פרופיל תעתיק, ניתוח מבנה גנים וכו'. הוא יושם באופן נרחב למחקר מדעי בסיסי, מחקר ופיתוח תרופות ועוד.

פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq


פרטי שירות

מפרט שירות

פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq, PE150

סוג ספרייה: 350bp insert cDNA ספריית (תלוי בהפצה שיא)

אסטרטגיית רצף: Paired-End 150 bp

כמות נתונים מומלצת: 2 Gb נתונים גולמיים/דגימה

ביואינפורמטיקה

(1) בקרת איכות רצף הנתונים: התפלגות נוקלאוטידים, התפלגות איכות הבסיס, הערכת יחס rRNA;

(2) ניתוח יישור רצף: נתונים סטטיסטיים של תוצאות יישור, רוויה של רצף, כיסוי של רצף;

(3) ביאור גנום התייחסות (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) ניתוח ביטוי: התפלגות ביטוי (עם שתי דגימות או יותר), ניתוח ביטוי בין דגימות (ניתוח וון, ניתוח מתאם, ניתוח PCA);

(5) ניתוח ביטוי דיפרנציאלי (עם שתי דגימות או יותר);

(6) ניתוח מערכי גנים: ניתוח Venn, ניתוח אשכולות, ניתוח ביאור פונקציות (COG, GO, KEGG), ניתוח העשרה של פונקציות (GO, KEGG), גרף אקורדי העשרת פונקציות, ניתוח Ipath;

(7) ניתוח sRNA: חיזוי sRNA, ביאור sRNA (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), חיזוי מבנה משני של sRNA, חיזוי גן יעד של sRNA;

(8) ניתוח מבנה תמלול: ניתוח אופרונים, חיזוי אתרי התחלה וסיום של תמלול, ביאור וניתוח UTR, חיזוי רצף מקדם, ניתוח SNP/InDel (ביאור SNP/InDel, התפלגות אזורית SNP/InDel, סטטיסטיקות SNP).

זרימת עבודה בשירות

משלוח לדוגמא

משלוח לדוגמא

הכנה לספרייה

בניית ספרייה

רצף

רצף

ניתוח נתונים

ניתוח נתונים

שירותים לאחר מכירה

שירותים לאחר המכירה


  • קודם:
  • הַבָּא:

  • קבל ציטוט

    כתבו כאן את הודעתכם ושלחו אותה אלינו

    שלח את הודעתך אלינו: