-
רצף RNA חד גרעיני
ההתקדמות בלכידת תא בודד וטכניקת בניית ספרייה בודדת בשילוב עם רצף תפוקה גבוהה מאפשרת מחקרי ביטוי גנים על בסיס תא לתא.הוא מאפשר ניתוח מערכת מעמיק ומלא יותר על אוכלוסיות תאים מורכבות, שבהן הוא נמנע במידה רבה ממיסוך של ההטרוגניות שלהם על ידי לקיחת ממוצע של כל התאים.
עם זאת, תאים מסוימים אינם מתאימים להפוך להשעיה חד-תאית, ולכן יש צורך בשיטות הכנת דגימות אחרות - יש צורך במיצוי גרעין מרקמות, כלומר, גרעין מופק ישירות מרקמות או מתא ומוכן לתרחיף חד-גרעיני עבור יחיד- רצף תאים.
BMK מספקת שירות רצף RNA חד-תא מבוסס 10× Genomics ChromiumTM.שירות זה נמצא בשימוש נרחב במחקרים על מחקרים הקשורים למחלות, כגון התמיינות תאי חיסון, הטרוגניות גידול, התפתחות רקמות וכו'.
שבב תעתיק מרחבי: 10× Genomics
פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq
-
BMKMANU S1000 Transcriptome מרחבי
תעתיק מרחבי עומד בחזית החדשנות המדעית, ומאפשרת לחוקרים להתעמק בדפוסי ביטוי גנים מורכבים בתוך רקמות תוך שמירה על ההקשר המרחבי שלהן.בין פלטפורמות שונות, BMKGene פיתחה את שבב BMKManu S1000 Spatial Transcriptome, המתגאה ב-רזולוציה משופרתשל 5µM, מגיע לטווח התת-תאי, ומאפשרהגדרות רזולוציה מרובת רמות.שבב S1000, הכולל כ-2 מיליון נקודות, משתמש במיקרו-בארות בשכבות חרוזים עמוסים בבדיקות לכידה מקודדות מרחביות.ספריית cDNA, מועשרת בברקודים מרחביים, מוכנה משבב S1000 ולאחר מכן רצף בפלטפורמת Illumina NovaSeq.השילוב של דגימות ברקוד מרחביות ו-UMIs מבטיח את הדיוק והספציפיות של הנתונים שנוצרו.התכונה הייחודית של שבב BMKManu S1000 נעוצה ברבסטיות שלו, ומציעה הגדרות רזולוציה מרובת רמות שניתן לכוונן עדין לרקמות ולרמות פירוט שונות.יכולת הסתגלות זו מציבה את השבב כבחירה יוצאת מן הכלל למחקרי תעתיק מרחביים מגוונים, ומבטיחה צבירת מרחב מדויקת עם מינימום רעש.
באמצעות שבב BMKManu S1000 וטכנולוגיות תעתיק מרחביות אחרות, חוקרים יכולים לקבל הבנה טובה יותר של הארגון המרחבי של תאים ואת האינטראקציות המולקולריות המורכבות המתרחשות בתוך רקמות, ולספק תובנות חשובות לאין ערוך לגבי המנגנונים העומדים בבסיס תהליכים ביולוגיים במגוון רחב של תחומים, כולל אונקולוגיה, מדעי המוח, ביולוגיה התפתחותית, אימונולוגיה ומחקרים בוטניים.
פלטפורמה: שבב BMKManu S1000 ו-Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Transcriptome מרחבי
Transcriptomics מרחבי היא טכנולוגיה חדשנית המאפשרת לחוקרים לחקור דפוסי ביטוי גנים בתוך רקמות תוך שמירה על ההקשר המרחבי שלהן.פלטפורמה חזקה אחת בתחום זה היא 10x Genomics Visium יחד עם רצף Illumina.העיקרון של 10X Visium טמון על שבב מיוחד עם אזור לכידה ייעודי שבו ממוקמים קטעי רקמה.אזור לכידה זה מכיל כתמים עם ברקוד, כל אחד מהם מתאים למיקום מרחבי ייחודי בתוך הרקמה.לאחר מכן, מולקולות ה-RNA שנלכדו מהרקמה מסומנות במזהים מולקולריים ייחודיים (UMI) במהלך תהליך השעתוק ההפוך.נקודות ברקוד ו-UMI אלו מאפשרים מיפוי מרחבי וכימות מדויק של ביטוי גנים ברזולוציה של תא בודד.השילוב של דגימות ברקוד מרחביות ו-UMIs מבטיח את הדיוק והספציפיות של הנתונים שנוצרו.באמצעות טכנולוגיית Transcriptomics מרחבית זו, החוקרים יכולים להשיג הבנה מעמיקה יותר של הארגון המרחבי של תאים ושל האינטראקציות המולקולריות המורכבות המתרחשות בתוך רקמות, ולהציע תובנות חשובות לאין ערוך לגבי המנגנונים העומדים בבסיס תהליכים ביולוגיים בתחומים רבים, כולל אונקולוגיה, מדעי המוח, ביולוגיה התפתחותית, אימונולוגיה , ומחקרים בוטניים.
פלטפורמה: 10X Genomics Visium ו- Illumina NovaSeq
